MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 28954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019751	A	6	6	221922	221927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_019751	GATG	2	8	221960	221967	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019751	A	6	6	222007	222012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019751	CTG	2	6	222884	222889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_019751	A	6	6	222913	222918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019751	TC	3	6	222949	222954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_019751	ATTA	2	8	222989	222996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_019751	TAC	2	6	223031	223036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_019751	ATAA	2	8	223117	223124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_019751	TTA	2	6	224934	224939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019751	GTT	2	6	224964	224969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_019751	GGT	2	6	225922	225927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019751	ATT	2	6	226374	226379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_019751	AGG	2	6	228172	228177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019751	TAAC	2	8	228257	228264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_019751	TAA	2	6	228394	228399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_019751	GTC	2	6	228934	228939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_019751	GGA	2	6	228946	228951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_019751	CTG	2	6	228988	228993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_019751	ATA	2	6	230891	230896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_019751	ATG	2	6	230928	230933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_019751	TG	3	6	231116	231121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_019751	TCA	2	6	231160	231165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_019751	TTTC	2	8	231178	231185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_019751	TAA	2	6	231205	231210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_019751	TTC	2	6	231211	231216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_019751	TTA	2	6	231266	231271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019751	GGC	2	6	232806	232811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_019751	TGT	2	6	232914	232919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_019751	TTG	2	6	232930	232935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_019751	TAGGC	2	10	232963	232972	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1032	NC_019751	GAAAA	2	10	233149	233158	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019751	TCG	2	6	233211	233216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_019751	GGC	2	6	233225	233230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_019751	T	7	7	233303	233309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_019751	AAAC	2	8	233318	233325	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_019751	TAT	2	6	233371	233376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_019751	AAATG	2	10	233611	233620	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_019751	T	7	7	233671	233677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_019751	A	6	6	233730	233735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_019751	ACTGA	2	10	235274	235283	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1042	NC_019751	AC	3	6	235286	235291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_019751	ATG	2	6	235312	235317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_019751	AAT	2	6	235360	235365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_019751	GGGAT	2	10	235397	235406	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019751	AT	3	6	235481	235486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_019751	TTA	2	6	235513	235518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_019751	AGTAT	2	10	235522	235531	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_019751	TTA	2	6	235554	235559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019751	AAT	2	6	235573	235578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_019751	GAA	2	6	235587	235592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019751	A	6	6	236693	236698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019751	ATT	2	6	236701	236706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_019751	AGG	2	6	236794	236799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_019751	AGT	2	6	237252	237257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_019751	GA	3	6	241836	241841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_019751	T	6	6	241922	241927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019751	AT	3	6	241982	241987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_019751	T	7	7	242027	242033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_019751	TGT	2	6	242056	242061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019751	ACA	2	6	242089	242094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_019751	ACA	2	6	242123	242128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_019751	TC	3	6	242184	242189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_019751	TATGC	2	10	242222	242231	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1065	NC_019751	TGA	2	6	242252	242257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_019751	GGA	2	6	242295	242300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_019751	GGA	2	6	242343	242348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_019751	TGC	2	6	242373	242378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_019751	G	6	6	242385	242390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_019751	GAA	2	6	242428	242433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_019751	AGA	2	6	242485	242490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_019751	TGG	2	6	242505	242510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_019751	ATT	2	6	242527	242532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_019751	GTT	2	6	242560	242565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_019751	TGA	2	6	242679	242684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_019751	AAATC	2	10	243120	243129	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1081	NC_019751	AT	3	6	244485	244490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_019751	AG	3	6	244516	244521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_019751	T	7	7	244546	244552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_019751	TGA	2	6	244568	244573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_019751	ATC	2	6	244640	244645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_019751	TCA	2	6	244682	244687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_019751	TGTC	2	8	245632	245639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_019751	ATT	2	6	245647	245652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_019751	TAT	2	6	247215	247220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_019751	TTG	2	6	247221	247226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_019751	TCT	2	6	247234	247239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1096	NC_019751	TTGA	2	8	247278	247285	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_019751	TCA	2	6	247341	247346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1099	NC_019751	ATT	2	6	247377	247382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_019751	TAA	2	6	247389	247394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1102	NC_019751	CAA	2	6	247413	247418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_019751	GGA	2	6	247422	247427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_019751	TCAT	2	8	247811	247818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_019751	GAA	2	6	247830	247835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_019751	AGGA	2	8	247864	247871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_019751	CTT	2	6	247994	247999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_019751	GTG	2	6	248077	248082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_019751	ACA	2	6	248112	248117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_019751	ATT	2	6	248533	248538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_019751	A	6	6	248546	248551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_019751	CA	3	6	248560	248565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_019751	T	8	8	248585	248592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_019751	AATT	2	8	248598	248605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019751	TACA	2	8	248670	248677	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_019751	TTC	2	6	248703	248708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_019751	ATT	2	6	248717	248722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_019751	ATG	2	6	248753	248758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_019751	T	9	9	248770	248778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_019751	GAT	2	6	248779	248784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_019751	TGC	2	6	248832	248837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_019751	TGT	2	6	248949	248954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_019751	GT	3	6	248953	248958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_019751	ATA	3	9	249010	249018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_019751	AAT	2	6	249033	249038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_019751	AGTG	2	8	249041	249048	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_019751	ATTA	2	8	249921	249928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_019751	A	7	7	249947	249953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_019751	TGC	2	6	249955	249960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_019751	TAG	2	6	249964	249969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_019751	A	8	8	250030	250037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_019751	TGT	2	6	250087	250092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_019751	A	8	8	250648	250655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_019751	CACT	2	8	251382	251389	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_019751	ATG	2	6	251424	251429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_019751	TAA	2	6	252021	252026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_019751	AATA	2	8	298144	298151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_019751	ATG	3	9	298201	298209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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