MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 28954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019751	CAG	2	6	1342196	1342201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_019751	ACA	2	6	1342237	1342242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_019751	TCA	2	6	1342346	1342351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_019751	TTC	2	6	1342409	1342414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_019751	A	6	6	1342439	1342444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_019751	GTTG	2	8	1342483	1342490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_019751	AAT	2	6	1342493	1342498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_019751	AGCGC	2	10	1343327	1343336	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6009	NC_019751	T	7	7	1343342	1343348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_019751	TCTT	2	8	1343367	1343374	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6011	NC_019751	ACCCT	2	10	1343403	1343412	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6012	NC_019751	TTAAC	2	10	1343422	1343431	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6013	NC_019751	TTA	2	6	1344198	1344203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_019751	ATAA	2	8	1344217	1344224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_019751	GAG	2	6	1344233	1344238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_019751	A	6	6	1344263	1344268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_019751	AATT	2	8	1344299	1344306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_019751	TTA	2	6	1346349	1346354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_019751	CATATA	2	12	1346378	1346389	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6020	NC_019751	C	6	6	1346415	1346420	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6021	NC_019751	G	6	6	1346443	1346448	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_019751	T	6	6	1346495	1346500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_019751	ACC	2	6	1346501	1346506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6024	NC_019751	AATT	2	8	1346507	1346514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_019751	AT	3	6	1346759	1346764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_019751	GT	3	6	1346774	1346779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_019751	TCT	2	6	1346910	1346915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_019751	AAC	2	6	1349890	1349895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_019751	T	6	6	1349898	1349903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_019751	GCA	2	6	1349941	1349946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_019751	AATT	2	8	1349963	1349970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_019751	T	6	6	1349982	1349987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_019751	GAA	2	6	1350035	1350040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_019751	A	6	6	1350106	1350111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_019751	TTA	2	6	1350285	1350290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_019751	TTC	2	6	1350305	1350310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_019751	CT	3	6	1350475	1350480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_019751	AC	3	6	1350534	1350539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6039	NC_019751	TGTT	2	8	1350542	1350549	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_019751	ACA	2	6	1350641	1350646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_019751	AGC	2	6	1350679	1350684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_019751	AAT	2	6	1350696	1350701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_019751	ATT	2	6	1350729	1350734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_019751	GCCT	2	8	1351787	1351794	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_019751	A	9	9	1353094	1353102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_019751	AGTA	2	8	1353131	1353138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_019751	TA	3	6	1353143	1353148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_019751	CTC	2	6	1353155	1353160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_019751	TTC	2	6	1353178	1353183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_019751	A	6	6	1353724	1353729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_019751	TGA	2	6	1353741	1353746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_019751	TCA	2	6	1353769	1353774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_019751	GAA	2	6	1353779	1353784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_019751	ATTG	2	8	1353795	1353802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_019751	CAA	2	6	1353841	1353846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_019751	ATC	2	6	1354910	1354915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_019751	CTT	2	6	1354926	1354931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_019751	TGT	2	6	1355001	1355006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_019751	ATC	2	6	1355095	1355100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_019751	TCC	2	6	1355140	1355145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_019751	GAT	3	9	1355150	1355158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_019751	TTG	2	6	1355179	1355184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_019751	GCT	2	6	1355309	1355314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6065	NC_019751	TAA	2	6	1355385	1355390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_019751	TCCAC	2	10	1355411	1355420	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6067	NC_019751	TAAA	3	12	1355440	1355451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6070	NC_019751	ATA	2	6	1355562	1355567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_019751	CAT	3	9	1355608	1355616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6074	NC_019751	TAATT	3	15	1355731	1355745	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_019751	ATAA	2	8	1358148	1358155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_019751	AC	3	6	1358199	1358204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_019751	GGCG	2	8	1358343	1358350	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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6082	NC_019751	TGGG	2	8	1358454	1358461	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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6103	NC_019751	ATT	2	6	1359553	1359558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6109	NC_019751	CAC	3	9	1359811	1359819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6110	NC_019751	TGA	2	6	1359834	1359839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_019751	TG	3	6	1359877	1359882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_019751	TTTA	2	8	1359930	1359937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_019751	T	6	6	1360787	1360792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_019751	AGAT	2	8	1360841	1360848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_019751	AGA	2	6	1360856	1360861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_019751	TA	4	8	1360865	1360872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6119	NC_019751	TAG	2	6	1361008	1361013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6122	NC_019751	A	6	6	1362203	1362208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_019751	GAT	2	6	1362230	1362235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6126	NC_019751	TGC	2	6	1362289	1362294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_019751	A	6	6	1362303	1362308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_019751	TATT	2	8	1362354	1362361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_019751	TTGA	2	8	1362377	1362384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_019751	TAAAT	2	10	1362399	1362408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_019751	A	7	7	1362425	1362431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6133	NC_019751	ACTAT	2	10	1362453	1362462	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6135	NC_019751	GT	3	6	1362534	1362539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6258	NC_019751	TTTG	2	8	1393578	1393585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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