MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.02

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019734	GTTTG	2	10	3747	3756	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019734	AGAAT	2	10	4082	4091	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019734	GTTTA	2	10	4273	4282	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019734	GAAGA	2	10	4288	4297	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019734	AGTTT	2	10	4640	4649	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019734	GAAAG	2	10	19561	19570	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019734	CGTTC	2	10	24087	24096	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_019734	CCCCT	2	10	24291	24300	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
9	NC_019734	AAGTC	2	10	26420	26429	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_019734	ACAAT	2	10	28976	28985	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019734	GTCTT	2	10	29641	29650	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019734	CGTTC	2	10	35697	35706	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_019734	GATAC	2	10	35715	35724	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019734	GACTT	2	10	37860	37869	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019734	AGTTT	2	10	40423	40432	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019734	GTGAG	2	10	42226	42235	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019734	TGCAA	2	10	44272	44281	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019734	AGTGC	2	10	44296	44305	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_019734	TCAAA	2	10	44611	44620	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019734	GATTT	2	10	50093	50102	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019734	ACTGC	2	10	52998	53007	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_019734	TAGTG	2	10	53199	53208	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.