MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.04

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019735	TA	4	8	11	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019735	AT	3	6	21	26	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019735	CTAA	2	8	697	704	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019735	GGA	2	6	1009	1014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019735	TCCC	2	8	1087	1094	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_019735	CA	3	6	1115	1120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019735	GTG	2	6	1125	1130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019735	A	6	6	1132	1137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019735	GCAA	2	8	1222	1229	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019735	CGACT	2	10	1341	1350	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_019735	TAG	2	6	1386	1391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019735	CTT	2	6	1394	1399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019735	CT	3	6	1446	1451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019735	GTAG	2	8	1471	1478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019735	TGC	2	6	1488	1493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019735	GGT	2	6	1496	1501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019735	AGT	2	6	1585	1590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019735	GTG	2	6	1622	1627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019735	GTG	2	6	1707	1712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019735	TGA	2	6	1746	1751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019735	CGT	2	6	1781	1786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019735	AGTA	2	8	1840	1847	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019735	G	6	6	2020	2025	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019735	GCA	2	6	2119	2124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019735	GTA	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019735	GTG	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019735	ATCA	2	8	2186	2193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019735	GGAAC	2	10	2200	2209	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_019735	GAT	2	6	2388	2393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019735	AGC	2	6	2409	2414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019735	GAA	2	6	2450	2455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019735	TGA	2	6	2600	2605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019735	TTA	2	6	4480	4485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019735	GAG	2	6	4488	4493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019735	GTT	2	6	4589	4594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019735	TAAT	2	8	4624	4631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019735	ATC	2	6	4707	4712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019735	AAG	2	6	4730	4735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019735	CTAAAA	2	12	4741	4752	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_019735	CAA	2	6	4761	4766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019735	ATT	2	6	4772	4777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019735	CAA	2	6	4872	4877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019735	A	7	7	4876	4882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019735	GAAT	2	8	4886	4893	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019735	GAA	2	6	4909	4914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019735	TA	3	6	4921	4926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019735	TAGA	2	8	4963	4970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019735	A	7	7	4992	4998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019735	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019735	TTA	2	6	5080	5085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019735	TGA	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019735	TAG	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019735	AAT	2	6	5144	5149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019735	A	7	7	5224	5230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019735	ATTT	2	8	5537	5544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019735	TAA	2	6	5560	5565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019735	CTTG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019735	TAT	2	6	5641	5646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019735	T	6	6	5757	5762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019735	T	6	6	5815	5820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019735	CTTT	2	8	5822	5829	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019735	GA	3	6	9313	9318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019735	ATT	2	6	9352	9357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019735	ATATT	2	10	9420	9429	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019735	GAC	2	6	9509	9514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019735	ATT	2	6	14182	14187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019735	T	6	6	17307	17312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019735	CTTA	2	8	17317	17324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019735	ACA	2	6	17965	17970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019735	GAT	2	6	17980	17985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019735	AAC	2	6	18090	18095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019735	TAA	2	6	18185	18190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019735	AGT	2	6	18235	18240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019735	TAA	2	6	18260	18265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019735	CTG	2	6	18291	18296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019735	TAA	2	6	18332	18337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019735	ACT	2	6	18344	18349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019735	AAT	2	6	18363	18368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019735	CAG	2	6	18370	18375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019735	A	6	6	18403	18408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019735	AAT	2	6	18414	18419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019735	CCT	2	6	21195	21200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_019735	AT	4	8	21247	21254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019735	TG	3	6	21258	21263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019735	ATT	2	6	21321	21326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019735	GTACT	2	10	21349	21358	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_019735	GTT	2	6	21649	21654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019735	TGT	2	6	21688	21693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019735	ATTTA	2	10	21735	21744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019735	TA	3	6	21743	21748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019735	A	6	6	21754	21759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019735	ATGATT	2	12	21777	21788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019735	AAG	2	6	21812	21817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019735	ATTA	2	8	21832	21839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019735	AAT	2	6	21844	21849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019735	ATT	2	6	21855	21860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019735	ACT	2	6	21879	21884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019735	ATTT	2	8	22170	22177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019735	TGTTA	2	10	22212	22221	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019735	TGTA	2	8	22240	22247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019735	ACCA	2	8	22276	22283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019735	ATA	2	6	26481	26486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019735	AG	3	6	26854	26859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019735	ATT	2	6	26887	26892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019735	A	6	6	26949	26954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019735	TAG	2	6	27020	27025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019735	AT	3	6	27660	27665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019735	TAA	2	6	27709	27714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019735	C	6	6	27749	27754	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_019735	GAG	2	6	27779	27784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019735	A	7	7	27868	27874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019735	CAT	2	6	27929	27934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019735	ACCA	2	8	27985	27992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019735	C	6	6	29729	29734	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115	NC_019735	TTA	2	6	29745	29750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019735	A	6	6	29766	29771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019735	TAC	2	6	29866	29871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019735	CT	3	6	29887	29892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_019735	T	7	7	29905	29911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019735	T	8	8	29925	29932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019735	CTC	2	6	30080	30085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_019735	CA	3	6	30107	30112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019735	ACT	2	6	30154	30159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019735	A	6	6	30244	30249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019735	TATT	2	8	30265	30272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019735	AAGGTA	2	12	30279	30290	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019735	A	6	6	30296	30301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019735	TAGCAA	2	12	30362	30373	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_019735	TA	3	6	30404	30409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019735	TA	3	6	30413	30418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019735	TAT	2	6	30440	30445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019735	TAAA	2	8	30449	30456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019735	TAAT	2	8	30508	30515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019735	ATA	2	6	30518	30523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019735	TAA	2	6	30541	30546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019735	AGT	2	6	30657	30662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019735	TAA	2	6	30675	30680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019735	TAA	2	6	30714	30719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019735	TTG	2	6	30732	30737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019735	TGT	2	6	30751	30756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019735	AG	3	6	30863	30868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019735	CGTT	2	8	30871	30878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019735	AAT	2	6	30892	30897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019735	ACTG	2	8	30907	30914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_019735	TTA	2	6	30916	30921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019735	GTC	2	6	33569	33574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_019735	ATT	2	6	33582	33587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019735	T	6	6	33600	33605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019735	TAAC	2	8	33759	33766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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172	NC_019735	AT	3	6	35749	35754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_019735	T	6	6	35794	35799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_019735	CAC	2	6	36294	36299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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185	NC_019735	TACT	2	8	36881	36888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
186	NC_019735	AAG	2	6	36921	36926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.