MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 28954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019751	GAA	2	6	983671	983676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_019751	AAT	2	6	983757	983762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_019751	TATTT	2	10	983910	983919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_019751	AAG	2	6	983937	983942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_019751	ACG	2	6	983985	983990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_019751	TCA	2	6	984039	984044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_019751	TTA	2	6	984055	984060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_019751	CTT	2	6	984068	984073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_019751	ATT	2	6	985036	985041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_019751	AAT	2	6	985086	985091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_019751	TG	3	6	985120	985125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_019751	TGT	2	6	985145	985150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_019751	TTG	2	6	985924	985929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_019751	TG	3	6	985946	985951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_019751	GT	3	6	985988	985993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_019751	T	6	6	987192	987197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_019751	TA	3	6	987241	987246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_019751	ATT	2	6	987284	987289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_019751	T	8	8	987319	987326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_019751	GACC	2	8	987360	987367	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4521	NC_019751	CTA	2	6	987371	987376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_019751	AAG	2	6	987784	987789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_019751	AGT	2	6	987792	987797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_019751	AAT	2	6	987823	987828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_019751	ACT	2	6	987875	987880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_019751	AGC	2	6	987886	987891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_019751	AAT	2	6	989264	989269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_019751	GTAA	2	8	989382	989389	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_019751	TAAA	2	8	989460	989467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_019751	CTT	2	6	989479	989484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_019751	TTC	2	6	989541	989546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_019751	GGA	2	6	989570	989575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_019751	ATT	2	6	989639	989644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_019751	GCT	2	6	989665	989670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_019751	CAGA	2	8	990625	990632	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4536	NC_019751	TGC	2	6	990728	990733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_019751	TAT	2	6	991804	991809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_019751	A	6	6	991847	991852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_019751	GTA	2	6	991909	991914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_019751	ATT	2	6	991923	991928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_019751	TCA	2	6	992101	992106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_019751	ATT	2	6	992608	992613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_019751	ATT	2	6	992642	992647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_019751	TTAC	2	8	992662	992669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4545	NC_019751	TAA	2	6	992696	992701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_019751	TTTC	2	8	993054	993061	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4547	NC_019751	AT	3	6	993116	993121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_019751	AGTT	2	8	994991	994998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_019751	CAAA	2	8	995004	995011	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4550	NC_019751	TTA	2	6	995054	995059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_019751	TTTA	2	8	995065	995072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_019751	AAAAT	2	10	995077	995086	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_019751	CTA	2	6	995331	995336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_019751	TATT	2	8	995377	995384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_019751	T	6	6	995460	995465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_019751	AGCT	2	8	995469	995476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4557	NC_019751	ATTT	2	8	995501	995508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_019751	TTA	2	6	995515	995520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_019751	AATA	2	8	995530	995537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_019751	A	6	6	995567	995572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_019751	AATC	2	8	996463	996470	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4562	NC_019751	AAAAT	2	10	996476	996485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_019751	CAT	2	6	998353	998358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_019751	TAC	2	6	998412	998417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_019751	TA	3	6	998426	998431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_019751	AT	4	8	998461	998468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_019751	ATT	2	6	998519	998524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_019751	TAT	2	6	998533	998538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_019751	AT	3	6	998537	998542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_019751	TA	3	6	998547	998552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_019751	GCC	2	6	998559	998564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4572	NC_019751	TGT	2	6	1000315	1000320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_019751	A	6	6	1000322	1000327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_019751	TAGT	2	8	1000360	1000367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_019751	ATC	2	6	1000373	1000378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4577	NC_019751	GT	3	6	1000441	1000446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_019751	ATA	2	6	1000456	1000461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_019751	ACA	2	6	1000506	1000511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4581	NC_019751	CTC	2	6	1000587	1000592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4582	NC_019751	ATGCT	2	10	1000596	1000605	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4583	NC_019751	CGCT	2	8	1000662	1000669	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4584	NC_019751	AT	3	6	1001724	1001729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_019751	TAA	2	6	1001741	1001746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_019751	TTTA	2	8	1001771	1001778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_019751	AAT	2	6	1001801	1001806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_019751	CAT	2	6	1001821	1001826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_019751	ATA	2	6	1001835	1001840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_019751	CTA	2	6	1001982	1001987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4592	NC_019751	TCAG	2	8	1003292	1003299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4593	NC_019751	ATT	2	6	1004881	1004886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_019751	AAT	2	6	1004938	1004943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_019751	ACA	2	6	1005017	1005022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_019751	AAT	2	6	1005034	1005039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_019751	ACATG	2	10	1005117	1005126	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4598	NC_019751	AAT	2	6	1005192	1005197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_019751	TTA	2	6	1006939	1006944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_019751	AAATT	2	10	1006950	1006959	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_019751	AAGA	2	8	1006987	1006994	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_019751	TAA	2	6	1006996	1007001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_019751	ATTAA	2	10	1007009	1007018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_019751	A	8	8	1007017	1007024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_019751	GAT	2	6	1007026	1007031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_019751	A	7	7	1007068	1007074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_019751	TAAT	2	8	1007075	1007082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_019751	AAT	2	6	1007088	1007093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_019751	ATA	2	6	1007118	1007123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_019751	CTT	2	6	1007141	1007146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_019751	GA	3	6	1007175	1007180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_019751	ATC	2	6	1007204	1007209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_019751	ACT	2	6	1007310	1007315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_019751	ACA	2	6	1007356	1007361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_019751	CAA	2	6	1007429	1007434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_019751	AGG	2	6	1007483	1007488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_019751	T	6	6	1007517	1007522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_019751	TA	3	6	1007541	1007546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_019751	ATT	2	6	1007555	1007560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_019751	GGT	2	6	1007601	1007606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_019751	ATG	2	6	1007628	1007633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_019751	GTAA	2	8	1007657	1007664	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_019751	TTA	2	6	1007702	1007707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_019751	GCA	2	6	1008493	1008498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_019751	AT	3	6	1009638	1009643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_019751	TTA	2	6	1009647	1009652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_019751	GAA	2	6	1009730	1009735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_019751	GGA	2	6	1009793	1009798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_019751	TTA	2	6	1009811	1009816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_019751	AAT	2	6	1009840	1009845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_019751	TCG	2	6	1010019	1010024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_019751	TTG	2	6	1010039	1010044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_019751	TGAA	2	8	1010048	1010055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4635	NC_019751	GCA	2	6	1010063	1010068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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