MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 28954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019751	T	6	6	121530	121535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_019751	TTA	2	6	121546	121551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_019751	ATAG	2	8	121804	121811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_019751	A	6	6	121868	121873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_019751	TAA	2	6	121900	121905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_019751	ACATC	2	10	121907	121916	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
507	NC_019751	TA	3	6	121927	121932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_019751	TGA	3	9	121944	121952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_019751	GTA	2	6	121972	121977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_019751	CTA	2	6	121978	121983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_019751	ATTA	2	8	122716	122723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_019751	AAT	2	6	122731	122736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_019751	A	6	6	122750	122755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_019751	T	6	6	122804	122809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_019751	AAT	2	6	122900	122905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_019751	ATG	2	6	122927	122932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_019751	A	8	8	122964	122971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_019751	TTAA	2	8	123558	123565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_019751	CTT	2	6	123572	123577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_019751	TAT	2	6	123582	123587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_019751	T	6	6	123608	123613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_019751	G	8	8	123637	123644	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
523	NC_019751	TAGA	2	8	124574	124581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_019751	AT	3	6	124667	124672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_019751	TCT	2	6	125660	125665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_019751	ATAA	2	8	125703	125710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_019751	ACT	2	6	125716	125721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_019751	ACCC	2	8	126460	126467	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
529	NC_019751	TAA	2	6	127197	127202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_019751	ATC	2	6	127203	127208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_019751	ATGT	2	8	127290	127297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
532	NC_019751	CTG	2	6	127313	127318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_019751	AG	3	6	127321	127326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_019751	AAG	2	6	127378	127383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_019751	ATT	2	6	128594	128599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_019751	TTTA	2	8	128603	128610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_019751	ATC	2	6	128712	128717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_019751	TG	3	6	128720	128725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_019751	ACAA	2	8	128780	128787	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
540	NC_019751	TATTT	2	10	128795	128804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_019751	TTGA	2	8	130037	130044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_019751	AG	4	8	130051	130058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_019751	TCAT	2	8	130088	130095	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
544	NC_019751	ATTAAT	2	12	131114	131125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_019751	A	7	7	131149	131155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_019751	GCAA	2	8	131157	131164	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
547	NC_019751	TTTG	2	8	131178	131185	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
548	NC_019751	T	6	6	131207	131212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_019751	ACTT	2	8	131219	131226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
550	NC_019751	AAT	2	6	131232	131237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_019751	ATT	2	6	131239	131244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_019751	TAG	2	6	132966	132971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_019751	TG	3	6	133006	133011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_019751	TA	3	6	133090	133095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_019751	T	7	7	133103	133109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_019751	AGCC	2	8	133226	133233	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
557	NC_019751	ATG	2	6	133330	133335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_019751	TAA	2	6	133355	133360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_019751	A	6	6	133389	133394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_019751	GCAA	2	8	133471	133478	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
561	NC_019751	CCAAAA	2	12	133846	133857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_019751	A	8	8	133913	133920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_019751	TCC	2	6	134050	134055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_019751	GC	3	6	134059	134064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
565	NC_019751	GTTTA	2	10	134142	134151	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
566	NC_019751	A	6	6	134193	134198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_019751	ATA	2	6	134255	134260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_019751	TTAG	2	8	134265	134272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_019751	T	6	6	135690	135695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_019751	AAT	2	6	135713	135718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_019751	A	6	6	136587	136592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_019751	CAG	2	6	136607	136612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_019751	ATT	2	6	136654	136659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_019751	CAA	2	6	136792	136797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_019751	AGG	2	6	136805	136810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_019751	T	7	7	138481	138487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_019751	ATT	2	6	138525	138530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_019751	AAT	2	6	138552	138557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_019751	TAG	2	6	138577	138582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_019751	ATTA	2	8	138604	138611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_019751	TAAG	2	8	138626	138633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_019751	GAT	2	6	138662	138667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_019751	TTGA	2	8	138677	138684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_019751	AC	3	6	138714	138719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_019751	ACAAAA	2	12	139249	139260	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
586	NC_019751	AG	3	6	139275	139280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_019751	ATT	2	6	139613	139618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_019751	CAA	2	6	139641	139646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_019751	GTT	2	6	139651	139656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_019751	ATT	2	6	139667	139672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_019751	AATT	2	8	139693	139700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_019751	TAG	2	6	139998	140003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_019751	TGTT	2	8	140038	140045	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_019751	TTTA	2	8	140138	140145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_019751	ATA	2	6	140174	140179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_019751	ATA	2	6	142010	142015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_019751	CTA	2	6	142055	142060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_019751	T	6	6	142083	142088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_019751	GGT	2	6	143741	143746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_019751	ACC	2	6	143754	143759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_019751	AAG	2	6	143795	143800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_019751	AGA	2	6	144645	144650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_019751	TTAA	2	8	146462	146469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_019751	GAA	2	6	146493	146498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_019751	TTAT	2	8	146509	146516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_019751	GAA	2	6	146538	146543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_019751	ATT	2	6	146611	146616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_019751	TAT	2	6	146625	146630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_019751	GAG	2	6	146666	146671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_019751	TAG	2	6	146706	146711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_019751	TAAT	2	8	146732	146739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_019751	CTTT	2	8	146745	146752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
613	NC_019751	AGTA	2	8	146767	146774	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_019751	AAT	2	6	146825	146830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_019751	T	6	6	146992	146997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_019751	T	6	6	147041	147046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_019751	TAA	2	6	147103	147108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_019751	AAC	2	6	147113	147118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_019751	AT	3	6	147143	147148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_019751	ATA	2	6	147160	147165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_019751	TGC	2	6	147219	147224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_019751	ATTT	2	8	147286	147293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_019751	AAAT	2	8	147335	147342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_019751	TTA	2	6	147423	147428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_019751	A	6	6	147561	147566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_019751	AAC	2	6	147585	147590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_019751	TC	3	6	147628	147633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
628	NC_019751	AGAA	2	8	147634	147641	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
629	NC_019751	A	7	7	147675	147681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_019751	ACT	2	6	147693	147698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_019751	TAAT	2	8	147747	147754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_019751	T	7	7	148333	148339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_019751	CCT	2	6	148553	148558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_019751	AAG	2	6	148685	148690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_019751	A	6	6	148717	148722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_019751	A	6	6	148751	148756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_019751	T	6	6	148807	148812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_019751	TCC	2	6	148909	148914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_019751	C	6	6	148940	148945	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
640	NC_019751	TTAA	2	8	148968	148975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_019751	TA	3	6	149072	149077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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