MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 28954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019751	GCT	2	6	608670	608675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_019751	TCC	2	6	609213	609218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_019751	A	6	6	609282	609287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_019751	T	6	6	609293	609298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_019751	TTA	2	6	609425	609430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_019751	TTC	2	6	609435	609440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_019751	T	7	7	609528	609534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_019751	CTG	2	6	609940	609945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_019751	TGTT	2	8	610051	610058	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_019751	CTG	2	6	610107	610112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_019751	GCA	2	6	610129	610134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_019751	TAA	2	6	610161	610166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_019751	A	6	6	610218	610223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_019751	ACC	2	6	610872	610877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_019751	ACT	2	6	610907	610912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_019751	ATT	2	6	610922	610927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_019751	AAT	2	6	610944	610949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_019751	CTA	2	6	610984	610989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_019751	CAT	2	6	611067	611072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_019751	AC	3	6	611083	611088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_019751	AC	3	6	611092	611097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_019751	TAC	2	6	611098	611103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_019751	AAT	2	6	611732	611737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_019751	TAT	2	6	611742	611747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_019751	AAACT	2	10	613534	613543	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3026	NC_019751	ATTT	2	8	613600	613607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_019751	T	8	8	613605	613612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_019751	ATT	2	6	613911	613916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_019751	TCA	2	6	613951	613956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_019751	AT	3	6	613994	613999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_019751	TGA	2	6	614012	614017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_019751	TCT	2	6	614022	614027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_019751	GAGT	2	8	614028	614035	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_019751	TTATAA	2	12	614043	614054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_019751	ATT	2	6	614077	614082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_019751	GTT	2	6	614145	614150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_019751	T	6	6	614149	614154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_019751	GAA	2	6	614869	614874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_019751	AGAA	2	8	614923	614930	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_019751	TA	4	8	614933	614940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_019751	AT	3	6	614950	614955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_019751	AT	3	6	617754	617759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_019751	TGTA	2	8	617924	617931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_019751	ACC	2	6	617951	617956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_019751	ATG	2	6	617983	617988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_019751	CTT	2	6	617997	618002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_019751	TAA	2	6	620631	620636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_019751	TCC	2	6	620639	620644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_019751	TACG	2	8	620663	620670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_019751	ATT	2	6	620681	620686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_019751	GAT	3	9	622356	622364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_019751	ATTT	2	8	622528	622535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_019751	AAT	2	6	624252	624257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_019751	GTT	2	6	624272	624277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_019751	AAT	2	6	624292	624297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_019751	TAG	2	6	624327	624332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_019751	ATAC	2	8	624343	624350	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3058	NC_019751	CA	3	6	624362	624367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_019751	ATA	2	6	624452	624457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_019751	ATT	3	9	624573	624581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_019751	CAT	2	6	624602	624607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_019751	ATAG	2	8	624629	624636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_019751	TTG	2	6	624666	624671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_019751	A	6	6	624786	624791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_019751	AATA	2	8	624802	624809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_019751	TGG	2	6	624811	624816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_019751	ACCC	2	8	624836	624843	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3068	NC_019751	T	6	6	624858	624863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_019751	AC	3	6	624879	624884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_019751	TA	3	6	624919	624924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_019751	A	6	6	624946	624951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_019751	TAG	2	6	624993	624998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_019751	TTTA	2	8	625046	625053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_019751	ATTT	2	8	625096	625103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_019751	ATAA	2	8	625119	625126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_019751	AGG	2	6	625205	625210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_019751	AGT	2	6	625648	625653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_019751	GTT	2	6	627265	627270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_019751	GA	3	6	627371	627376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_019751	GTT	2	6	627420	627425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_019751	TA	4	8	627429	627436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_019751	TC	3	6	627437	627442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_019751	ACA	2	6	627456	627461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_019751	CGA	2	6	627488	627493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_019751	AGT	2	6	627525	627530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_019751	GAT	2	6	627633	627638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_019751	GAC	2	6	627725	627730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_019751	TAT	2	6	627731	627736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_019751	GAG	2	6	627795	627800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_019751	TAA	2	6	627818	627823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_019751	A	6	6	627828	627833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_019751	AT	3	6	627859	627864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_019751	TGAGT	2	10	629586	629595	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_019751	CAG	2	6	629598	629603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_019751	T	6	6	629604	629609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_019751	CAT	2	6	629624	629629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_019751	ACTT	2	8	629657	629664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3098	NC_019751	GCTT	2	8	629670	629677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3099	NC_019751	T	7	7	632655	632661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_019751	TAA	2	6	632688	632693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_019751	TATT	2	8	632783	632790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_019751	TGG	2	6	632820	632825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_019751	GTT	2	6	632832	632837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_019751	TAT	2	6	632924	632929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_019751	TAT	2	6	632998	633003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_019751	ATA	2	6	633064	633069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_019751	TAG	2	6	633092	633097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_019751	AT	3	6	633586	633591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_019751	GCC	2	6	635351	635356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_019751	TAC	2	6	635459	635464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_019751	TTA	2	6	636264	636269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_019751	TTC	2	6	636334	636339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_019751	ATT	2	6	636340	636345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_019751	TAT	2	6	636419	636424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_019751	ATG	2	6	636444	636449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_019751	AAAC	2	8	636514	636521	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3117	NC_019751	T	7	7	636573	636579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_019751	CAAG	2	8	636690	636697	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3119	NC_019751	A	8	8	636733	636740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_019751	CTA	2	6	636778	636783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_019751	ATC	2	6	636892	636897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_019751	T	6	6	636898	636903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_019751	GGTG	2	8	636943	636950	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_019751	AGT	2	6	636990	636995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_019751	AGT	2	6	637007	637012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_019751	CAAA	2	8	637542	637549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_019751	AT	3	6	638499	638504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_019751	T	6	6	638528	638533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_019751	ATC	2	6	638543	638548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_019751	CAA	2	6	638560	638565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_019751	AAT	2	6	638580	638585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_019751	GTT	2	6	638651	638656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_019751	T	6	6	638655	638660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_019751	ATC	2	6	638745	638750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_019751	TAA	2	6	638790	638795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_019751	TAC	2	6	639974	639979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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