MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.02

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019734	CTTG	2	8	47	54	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019734	AACG	2	8	145	152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019734	GAGT	2	8	202	209	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019734	AAGC	2	8	2270	2277	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019734	TTTG	2	8	3816	3823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019734	CTGA	2	8	3911	3918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019734	GCAA	2	8	4019	4026	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019734	AGAA	2	8	4335	4342	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019734	CTTC	2	8	4357	4364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019734	GAAA	2	8	4654	4661	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019734	TTGA	2	8	9562	9569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019734	ATCC	2	8	9602	9609	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019734	CTCA	2	8	9874	9881	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019734	ATTA	2	8	10845	10852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019734	TATT	2	8	10883	10890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019734	TAAT	2	8	10932	10939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019734	ATAC	2	8	12056	12063	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019734	AGAA	2	8	12097	12104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019734	ATTA	2	8	12634	12641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019734	AAGC	2	8	12670	12677	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019734	GCTC	2	8	18449	18456	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019734	TAAT	2	8	19665	19672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019734	ACCA	2	8	20062	20069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019734	GATC	2	8	20113	20120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019734	GTTA	2	8	23342	23349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019734	TTAA	2	8	24896	24903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019734	TGAG	2	8	25959	25966	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019734	ACTT	2	8	26291	26298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019734	TTAC	2	8	26510	26517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019734	AGTT	2	8	26563	26570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019734	TGAT	2	8	26611	26618	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019734	TTGT	2	8	26772	26779	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019734	AGGG	2	8	27021	27028	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019734	AAAT	2	8	29716	29723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019734	TCCC	2	8	37260	37267	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_019734	ATCA	2	8	37671	37678	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019734	CTAA	2	8	37717	37724	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019734	GTAA	2	8	37772	37779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019734	AAGT	2	8	37991	37998	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019734	CTCA	2	8	38323	38330	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019734	TTAA	2	8	39386	39393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019734	TCAA	2	8	42662	42669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019734	TTAA	2	8	44037	44044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019734	CGAG	2	8	44692	44699	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019734	AAAT	2	8	44728	44735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019734	TTAA	2	8	48092	48099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019734	TTAT	2	8	48129	48136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019734	ATCC	2	8	50128	50135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019734	TCTA	2	8	50211	50218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.