MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanobacterium stanieri PCC 7202 chromosome

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019778	AGTTAC	2	12	11051	11062	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019778	TAAATA	2	12	34143	34154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019778	GTTGAT	2	12	39826	39837	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019778	ATTAAT	2	12	42148	42159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019778	AACTCT	2	12	49214	49225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019778	CCTTTT	2	12	49318	49329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019778	GTTGAT	2	12	61439	61450	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019778	TATAAA	2	12	82139	82150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019778	TAAGAA	2	12	100361	100372	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019778	AAATAG	2	12	105119	105130	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019778	TTTAAT	2	12	117603	117614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019778	TAATAT	2	12	120230	120241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019778	AAAAGC	2	12	126274	126285	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019778	ATTAAA	2	12	149970	149981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019778	CTTTAT	2	12	151949	151960	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019778	TATCAA	2	12	181547	181558	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019778	GGTTTT	2	12	194419	194430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019778	TAAATA	2	12	214853	214864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019778	TTAATT	2	12	224154	224165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019778	TAGTAA	2	12	227837	227848	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019778	AACAAA	2	12	236235	236246	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_019778	AAACTT	2	12	270769	270780	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019778	AAGCAA	2	12	318764	318775	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019778	AACTTT	2	12	359811	359822	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_019778	TATATT	2	12	374759	374770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019778	GTTAAA	2	12	388678	388689	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019778	ACCCTT	2	12	414524	414535	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019778	TAAGCC	2	12	434582	434593	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019778	AGAAAC	2	12	492136	492147	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019778	GAAAAT	2	12	526257	526268	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019778	GGTTTT	2	12	527860	527871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019778	AATTTG	2	12	531971	531982	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019778	GTCATT	2	12	543790	543801	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019778	TACTTT	2	12	568425	568436	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_019778	TCTAAT	2	12	594912	594923	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019778	AAATAA	2	12	595778	595789	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019778	TTTACC	2	12	612871	612882	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019778	AACTGG	2	12	616146	616157	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_019778	ACTATA	2	12	616662	616673	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_019778	ACTTTG	2	12	647691	647702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019778	GTTTAA	2	12	652692	652703	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019778	TTATAA	2	12	654919	654930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019778	TTGAAT	2	12	655655	655666	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019778	TTCATT	2	12	659295	659306	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019778	TATTTA	2	12	674611	674622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019778	ACTATA	2	12	704571	704582	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019778	GAGCTT	2	12	722675	722686	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_019778	TTTCTA	2	12	732841	732852	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019778	ACAAGA	2	12	750164	750175	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019778	GGAGTT	2	12	754155	754166	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019778	TTTATA	2	12	767881	767892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019778	TGATGG	2	12	796482	796493	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019778	TTGTTA	2	12	805685	805696	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019778	CTTTTG	2	12	812882	812893	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019778	TGATTT	2	12	826060	826071	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019778	TTATCA	2	12	830046	830057	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_019778	GATCGA	2	12	845667	845678	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019778	TTTATT	2	12	850301	850312	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019778	TCTTTG	2	12	851110	851121	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019778	ATTTTA	2	12	854070	854081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019778	TAATTG	2	12	879814	879825	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019778	ATCCCT	2	12	915911	915922	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019778	AGATTC	2	12	919686	919697	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019778	ATTTTT	2	12	921371	921382	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019778	TTTTGA	2	12	976633	976644	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019778	AAAACA	2	12	987991	988002	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019778	ATTATC	2	12	1050724	1050735	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_019778	TTTCCC	2	12	1053206	1053217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019778	CAAGGG	2	12	1072265	1072276	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_019778	TTGAGT	2	12	1079889	1079900	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019778	TTTATT	2	12	1084913	1084924	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019778	TAAAAT	2	12	1121773	1121784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019778	ATTTAT	2	12	1123269	1123280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019778	TTTTCA	2	12	1124054	1124065	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019778	TCTTTT	2	12	1125076	1125087	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019778	CCCTAT	2	12	1134332	1134343	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019778	CCCTTA	2	12	1142869	1142880	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019778	TTATAA	2	12	1161979	1161990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019778	TTATTG	2	12	1177281	1177292	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019778	AATTAA	2	12	1216913	1216924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019778	ATTTTT	2	12	1221534	1221545	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019778	TTATAT	2	12	1250900	1250911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019778	TAAAAC	2	12	1251245	1251256	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_019778	CATCTT	2	12	1251879	1251890	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019778	TTGATT	2	12	1259354	1259365	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019778	CCCTCT	2	12	1352747	1352758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_019778	TTATTG	2	12	1370288	1370299	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019778	AATAAA	2	12	1449378	1449389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019778	ATTTTT	2	12	1452526	1452537	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019778	CCATAA	2	12	1517530	1517541	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019778	GATTAA	2	12	1579966	1579977	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019778	AAGAAA	2	12	1602829	1602840	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019778	AAAACT	2	12	1602861	1602872	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_019778	CAAAAA	2	12	1605825	1605836	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_019778	TTCATT	2	12	1622733	1622744	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_019778	TACATT	2	12	1628513	1628524	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_019778	ACAATA	2	12	1657187	1657198	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_019778	TAAAAT	2	12	1687916	1687927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019778	CTTTTA	2	12	1757858	1757869	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_019778	AGAATA	2	12	1768196	1768207	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019778	AAAAGT	2	12	1844708	1844719	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019778	ACTGAA	2	12	1845562	1845573	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_019778	AATGAT	2	12	1851357	1851368	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019778	ATCTAA	2	12	1853397	1853408	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_019778	ACCGCC	2	12	1881659	1881670	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_019778	CATTAT	2	12	1898692	1898703	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_019778	CTTACC	2	12	1909027	1909038	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019778	CCTCAT	2	12	1924857	1924868	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019778	TAAAGA	2	12	1946008	1946019	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019778	TTATTT	2	12	1985812	1985823	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019778	CTATAT	2	12	1986004	1986015	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_019778	AATAAA	2	12	2004477	2004488	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019778	TTAAAA	2	12	2007442	2007453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019778	AAAAAC	2	12	2011771	2011782	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_019778	ATTATA	2	12	2025891	2025902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019778	TAAAAA	2	12	2081818	2081829	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019778	GATAAA	2	12	2093909	2093920	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019778	TTTTAT	2	12	2101863	2101874	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019778	TAAAAA	2	12	2139347	2139358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019778	CATAAA	2	12	2139709	2139720	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_019778	ATATTT	2	12	2162647	2162658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019778	ACTTGA	2	12	2214445	2214456	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_019778	CCAACC	2	12	2215670	2215681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_019778	TAATTA	2	12	2220776	2220787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019778	ACTTGA	2	12	2222341	2222352	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_019778	ATAAAA	2	12	2237738	2237749	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019778	TTTTGT	2	12	2263474	2263485	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019778	ATTGGG	2	12	2341916	2341927	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.