MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 21033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019753	CAG	2	6	240212	240217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_019753	AT	3	6	240807	240812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019753	ATT	2	6	240889	240894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019753	C	6	6	240920	240925	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1005	NC_019753	A	6	6	240945	240950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019753	CTT	2	6	241008	241013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_019753	T	6	6	241012	241017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_019753	A	6	6	242300	242305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_019753	CTG	2	6	242312	242317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_019753	AGT	2	6	242327	242332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019753	CTAAG	2	10	242379	242388	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1012	NC_019753	A	7	7	243143	243149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019753	CATC	2	8	244109	244116	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_019753	C	6	6	244116	244121	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1015	NC_019753	ATT	2	6	244224	244229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_019753	T	6	6	246186	246191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_019753	A	6	6	246208	246213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_019753	A	6	6	246237	246242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_019753	GA	4	8	246264	246271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_019753	CACTG	2	10	246290	246299	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1021	NC_019753	A	6	6	246304	246309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_019753	T	7	7	246312	246318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_019753	CTTAC	2	10	246438	246447	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1024	NC_019753	CAG	2	6	246573	246578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_019753	CTT	2	6	247352	247357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_019753	CAT	3	9	247409	247417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_019753	ATT	2	6	247448	247453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019753	AGT	2	6	247471	247476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_019753	T	6	6	247484	247489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_019753	TAAT	2	8	247503	247510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_019753	A	7	7	247529	247535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_019753	TTA	2	6	247560	247565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019753	ATT	2	6	247598	247603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_019753	T	6	6	248692	248697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_019753	TCTG	2	8	248704	248711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_019753	AT	3	6	248733	248738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_019753	TAAT	2	8	248774	248781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_019753	TAAT	2	8	248784	248791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_019753	TTA	2	6	248804	248809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_019753	GTT	2	6	248871	248876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_019753	CTG	2	6	249470	249475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_019753	A	7	7	249479	249485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019753	ACT	2	6	249492	249497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1045	NC_019753	GCT	2	6	249530	249535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_019753	TAA	2	6	249538	249543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_019753	AAATT	2	10	249552	249561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_019753	TAA	2	6	249588	249593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_019753	AAAAT	2	10	249599	249608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019753	AT	3	6	249607	249612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_019753	T	6	6	249707	249712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019753	AGATA	2	10	249730	249739	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019753	CAG	2	6	250122	250127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_019753	CAG	2	6	250129	250134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_019753	TAG	2	6	250148	250153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_019753	T	6	6	250159	250164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_019753	GTT	2	6	250166	250171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019753	CAA	2	6	250189	250194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_019753	ACA	2	6	251357	251362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_019753	TGT	2	6	252543	252548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019753	TATC	2	8	252610	252617	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_019753	T	7	7	252658	252664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_019753	CAG	2	6	252676	252681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_019753	TGT	2	6	252734	252739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_019753	AGC	2	6	252743	252748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_019753	ACT	2	6	252763	252768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_019753	TTC	4	12	252798	252809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_019753	TTC	2	6	254248	254253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_019753	T	7	7	254258	254264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_019753	CG	3	6	254297	254302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_019753	AAT	2	6	254365	254370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1073	NC_019753	TAA	2	6	255053	255058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1076	NC_019753	GCATA	2	10	255203	255212	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1077	NC_019753	ACA	2	6	255228	255233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_019753	TA	3	6	255251	255256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_019753	CGT	2	6	255293	255298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1084	NC_019753	TCCT	2	8	255853	255860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_019753	TATAAT	2	12	256027	256038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_019753	AG	3	6	256100	256105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_019753	TTCC	2	8	256817	256824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1103	NC_019753	A	8	8	257469	257476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_019753	AT	3	6	257490	257495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_019753	TAAA	2	8	257497	257504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_019753	TCAA	2	8	257519	257526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1110	NC_019753	A	6	6	260433	260438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_019753	AATT	2	8	260557	260564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1113	NC_019753	ATTG	2	8	262548	262555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_019753	AT	3	6	262594	262599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019753	TAAT	2	8	262602	262609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_019753	TTGCA	2	10	262687	262696	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1117	NC_019753	TTAAA	2	10	262740	262749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_019753	TTAC	2	8	262774	262781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_019753	TCA	2	6	262861	262866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1123	NC_019753	CCG	2	6	263019	263024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_019753	ACT	2	6	263044	263049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1129	NC_019753	GA	4	8	263349	263356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_019753	GTT	2	6	263382	263387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_019753	TTG	2	6	263557	263562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_019753	TTG	2	6	263665	263670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1413	NC_019753	T	6	6	327933	327938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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