MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 chromosome

Total Repeats: 21033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019753	ATAG	2	8	1328650	1328657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_019753	T	8	8	1328677	1328684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_019753	CTT	2	6	1328806	1328811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_019753	TAA	2	6	1328855	1328860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_019753	AGT	2	6	1329371	1329376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_019753	AGT	2	6	1329461	1329466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_019753	AAT	2	6	1329468	1329473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_019753	GTT	2	6	1329498	1329503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_019753	TAG	2	6	1329515	1329520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_019753	T	6	6	1330282	1330287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_019753	TA	3	6	1330292	1330297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_019753	TGT	2	6	1330303	1330308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_019753	AAC	2	6	1330316	1330321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_019753	TA	4	8	1330410	1330417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_019753	TAAT	2	8	1330495	1330502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_019753	AATT	2	8	1330939	1330946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_019753	TTTG	2	8	1330947	1330954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_019753	TGA	2	6	1330963	1330968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_019753	GTT	2	6	1331418	1331423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_019753	AT	3	6	1331471	1331476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_019753	CAT	2	6	1331507	1331512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_019753	GA	3	6	1331521	1331526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_019753	TGCT	2	8	1331536	1331543	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6024	NC_019753	ACG	2	6	1331608	1331613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_019753	TCAA	2	8	1331620	1331627	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6026	NC_019753	GAA	2	6	1331656	1331661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_019753	ATG	2	6	1332492	1332497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_019753	TAAAA	2	10	1332530	1332539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_019753	AAT	2	6	1332547	1332552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_019753	CTG	2	6	1333175	1333180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_019753	TA	3	6	1333181	1333186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_019753	TAA	2	6	1333188	1333193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_019753	CCA	2	6	1333227	1333232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_019753	ACTG	2	8	1333849	1333856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6035	NC_019753	TG	3	6	1333855	1333860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_019753	ATT	2	6	1335012	1335017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_019753	ATC	2	6	1335046	1335051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_019753	CA	3	6	1335099	1335104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6039	NC_019753	TAA	2	6	1335119	1335124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_019753	TTA	2	6	1335239	1335244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_019753	GCT	2	6	1337329	1337334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_019753	AGA	2	6	1342980	1342985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_019753	CGT	2	6	1343047	1343052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_019753	GATC	2	8	1343066	1343073	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6045	NC_019753	TAAT	2	8	1343112	1343119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_019753	TTAA	2	8	1343176	1343183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_019753	AAT	2	6	1346178	1346183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_019753	TAA	2	6	1346205	1346210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_019753	TTGGCA	2	12	1346216	1346227	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6050	NC_019753	CAAA	2	8	1347243	1347250	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_019753	TGTA	2	8	1348575	1348582	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_019753	TAT	2	6	1348593	1348598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_019753	GTTG	2	8	1348682	1348689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_019753	T	6	6	1348717	1348722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_019753	ATT	2	6	1348848	1348853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_019753	AATTG	2	10	1348877	1348886	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_019753	AAAT	2	8	1348960	1348967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_019753	TCC	2	6	1349024	1349029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_019753	AT	3	6	1349537	1349542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_019753	AT	3	6	1349547	1349552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_019753	AGA	2	6	1349555	1349560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_019753	TTA	2	6	1349568	1349573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_019753	AGG	2	6	1349611	1349616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_019753	TAC	2	6	1349635	1349640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_019753	TAT	2	6	1350350	1350355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_019753	AAATAT	2	12	1350357	1350368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_019753	ATTA	2	8	1350387	1350394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_019753	TTG	2	6	1350411	1350416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_019753	AACA	2	8	1350481	1350488	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6070	NC_019753	AAT	2	6	1350493	1350498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_019753	TAA	2	6	1350505	1350510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_019753	GTT	2	6	1350573	1350578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_019753	GCG	2	6	1350586	1350591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_019753	TAGT	2	8	1350601	1350608	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_019753	A	6	6	1350633	1350638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_019753	AAAACC	2	12	1350673	1350684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_019753	TTA	2	6	1350710	1350715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_019753	GTTG	2	8	1350733	1350740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_019753	TTTTCA	2	12	1350771	1350782	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6080	NC_019753	ATA	2	6	1350804	1350809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_019753	ACTA	2	8	1350819	1350826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6082	NC_019753	ACC	2	6	1350867	1350872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6083	NC_019753	TTA	2	6	1350912	1350917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_019753	CAAT	2	8	1350962	1350969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6085	NC_019753	A	6	6	1350980	1350985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_019753	TAA	2	6	1351946	1351951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_019753	TACCG	2	10	1351957	1351966	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6088	NC_019753	ATCT	2	8	1351979	1351986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6089	NC_019753	TTAA	2	8	1352011	1352018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_019753	CTG	2	6	1352029	1352034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_019753	TTA	2	6	1352181	1352186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_019753	AAC	2	6	1352194	1352199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_019753	ACGA	2	8	1352272	1352279	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6094	NC_019753	AAGTA	2	10	1352293	1352302	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_019753	AAG	2	6	1353257	1353262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_019753	CTT	2	6	1353346	1353351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_019753	ATTT	2	8	1353540	1353547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_019753	ATC	2	6	1353589	1353594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_019753	A	6	6	1353608	1353613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_019753	ATT	2	6	1354599	1354604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_019753	CTA	2	6	1354613	1354618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_019753	TGT	2	6	1354669	1354674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_019753	TGA	2	6	1354700	1354705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_019753	AAC	2	6	1354714	1354719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_019753	ATT	2	6	1354758	1354763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_019753	AACT	2	8	1354795	1354802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6107	NC_019753	CCTT	2	8	1354836	1354843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6108	NC_019753	CTA	2	6	1354864	1354869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_019753	GTA	2	6	1354898	1354903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_019753	TTA	2	6	1354941	1354946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_019753	TAA	2	6	1355035	1355040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_019753	TGA	2	6	1355046	1355051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_019753	AAC	2	6	1355060	1355065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_019753	TTA	2	6	1355097	1355102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_019753	ATA	2	6	1355116	1355121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_019753	TTTA	2	8	1355122	1355129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_019753	TGA	2	6	1355163	1355168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_019753	TA	3	6	1355182	1355187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_019753	ATC	2	6	1355925	1355930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_019753	CTG	2	6	1356003	1356008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_019753	TTA	2	6	1356049	1356054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_019753	ACT	3	9	1356137	1356145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_019753	ATA	2	6	1359312	1359317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_019753	CAT	2	6	1359402	1359407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_019753	TTTGG	2	10	1359506	1359515	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_019753	CTA	2	6	1359536	1359541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_019753	AGG	2	6	1359582	1359587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_019753	TAA	2	6	1362981	1362986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_019753	T	6	6	1363328	1363333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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