MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019777	AAT	2	6	7	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019777	TAT	2	6	237	242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019777	ATT	2	6	1575	1580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019777	TTA	2	6	2023	2028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019777	GCG	2	6	2103	2108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019777	CTT	2	6	2163	2168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019777	TAA	2	6	2580	2585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019777	TAA	2	6	2587	2592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019777	ATT	2	6	6000	6005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019777	ATC	2	6	6014	6019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019777	ATT	2	6	6155	6160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019777	TAA	2	6	6182	6187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019777	TAA	2	6	6223	6228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019777	ATA	2	6	6254	6259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019777	TAA	2	6	8972	8977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019777	TCC	2	6	10595	10600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_019777	CCA	2	6	10729	10734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_019777	TCA	2	6	10784	10789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019777	TAA	2	6	10864	10869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019777	TCA	2	6	10895	10900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019777	TAT	2	6	10917	10922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019777	AAT	2	6	10924	10929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019777	CTC	2	6	10968	10973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_019777	TAA	2	6	11041	11046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019777	ATA	2	6	11158	11163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019777	TTG	2	6	11176	11181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019777	TAA	3	9	11245	11253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019777	AAT	2	6	11341	11346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019777	AAT	2	6	11841	11846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019777	AAT	2	6	12947	12952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019777	TAA	2	6	13798	13803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019777	TCG	2	6	14099	14104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019777	ATT	2	6	14110	14115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019777	ATC	2	6	14519	14524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019777	GCG	2	6	14528	14533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019777	CCA	2	6	14618	14623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_019777	GTC	3	9	14838	14846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019777	TAT	2	6	14906	14911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019777	CTT	2	6	14969	14974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019777	GGA	2	6	14985	14990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019777	ACT	2	6	15000	15005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019777	TAG	2	6	15039	15044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019777	ATA	2	6	15056	15061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019777	GAT	2	6	15130	15135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019777	TAT	2	6	16197	16202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019777	ATC	2	6	16207	16212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019777	ATA	2	6	16256	16261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019777	CTA	2	6	16277	16282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019777	TAT	2	6	17236	17241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019777	ATT	2	6	18687	18692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019777	GTT	2	6	19082	19087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019777	ATG	2	6	19169	19174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019777	GTA	2	6	19220	19225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019777	AAT	2	6	19302	19307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019777	ACT	2	6	19334	19339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019777	TGA	2	6	19461	19466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019777	TTA	2	6	19477	19482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019777	GTT	2	6	19515	19520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019777	GTT	2	6	19532	19537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019777	ATT	2	6	20231	20236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019777	ATA	2	6	22437	22442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019777	TAT	2	6	22445	22450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019777	AGT	2	6	22461	22466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019777	ATT	2	6	25716	25721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019777	TGT	2	6	27800	27805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019777	GAA	2	6	27834	27839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019777	TCT	2	6	27850	27855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019777	TAT	2	6	27868	27873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019777	ATT	2	6	27962	27967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019777	ATA	2	6	28618	28623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019777	TAA	2	6	29382	29387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019777	ATT	2	6	31173	31178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019777	ATT	2	6	32620	32625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019777	ATT	2	6	32782	32787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019777	TGG	2	6	33001	33006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019777	CTC	2	6	33168	33173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_019777	AAG	2	6	33596	33601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019777	TAC	2	6	33758	33763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019777	CAA	2	6	33981	33986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019777	AAC	2	6	34039	34044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019777	TGT	2	6	34129	34134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019777	AGC	2	6	34301	34306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019777	TCT	2	6	34348	34353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019777	TAA	2	6	34440	34445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019777	TCT	2	6	34508	34513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019777	TAG	2	6	34730	34735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019777	CTC	2	6	34801	34806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_019777	GAG	2	6	34811	34816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019777	ATT	2	6	34822	34827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019777	GTC	2	6	35095	35100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019777	AAG	2	6	35331	35336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019777	TAC	2	6	35500	35505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019777	TAC	2	6	35582	35587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019777	GTT	2	6	35643	35648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019777	ATC	2	6	35717	35722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019777	TAT	3	9	35727	35735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019777	AAG	2	6	37218	37223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019777	TAG	2	6	42231	42236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019777	TTA	2	6	43566	43571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019777	TTA	2	6	43577	43582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019777	TGT	2	6	45547	45552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019777	ATA	2	6	49576	49581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019777	TGT	2	6	50684	50689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019777	AAT	2	6	50762	50767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019777	ATC	2	6	52143	52148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019777	ATT	2	6	52448	52453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019777	TAT	2	6	53839	53844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019777	AAT	2	6	53870	53875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019777	TGT	2	6	53912	53917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019777	AAT	2	6	53929	53934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019777	ATC	2	6	54696	54701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019777	GTT	2	6	55155	55160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019777	TGT	2	6	55241	55246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019777	ATG	2	6	55518	55523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019777	AAT	2	6	56079	56084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019777	TTA	2	6	56090	56095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019777	AAG	2	6	56279	56284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019777	AAG	2	6	56351	56356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019777	ATT	2	6	56398	56403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019777	ATT	2	6	56418	56423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019777	TGT	2	6	56498	56503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019777	AAT	2	6	56960	56965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019777	TTA	2	6	56977	56982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019777	ATT	2	6	57243	57248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019777	AGA	2	6	57264	57269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019777	TAA	2	6	57279	57284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019777	ATT	2	6	57540	57545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019777	TGA	2	6	57645	57650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019777	TGT	2	6	57651	57656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019777	TTA	2	6	57986	57991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019777	TTG	2	6	59499	59504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019777	ATG	2	6	59505	59510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019777	TAT	2	6	60389	60394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019777	ATT	2	6	60436	60441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019777	TAA	2	6	60442	60447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019777	TTC	2	6	61480	61485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019777	TTA	2	6	61491	61496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019777	TTG	2	6	61943	61948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019777	AAG	2	6	61965	61970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.