MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 21033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019753	AAG	2	6	379002	379007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_019753	AGG	2	6	379040	379045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_019753	TTA	2	6	379083	379088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_019753	GCGGG	2	10	380195	380204	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1505	NC_019753	CTG	2	6	380241	380246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_019753	CGC	2	6	380273	380278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_019753	AAT	2	6	380316	380321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_019753	TTTCC	2	10	380743	380752	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1509	NC_019753	TAA	2	6	380805	380810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_019753	GAT	2	6	380845	380850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_019753	GGTG	2	8	380969	380976	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_019753	TGG	3	9	380992	381000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_019753	TCATAG	2	12	381068	381079	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1514	NC_019753	AAC	2	6	381146	381151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_019753	CATC	2	8	381332	381339	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_019753	TTGCCA	2	12	381346	381357	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_019753	TGT	2	6	381383	381388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_019753	AT	3	6	381514	381519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_019753	ATC	2	6	381541	381546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_019753	T	6	6	381565	381570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_019753	TAA	2	6	381589	381594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_019753	TTG	2	6	381604	381609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_019753	CGG	2	6	381640	381645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_019753	CT	3	6	381707	381712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_019753	TA	3	6	381715	381720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_019753	TGT	2	6	381758	381763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_019753	T	7	7	381763	381769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_019753	T	7	7	382175	382181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_019753	ATT	2	6	382186	382191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_019753	GATT	2	8	382198	382205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_019753	GTAG	2	8	382237	382244	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_019753	TTA	2	6	382299	382304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_019753	GTA	2	6	382305	382310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_019753	CAC	2	6	382331	382336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_019753	CTA	2	6	382340	382345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_019753	AGTT	2	8	382354	382361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_019753	TTTG	2	8	383700	383707	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_019753	ATTT	2	8	383725	383732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_019753	ACTA	2	8	383741	383748	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_019753	GTG	2	6	383758	383763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_019753	TA	3	6	383780	383785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_019753	AGT	2	6	383830	383835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_019753	AGTATA	2	12	383881	383892	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_019753	TAT	2	6	383928	383933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_019753	CCG	2	6	383968	383973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_019753	T	6	6	383982	383987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_019753	TAA	2	6	384097	384102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_019753	TAAT	2	8	384154	384161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_019753	TTA	2	6	384184	384189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_019753	TAA	2	6	384251	384256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_019753	CTA	2	6	384264	384269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_019753	TACA	2	8	384283	384290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_019753	TAC	2	6	384387	384392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_019753	TAA	2	6	384422	384427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_019753	T	6	6	384447	384452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_019753	AT	4	8	384462	384469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_019753	TTG	2	6	384530	384535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_019753	TGC	2	6	384536	384541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_019753	ATTT	2	8	385036	385043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_019753	A	6	6	385091	385096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_019753	ATG	2	6	385173	385178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_019753	GTTGC	2	10	385194	385203	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1563	NC_019753	CGG	2	6	385208	385213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_019753	AATG	2	8	385300	385307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_019753	AG	3	6	385324	385329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_019753	TAAA	2	8	385332	385339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_019753	A	6	6	386236	386241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_019753	A	7	7	386296	386302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_019753	AAC	2	6	387928	387933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_019753	TCAA	2	8	387936	387943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_019753	GA	3	6	387948	387953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_019753	T	6	6	387990	387995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_019753	CTTT	2	8	388016	388023	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_019753	TTG	2	6	388706	388711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_019753	CTTA	2	8	390218	390225	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1576	NC_019753	CAG	2	6	390254	390259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1578	NC_019753	TCA	2	6	390295	390300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_019753	TC	3	6	390350	390355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_019753	GGAA	2	8	390411	390418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_019753	CTT	2	6	390434	390439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_019753	CAA	2	6	390457	390462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_019753	A	6	6	390461	390466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_019753	ATA	2	6	390515	390520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_019753	A	6	6	390520	390525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_019753	GATT	2	8	391391	391398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_019753	GTGAG	2	10	391425	391434	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_019753	ACCT	2	8	391590	391597	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_019753	T	6	6	391626	391631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_019753	ATG	2	6	391659	391664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_019753	ATA	2	6	391711	391716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_019753	GCAGT	2	10	391740	391749	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1593	NC_019753	TTA	2	6	391758	391763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_019753	ACA	2	6	391779	391784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1597	NC_019753	TTA	2	6	391866	391871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_019753	T	6	6	391904	391909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_019753	TTAA	2	8	391915	391922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_019753	ATT	2	6	392010	392015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_019753	AAT	2	6	392705	392710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_019753	GTTGC	2	10	393021	393030	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1603	NC_019753	TCA	2	6	393047	393052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_019753	CTT	2	6	393109	393114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_019753	T	6	6	393146	393151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_019753	GTA	2	6	393178	393183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_019753	AGT	2	6	393188	393193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1609	NC_019753	TGT	2	6	393240	393245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_019753	TAT	3	9	393328	393336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_019753	TAA	2	6	393589	393594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_019753	CAT	2	6	393646	393651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_019753	TGC	2	6	393696	393701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_019753	ACT	2	6	393763	393768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1617	NC_019753	CT	3	6	393793	393798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1622	NC_019753	AT	3	6	394378	394383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_019753	T	6	6	394469	394474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_019753	TCAA	2	8	394527	394534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_019753	TTA	2	6	394561	394566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_019753	TAAT	2	8	394594	394601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_019753	A	6	6	394607	394612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_019753	TA	3	6	394688	394693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_019753	GA	3	6	394704	394709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_019753	TAAA	2	8	394731	394738	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_019753	T	7	7	395069	395075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_019753	TTAAT	2	10	395084	395093	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_019753	AC	3	6	395099	395104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_019753	ACTAG	2	10	395133	395142	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1635	NC_019753	CTC	2	6	395195	395200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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