MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417

Total Repeats: 4564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019757	ATTA	2	8	1530	1537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019757	AAAT	2	8	5815	5822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019757	ACCA	2	8	6790	6797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019757	ACTT	2	8	6954	6961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019757	AATA	2	8	7121	7128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019757	ACTC	2	8	9402	9409	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019757	ACCC	2	8	19738	19745	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_019757	TCAA	2	8	21249	21256	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019757	CTTG	2	8	23245	23252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019757	TTAA	2	8	26669	26676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019757	TATG	2	8	26756	26763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019757	ATCA	2	8	27246	27253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019757	TCCA	2	8	27438	27445	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019757	CGAT	2	8	27453	27460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019757	CTTA	2	8	27531	27538	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019757	AAAG	2	8	27548	27555	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019757	ATAA	2	8	28423	28430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019757	ATTA	2	8	28596	28603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019757	CCAA	2	8	28604	28611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019757	TGAT	2	8	29108	29115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019757	TTCA	2	8	29302	29309	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019757	GCAA	2	8	29331	29338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019757	TCCC	2	8	32210	32217	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_019757	GTTG	2	8	32305	32312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019757	TGAT	2	8	33814	33821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019757	TGCA	2	8	39245	39252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019757	GTTT	2	8	40804	40811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019757	TAAA	2	8	40890	40897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019757	GGTG	2	8	41065	41072	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019757	TAGG	2	8	44082	44089	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019757	GAAG	2	8	44169	44176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019757	ATAA	2	8	44280	44287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019757	CCTG	2	8	46689	46696	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019757	TACT	2	8	46991	46998	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019757	AATT	2	8	50959	50966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019757	AATT	2	8	51028	51035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019757	TTAG	2	8	53130	53137	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019757	TACT	2	8	53164	53171	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019757	ATTT	2	8	53288	53295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019757	TTAT	2	8	53392	53399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019757	TAAT	2	8	53436	53443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019757	ACAA	2	8	55096	55103	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019757	AGTT	2	8	55613	55620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019757	TTTG	2	8	56842	56849	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019757	GTTA	2	8	56993	57000	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019757	ATAA	2	8	57274	57281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019757	ATGC	2	8	57437	57444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019757	GTTA	2	8	60689	60696	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019757	AAAC	2	8	60734	60741	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019757	GAAG	2	8	67889	67896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019757	TCCA	2	8	68101	68108	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019757	GACA	2	8	68413	68420	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019757	ATAA	2	8	69083	69090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019757	CATC	2	8	72885	72892	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019757	AAGA	2	8	73062	73069	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019757	AGAT	2	8	77662	77669	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019757	CTAA	2	8	78473	78480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019757	ATTA	2	8	79376	79383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019757	TTCT	2	8	80277	80284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019757	ATTG	2	8	80312	80319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019757	CCCA	2	8	80438	80445	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_019757	AGTT	2	8	82855	82862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019757	ATCT	2	8	82874	82881	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019757	AGAA	2	8	84968	84975	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019757	GTAG	2	8	84990	84997	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019757	AATT	3	12	85230	85241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019757	TCTT	2	8	85803	85810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019757	TATT	2	8	85982	85989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019757	CTAT	2	8	89324	89331	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019757	TGCT	2	8	89526	89533	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019757	ATAA	2	8	89684	89691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019757	AATC	2	8	89989	89996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019757	ATTT	2	8	90101	90108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019757	ATCT	2	8	90287	90294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019757	AATG	2	8	90465	90472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019757	TAAC	2	8	91865	91872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019757	CTAC	2	8	92080	92087	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019757	CCTA	2	8	92096	92103	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019757	AAAT	2	8	92764	92771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019757	ACTT	2	8	94828	94835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019757	TTAA	2	8	95724	95731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019757	GTCA	2	8	96778	96785	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019757	AAAT	2	8	97406	97413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019757	CCTC	2	8	97527	97534	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_019757	CTTT	2	8	98283	98290	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019757	TTTC	2	8	99059	99066	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019757	TATC	2	8	100477	100484	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019757	AAAG	2	8	100590	100597	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019757	CTAT	2	8	101796	101803	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019757	TGCC	2	8	102490	102497	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019757	GATT	2	8	103688	103695	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019757	TCAA	2	8	103732	103739	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019757	AGCA	2	8	103759	103766	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019757	ACCC	2	8	103768	103775	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_019757	AAAT	2	8	104004	104011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019757	AATT	2	8	106055	106062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019757	TGAG	2	8	106227	106234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019757	TTGC	2	8	106329	106336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019757	ATTT	2	8	106989	106996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019757	TTAC	2	8	107016	107023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019757	GAAT	2	8	108187	108194	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019757	GCCT	2	8	108248	108255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019757	TTTG	2	8	108304	108311	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019757	TTCT	2	8	110228	110235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019757	CCAG	2	8	110423	110430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019757	ATGA	2	8	110451	110458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019757	GGTT	2	8	110659	110666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019757	AAGA	2	8	111644	111651	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019757	ATCA	2	8	112106	112113	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019757	TAAT	2	8	114706	114713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019757	ATTT	2	8	116281	116288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019757	GATT	2	8	116334	116341	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019757	AATC	2	8	116394	116401	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019757	TTTA	2	8	116633	116640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019757	TGCA	2	8	122734	122741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019757	AAAT	2	8	124102	124109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019757	AGAT	2	8	124163	124170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019757	GGGC	2	8	131127	131134	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019757	TATC	2	8	132632	132639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019757	CTTC	2	8	135461	135468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019757	GTTA	2	8	138275	138282	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019757	AAAT	2	8	139073	139080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019757	AGAT	2	8	140815	140822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019757	AGCA	2	8	142071	142078	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019757	GTGG	2	8	144413	144420	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019757	ACCC	2	8	147251	147258	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_019757	GAAA	2	8	147342	147349	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019757	ATTT	2	8	147432	147439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019757	AGTC	2	8	149454	149461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019757	AGTC	2	8	150520	150527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019757	CCAC	2	8	150624	150631	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_019757	GACA	2	8	152355	152362	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019757	CGAC	2	8	152464	152471	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019757	ATTT	2	8	157790	157797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019757	CTAA	2	8	158051	158058	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019757	GAAA	2	8	160193	160200	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019757	TTTG	2	8	166888	166895	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019757	TTGT	2	8	168634	168641	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019757	TGAA	2	8	168790	168797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019757	ACCC	2	8	172979	172986	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_019757	TCAG	2	8	175757	175764	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019757	AATA	2	8	175914	175921	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019757	GCAG	2	8	178409	178416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_019757	ATTT	2	8	180962	180969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019757	TCAA	2	8	183919	183926	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019757	CCAC	2	8	183959	183966	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
147	NC_019757	TTAG	2	8	186731	186738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019757	AATT	2	8	191778	191785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019757	TATT	2	8	191836	191843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019757	TTTC	2	8	191844	191851	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_019757	GATT	2	8	193029	193036	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_019757	TCAA	2	8	199962	199969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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