MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldisphaera lagunensis DSM 15908 chromosome

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019791	CTAAAT	2	12	4841	4852	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019791	AAAATT	2	12	32972	32983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019791	ATTTTA	2	12	38907	38918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019791	AGTATT	2	12	51386	51397	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019791	AAAAAT	2	12	57429	57440	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019791	TATTAA	2	12	68193	68204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019791	TTATAA	2	12	72039	72050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019791	TAAATA	2	12	79573	79584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019791	TAATCA	2	12	91528	91539	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019791	ATATTA	2	12	117730	117741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019791	ACTTTT	2	12	138156	138167	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019791	TATTAA	2	12	142678	142689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019791	TTCTTT	2	12	146504	146515	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019791	ACATAA	2	12	148150	148161	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019791	TTATAT	2	12	149392	149403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019791	ATTTTT	2	12	150762	150773	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019791	TCATTT	2	12	151904	151915	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019791	GATGAA	2	12	172644	172655	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019791	TATAAA	2	12	184872	184883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019791	ATTTGG	2	12	191427	191438	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019791	TAATTA	2	12	192496	192507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019791	TTAAAT	2	12	208014	208025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019791	AGAAAA	2	12	208634	208645	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019791	ATTTTA	2	12	211680	211691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019791	TAATTT	2	12	212490	212501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019791	TTTTAT	2	12	282624	282635	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019791	TTTTAT	2	12	286011	286022	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019791	TATTAA	2	12	288784	288795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019791	TAAATC	2	12	298774	298785	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019791	TAATCA	2	12	306398	306409	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019791	TAAAAT	2	12	309336	309347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019791	TTCTCA	2	12	313437	313448	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019791	TTTAAA	2	12	336750	336761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019791	ATTATA	2	12	344926	344937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019791	TCATAT	2	12	359530	359541	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019791	ATAAAT	2	12	361434	361445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019791	ATCTAT	2	12	393910	393921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019791	AATTTT	2	12	401019	401030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019791	TACCAA	2	12	401845	401856	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019791	TTAAAA	2	12	403451	403462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019791	CTTTTC	2	12	403931	403942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019791	TTTTAA	2	12	406737	406748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019791	TAGATA	2	12	444186	444197	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019791	ATAAAT	2	12	444826	444837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019791	AAAATT	2	12	445467	445478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019791	TTTAAA	2	12	455348	455359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019791	ATTTTT	2	12	499743	499754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019791	AAATTA	2	12	500782	500793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019791	AAAATT	2	12	517768	517779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019791	TTTTTA	2	12	524972	524983	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019791	TTTTTA	2	12	526072	526083	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019791	TAAAAA	2	12	541497	541508	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019791	TAATTT	2	12	556646	556657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019791	AATGAA	2	12	556700	556711	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019791	ATGTAA	2	12	558691	558702	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019791	TTAAAT	2	12	558707	558718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019791	AAATTT	2	12	569997	570008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019791	AAATTA	2	12	577512	577523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019791	ATTTAA	2	12	577570	577581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019791	TTTTAG	2	12	602065	602076	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019791	TAAGGA	2	12	602089	602100	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019791	CAGATA	2	12	618880	618891	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_019791	ATAAGG	2	12	618893	618904	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019791	ATTTTT	2	12	625696	625707	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019791	AGTGAG	2	12	644069	644080	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019791	CGTTTC	2	12	646152	646163	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019791	TTTCCC	2	12	663146	663157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019791	TATAGC	2	12	666563	666574	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019791	ATTAAT	2	12	671909	671920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019791	ATTTTT	2	12	672136	672147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019791	AATTTT	2	12	675329	675340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019791	TATAAT	2	12	719779	719790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019791	ATTTTA	2	12	730924	730935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019791	ATTTTT	2	12	735463	735474	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019791	AATTAG	2	12	735514	735525	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019791	TATGTG	2	12	752830	752841	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019791	ATATAA	2	12	769337	769348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019791	TATTTT	2	12	778784	778795	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019791	ATTTTT	2	12	799848	799859	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019791	ATTAAT	2	12	817314	817325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019791	TATAAA	2	12	849504	849515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019791	TTTTTA	2	12	856868	856879	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019791	TTATAT	2	12	868566	868577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019791	ATTAAT	2	12	876933	876944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019791	TATGCA	2	12	907378	907389	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_019791	AATTTT	2	12	907468	907479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019791	TATCTT	2	12	907687	907698	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_019791	CCAGTA	2	12	908055	908066	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019791	ACATCA	2	12	911799	911810	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019791	CTTATC	2	12	912054	912065	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019791	AAATTT	2	12	916325	916336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019791	TAATAT	2	12	923349	923360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019791	AATTTT	2	12	928698	928709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019791	ATTTTT	2	12	929884	929895	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019791	GATAAG	2	12	949844	949855	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019791	TAAAAA	2	12	954653	954664	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019791	ATTCTG	2	12	957346	957357	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_019791	TTGAAA	2	12	966016	966027	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019791	TATTAA	2	12	966129	966140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019791	TTTAAC	2	12	968926	968937	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019791	ATTAAA	2	12	973532	973543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019791	CCTTCA	2	12	975481	975492	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019791	AAACTT	2	12	975968	975979	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_019791	TAAAAA	2	12	995257	995268	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019791	ATTTTT	3	18	1026504	1026521	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019791	AATTTT	2	12	1040881	1040892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019791	AAAATA	2	12	1076546	1076557	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019791	AATAGG	2	12	1095864	1095875	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019791	TAATTT	2	12	1117225	1117236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019791	TAAATA	2	12	1127425	1127436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019791	AAATAA	2	12	1135424	1135435	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019791	TTAATA	2	12	1146656	1146667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019791	TATATT	2	12	1149540	1149551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019791	AAATTT	2	12	1154118	1154129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019791	AATTAA	2	12	1163797	1163808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019791	AAGATA	2	12	1163910	1163921	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019791	TTATAT	2	12	1168290	1168301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019791	TAGCTT	2	12	1199895	1199906	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_019791	TAAAAA	2	12	1229614	1229625	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019791	AAATTT	2	12	1235627	1235638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019791	TATAAT	2	12	1247810	1247821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019791	TTAAAA	2	12	1259940	1259951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019791	ATTTAA	2	12	1269068	1269079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019791	TTAAAT	2	12	1269100	1269111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019791	AATTTA	2	12	1283078	1283089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019791	ATAAAT	2	12	1300012	1300023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019791	TAGAAT	2	12	1304882	1304893	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019791	ATTTTT	2	12	1314150	1314161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019791	TTAAAA	2	12	1320571	1320582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019791	ATAAAA	2	12	1351123	1351134	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019791	TCAAAA	2	12	1369170	1369181	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_019791	TAAGAG	2	12	1370347	1370358	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019791	AAGAAT	2	12	1373279	1373290	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019791	ATCATA	2	12	1383419	1383430	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_019791	CCCGGC	2	12	1421183	1421194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_019791	TTATAT	2	12	1424844	1424855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019791	TATAGG	2	12	1425955	1425966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019791	TAAATT	2	12	1457675	1457686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019791	TTTTAA	2	12	1536748	1536759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019791	TTAAAA	2	12	1542633	1542644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.