MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.02

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019744	ACAAT	2	10	8514	8523	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019744	AAATT	2	10	9570	9579	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019744	TTAGA	2	10	16162	16171	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019744	CATTT	2	10	16417	16426	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019744	ATTAT	2	10	21611	21620	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019744	TCAAT	2	10	35013	35022	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019744	AGTTT	2	10	46814	46823	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019744	TGTAT	2	10	54343	54352	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019744	TGAGA	2	10	57895	57904	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019744	CTTTC	2	10	58522	58531	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_019744	TTAAG	2	10	59769	59778	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019744	GAACA	2	10	61719	61728	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019744	GTTGA	2	10	67372	67381	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019744	TTTAA	2	10	76533	76542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019744	CATTT	2	10	79965	79974	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019744	TATTT	2	10	80856	80865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019744	TATTG	2	10	83096	83105	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019744	ATTTA	2	10	84828	84837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019744	TAAGA	2	10	86448	86457	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019744	ATTTC	2	10	86460	86469	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019744	GGCTA	2	10	87067	87076	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019744	TCTGA	2	10	87325	87334	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019744	CATTC	2	10	91786	91795	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_019744	AAATC	2	10	97141	97150	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019744	GTTGA	2	10	97197	97206	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019744	AAAAC	2	10	97274	97283	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019744	GAGAG	2	10	102380	102389	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019744	GCGCT	2	10	102673	102682	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_019744	GAGTA	2	10	107941	107950	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019744	TCATT	2	10	111608	111617	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_019744	AATCT	2	10	114723	114732	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019744	CAACC	2	10	121746	121755	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_019744	CTTTT	2	10	127276	127285	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_019744	CATCT	2	10	135900	135909	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_019744	TACAA	2	10	153300	153309	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.