MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.02

Total Repeats: 751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019744	ATTG	2	8	97103	97110	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_019744	AAATC	2	10	97141	97150	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
503	NC_019744	CTG	2	6	97180	97185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_019744	GTTGA	2	10	97197	97206	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
505	NC_019744	AG	4	8	97238	97245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_019744	AAAAC	2	10	97274	97283	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
507	NC_019744	CAG	2	6	97314	97319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_019744	TTA	2	6	97373	97378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_019744	TA	3	6	97394	97399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_019744	AGC	2	6	97432	97437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_019744	AGA	2	6	97445	97450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_019744	GTT	2	6	97549	97554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_019744	ACC	2	6	97659	97664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_019744	AAT	2	6	97692	97697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_019744	A	6	6	97701	97706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_019744	A	6	6	98129	98134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_019744	ATTC	2	8	98154	98161	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
518	NC_019744	TAA	2	6	98163	98168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_019744	ACC	2	6	98178	98183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_019744	GAA	2	6	98218	98223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_019744	ATT	2	6	98283	98288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_019744	AATCTA	2	12	98330	98341	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
523	NC_019744	ACTT	2	8	98381	98388	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
524	NC_019744	TAT	2	6	98416	98421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_019744	TGAT	2	8	98448	98455	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
526	NC_019744	TTA	2	6	98469	98474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_019744	CCT	2	6	99080	99085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_019744	TG	3	6	99504	99509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_019744	CAA	3	9	99557	99565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_019744	AGC	2	6	99616	99621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_019744	ACC	2	6	99635	99640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_019744	ACT	2	6	99652	99657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_019744	TGA	2	6	99668	99673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_019744	GAC	2	6	99690	99695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_019744	GCT	2	6	99716	99721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_019744	TGA	2	6	99722	99727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_019744	AGCA	2	8	99728	99735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
538	NC_019744	AAC	2	6	99774	99779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_019744	AGA	2	6	99788	99793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_019744	TGA	2	6	99803	99808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_019744	GTG	2	6	99988	99993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_019744	AGA	2	6	99995	100000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_019744	TTC	2	6	100056	100061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_019744	GAA	2	6	100152	100157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_019744	C	6	6	100275	100280	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
546	NC_019744	CTG	2	6	100293	100298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_019744	ATA	2	6	100393	100398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_019744	TACT	2	8	102299	102306	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_019744	ATT	2	6	102336	102341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_019744	CAA	2	6	102349	102354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_019744	GAGAG	2	10	102380	102389	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
552	NC_019744	TAC	2	6	102445	102450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_019744	TAA	2	6	102519	102524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_019744	AC	3	6	102531	102536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_019744	AT	3	6	102620	102625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_019744	TGA	2	6	102639	102644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_019744	TGG	2	6	102645	102650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_019744	GCGCT	2	10	102673	102682	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
559	NC_019744	A	8	8	102708	102715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_019744	CTGG	2	8	105820	105827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
561	NC_019744	GCC	2	6	105894	105899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_019744	GTT	2	6	105901	105906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_019744	CAA	2	6	105923	105928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_019744	CTT	2	6	105975	105980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_019744	GAA	2	6	105988	105993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_019744	ACC	2	6	106024	106029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_019744	AATT	2	8	107251	107258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_019744	AGGT	2	8	107499	107506	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_019744	A	6	6	107602	107607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_019744	CTT	2	6	107672	107677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_019744	CGGT	2	8	107689	107696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
572	NC_019744	GCG	2	6	107738	107743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_019744	AACA	2	8	107778	107785	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
574	NC_019744	AGT	2	6	107822	107827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_019744	TGA	2	6	107843	107848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_019744	CA	3	6	107890	107895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_019744	AATT	2	8	107908	107915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_019744	TAG	2	6	107934	107939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_019744	GAGTA	2	10	107941	107950	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
580	NC_019744	T	7	7	108005	108011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_019744	TAT	2	6	108040	108045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_019744	TG	3	6	108054	108059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_019744	T	6	6	109550	109555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_019744	CTT	2	6	109575	109580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_019744	ATG	2	6	109622	109627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_019744	T	6	6	110384	110389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_019744	AGA	2	6	110604	110609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_019744	CCG	2	6	110632	110637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_019744	ATC	2	6	110726	110731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_019744	AGCTTA	2	12	110738	110749	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
591	NC_019744	TGC	2	6	110772	110777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_019744	AAC	2	6	110837	110842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_019744	CAA	2	6	110920	110925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_019744	TTC	2	6	111034	111039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_019744	TAA	2	6	111432	111437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_019744	T	6	6	111469	111474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_019744	AAT	2	6	111497	111502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_019744	GTGG	2	8	111574	111581	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
599	NC_019744	A	6	6	111589	111594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_019744	TCATT	2	10	111608	111617	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
601	NC_019744	ACT	2	6	111685	111690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_019744	CGT	2	6	111704	111709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_019744	TGCT	2	8	111915	111922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
604	NC_019744	CTT	3	9	112180	112188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_019744	CAAT	2	8	112195	112202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
606	NC_019744	GCGG	2	8	112246	112253	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
607	NC_019744	A	6	6	112294	112299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_019744	ATT	2	6	112315	112320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_019744	CA	3	6	112632	112637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_019744	TGT	2	6	112650	112655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_019744	ATAC	2	8	113468	113475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
612	NC_019744	CAT	2	6	113612	113617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_019744	GA	3	6	113624	113629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_019744	GCC	2	6	113654	113659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_019744	ACC	2	6	113741	113746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_019744	TAA	2	6	113797	113802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_019744	TAAT	2	8	113807	113814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_019744	A	6	6	113819	113824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_019744	GAT	2	6	113893	113898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_019744	AT	4	8	113916	113923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_019744	T	6	6	113935	113940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_019744	TTA	2	6	113965	113970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_019744	GTT	2	6	114023	114028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_019744	T	6	6	114027	114032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_019744	ACC	3	9	114681	114689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_019744	T	6	6	114705	114710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_019744	AATCT	2	10	114723	114732	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
628	NC_019744	TATC	2	8	114752	114759	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
629	NC_019744	TTA	2	6	116645	116650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_019744	AAAT	2	8	116657	116664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_019744	A	8	8	117315	117322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_019744	T	6	6	117373	117378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_019744	ACT	2	6	117478	117483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_019744	AAC	2	6	117586	117591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_019744	TTC	2	6	118172	118177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_019744	A	7	7	118246	118252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_019744	AG	3	6	118286	118291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_019744	T	7	7	118319	118325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_019744	AGTT	2	8	118381	118388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_019744	GTT	2	6	118429	118434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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