MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 28954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019751	ATTT	2	8	309241	309248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_019751	T	7	7	309275	309281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_019751	TG	3	6	309393	309398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_019751	A	7	7	313129	313135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_019751	A	6	6	313156	313161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_019751	TTTA	2	8	313204	313211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_019751	TC	3	6	313304	313309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_019751	T	6	6	313349	313354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_019751	GTA	2	6	313377	313382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_019751	TTTC	2	8	313398	313405	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_019751	TCTT	2	8	313406	313413	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_019751	TCT	3	9	313428	313436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_019751	TC	3	6	316403	316408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_019751	CTT	2	6	316449	316454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_019751	ATTA	2	8	316463	316470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_019751	ATT	2	6	316484	316489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_019751	A	6	6	316512	316517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_019751	AGT	2	6	316527	316532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_019751	CTT	2	6	316567	316572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_019751	GAAAC	2	10	316590	316599	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1521	NC_019751	CTG	2	6	316605	316610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_019751	CTT	2	6	316638	316643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_019751	CTT	2	6	316713	316718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_019751	T	6	6	316769	316774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_019751	CTT	2	6	316785	316790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_019751	ATC	2	6	316836	316841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_019751	CTT	2	6	316856	316861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_019751	CTT	2	6	316928	316933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_019751	CTT	2	6	316998	317003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_019751	GCT	2	6	317036	317041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_019751	CTT	3	9	317057	317065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_019751	CTT	2	6	317070	317075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_019751	T	6	6	317127	317132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_019751	CTT	2	6	317140	317145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_019751	CTT	2	6	317213	317218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_019751	CTT	2	6	317285	317290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_019751	ATT	2	6	317324	317329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_019751	CTT	2	6	317357	317362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_019751	CTA	2	6	317473	317478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_019751	ATTA	2	8	317482	317489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_019751	ATAC	2	8	317540	317547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_019751	T	6	6	317653	317658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_019751	A	6	6	319123	319128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_019751	ATA	2	6	319163	319168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_019751	CAAG	2	8	319186	319193	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_019751	TTG	2	6	319245	319250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_019751	AAT	2	6	319559	319564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_019751	TCTT	2	8	319569	319576	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_019751	A	6	6	320020	320025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_019751	ACA	2	6	320036	320041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_019751	TGTCAA	2	12	320049	320060	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1552	NC_019751	AGG	2	6	320146	320151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_019751	A	6	6	320410	320415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_019751	CTTT	2	8	320909	320916	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_019751	AG	3	6	320935	320940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_019751	TACT	2	8	320995	321002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_019751	GTT	2	6	321020	321025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_019751	ATTA	2	8	321027	321034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_019751	ATT	2	6	321069	321074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_019751	ATA	2	6	321122	321127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_019751	TGAT	2	8	321130	321137	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_019751	A	6	6	321159	321164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_019751	T	6	6	321185	321190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_019751	TTG	2	6	321219	321224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_019751	AAT	2	6	321299	321304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_019751	AAC	2	6	321324	321329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_019751	CTTT	2	8	321751	321758	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_019751	ATT	2	6	321781	321786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_019751	AAAT	2	8	321793	321800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_019751	AT	3	6	321799	321804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_019751	T	6	6	321822	321827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_019751	T	6	6	321861	321866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_019751	TA	3	6	322318	322323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_019751	GAA	2	6	322354	322359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_019751	ATT	2	6	322386	322391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_019751	A	7	7	322394	322400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_019751	TAAA	2	8	322555	322562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_019751	GTTT	2	8	322586	322593	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_019751	TAC	2	6	322594	322599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_019751	T	7	7	322694	322700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_019751	ATA	2	6	322886	322891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_019751	CTA	2	6	322930	322935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1584	NC_019751	AGT	2	6	322995	323000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1586	NC_019751	GAA	2	6	323119	323124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_019751	GTT	2	6	323145	323150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_019751	TTTA	2	8	323282	323289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_019751	T	8	8	323329	323336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_019751	CTTT	2	8	323346	323353	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_019751	ATT	2	6	323377	323382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_019751	ATGT	2	8	323406	323413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_019751	TAC	2	6	323852	323857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_019751	ATT	2	6	323918	323923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_019751	GGA	2	6	323966	323971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_019751	GAC	2	6	323987	323992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1607	NC_019751	GGTGA	2	10	324074	324083	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_019751	TC	3	6	324162	324167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_019751	CT	3	6	324186	324191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_019751	AT	3	6	324192	324197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_019751	TAT	2	6	324235	324240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_019751	ATT	2	6	324243	324248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_019751	A	6	6	324271	324276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1615	NC_019751	CTT	2	6	324400	324405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_019751	GA	3	6	324455	324460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_019751	CTT	2	6	324470	324475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1619	NC_019751	CTT	2	6	324620	324625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_019751	A	6	6	324677	324682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_019751	CTT	2	6	324691	324696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1625	NC_019751	CTT	2	6	324906	324911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1627	NC_019751	CTT	2	6	325047	325052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_019751	AACT	2	8	325100	325107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1631	NC_019751	A	7	7	325174	325180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_019751	CTT	2	6	325188	325193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_019751	TCG	2	6	325240	325245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1635	NC_019751	CTT	2	6	325261	325266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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