MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.07

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019737	TAA	2	6	14	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019737	CAA	2	6	123	128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019737	ACA	2	6	174	179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019737	ACA	2	6	200	205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019737	CAA	2	6	305	310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019737	TAG	2	6	340	345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019737	TAC	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019737	ACA	2	6	359	364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019737	ACT	2	6	582	587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019737	ATA	2	6	647	652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019737	TTG	2	6	705	710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019737	GTG	2	6	2265	2270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019737	GCA	2	6	2477	2482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019737	AGT	2	6	2570	2575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019737	TAA	2	6	2598	2603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019737	CAA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019737	GTG	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019737	GTA	2	6	2913	2918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019737	GTA	2	6	4597	4602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019737	GCT	2	6	4614	4619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019737	GTA	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019737	GTA	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019737	GTA	2	6	6945	6950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019737	TAC	2	6	6954	6959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019737	TCA	2	6	7015	7020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019737	CAG	2	6	8565	8570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019737	CAA	2	6	8577	8582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019737	TAC	2	6	8731	8736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019737	TCA	2	6	9876	9881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019737	TAA	2	6	9885	9890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019737	ATC	2	6	9897	9902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019737	ACT	2	6	9932	9937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019737	ACT	2	6	10306	10311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019737	TTC	2	6	10359	10364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019737	CAG	2	6	10500	10505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019737	CCT	2	6	10519	10524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_019737	TAG	2	6	10615	10620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019737	GTT	2	6	10624	10629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019737	CAG	2	6	10757	10762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019737	ACT	2	6	10816	10821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019737	TAG	2	6	12546	12551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019737	CAA	2	6	12564	12569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019737	CAA	2	6	12698	12703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019737	ATT	2	6	16605	16610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019737	ATT	2	6	16636	16641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019737	ATG	2	6	17035	17040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019737	AGG	2	6	17070	17075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019737	AAT	2	6	19323	19328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019737	TTA	2	6	20163	20168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019737	TAT	2	6	20172	20177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019737	TAA	2	6	20197	20202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019737	GTG	2	6	22326	22331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019737	TAC	2	6	25981	25986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019737	GAC	2	6	25988	25993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019737	AAG	2	6	26038	26043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019737	ATT	2	6	26052	26057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019737	TCA	2	6	26100	26105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019737	GAT	2	6	26131	26136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019737	TTG	2	6	26931	26936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019737	ACA	2	6	26963	26968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019737	GAA	2	6	26989	26994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019737	TAA	2	6	27398	27403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019737	ATA	2	6	27536	27541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019737	CAT	2	6	28427	28432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019737	TAA	2	6	28437	28442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.