MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.07

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019737	TAA	2	6	14	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019737	TCAA	2	8	90	97	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019737	CAA	2	6	123	128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019737	ACA	2	6	174	179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019737	ACA	2	6	200	205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019737	CAA	2	6	305	310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019737	TAG	2	6	340	345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019737	TAC	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019737	ACA	2	6	359	364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019737	CG	3	6	389	394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019737	ACT	2	6	582	587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019737	TCAAA	2	10	624	633	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019737	ATA	2	6	647	652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019737	TTG	2	6	705	710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019737	GTG	2	6	2265	2270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019737	GCA	2	6	2477	2482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019737	AGTGC	2	10	2513	2522	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019737	AGTGC	2	10	2550	2559	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_019737	AGT	2	6	2570	2575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019737	TAA	2	6	2598	2603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019737	CAA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019737	GTG	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019737	AATT	2	8	2675	2682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019737	CT	3	6	2741	2746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019737	TTTAC	2	10	2798	2807	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019737	GTA	2	6	2913	2918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019737	GTA	2	6	4597	4602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019737	GCT	2	6	4614	4619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019737	GTA	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019737	A	6	6	4669	4674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019737	GTA	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019737	ATTAAT	2	12	5238	5249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019737	AT	3	6	5248	5253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019737	TTAA	2	8	6862	6869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019737	GTA	2	6	6945	6950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019737	TAC	2	6	6954	6959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019737	GATT	2	8	6971	6978	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019737	TCTT	2	8	6981	6988	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019737	TCA	2	6	7015	7020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019737	CAG	2	6	8565	8570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019737	CAA	2	6	8577	8582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019737	TGGC	2	8	8619	8626	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019737	TAC	2	6	8731	8736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019737	AT	3	6	8813	8818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019737	TTGG	2	8	9842	9849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019737	TCA	2	6	9876	9881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019737	TAA	2	6	9885	9890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019737	ATC	2	6	9897	9902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019737	ACT	2	6	9932	9937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019737	ACT	2	6	10306	10311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019737	TTC	2	6	10359	10364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019737	CAG	2	6	10500	10505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019737	CCT	2	6	10519	10524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_019737	TAG	2	6	10615	10620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019737	GTT	2	6	10624	10629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019737	TCAA	2	8	10722	10729	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019737	CAG	2	6	10757	10762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019737	ACT	2	6	10816	10821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019737	TC	3	6	12509	12514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019737	TTAT	2	8	12525	12532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019737	TAG	2	6	12546	12551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019737	CAA	2	6	12564	12569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019737	AAAT	2	8	12595	12602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019737	CAA	2	6	12698	12703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019737	AT	3	6	12889	12894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019737	T	7	7	12906	12912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019737	AC	3	6	12914	12919	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019737	T	6	6	16445	16450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019737	CTGG	2	8	16518	16525	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019737	A	7	7	16584	16590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019737	ATT	2	6	16605	16610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019737	ATT	2	6	16636	16641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019737	CCAT	2	8	16669	16676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019737	T	7	7	16897	16903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019737	TA	3	6	16907	16912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019737	AGCC	2	8	16966	16973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019737	ATG	2	6	17035	17040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019737	A	6	6	17045	17050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019737	AGG	2	6	17070	17075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019737	AAT	2	6	19323	19328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019737	TTA	2	6	20163	20168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019737	TAT	2	6	20172	20177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019737	TAA	2	6	20197	20202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019737	AATT	2	8	21800	21807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019737	GTG	2	6	22326	22331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019737	TTAG	2	8	25937	25944	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019737	TAC	2	6	25981	25986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019737	GAC	2	6	25988	25993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019737	AAG	2	6	26038	26043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019737	ATT	2	6	26052	26057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019737	TCA	2	6	26100	26105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019737	A	7	7	26112	26118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019737	T	7	7	26122	26128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019737	GAT	2	6	26131	26136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019737	A	6	6	26138	26143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019737	AT	3	6	26154	26159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019737	A	6	6	26161	26166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019737	TTG	2	6	26931	26936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019737	ACA	2	6	26963	26968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019737	GAA	2	6	26989	26994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019737	ATAA	2	8	27386	27393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019737	TAA	2	6	27398	27403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019737	GTAT	2	8	27452	27459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019737	ATA	2	6	27536	27541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019737	CAT	2	6	28427	28432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019737	TAA	2	6	28437	28442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019737	CCTA	2	8	28443	28450	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.