MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.01

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019733	TGCT	2	8	3	10	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019733	ATTA	2	8	318	325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019733	AGAA	2	8	447	454	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019733	TAAA	2	8	1486	1493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019733	CAAT	2	8	6341	6348	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019733	AATG	2	8	8555	8562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019733	ATTA	2	8	8660	8667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019733	TAGG	2	8	9741	9748	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019733	AATT	2	8	10029	10036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019733	CCAA	2	8	10082	10089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019733	AAAC	2	8	11750	11757	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019733	TCTA	2	8	12611	12618	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019733	ATTA	3	12	12882	12893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019733	TTTA	2	8	13085	13092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019733	TGCG	2	8	16079	16086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019733	TAAC	2	8	16337	16344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019733	CCTG	2	8	20712	20719	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019733	AAAC	2	8	20792	20799	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019733	TCTT	2	8	20846	20853	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019733	TTAA	2	8	21116	21123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019733	CTTA	2	8	22317	22324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019733	CTTA	2	8	23008	23015	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019733	ATAC	2	8	24970	24977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019733	CTTT	2	8	28456	28463	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019733	GAAA	2	8	36001	36008	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019733	ACTA	2	8	36084	36091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019733	TAAA	2	8	36189	36196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019733	AAAT	2	8	36988	36995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019733	AATT	2	8	41380	41387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019733	AATT	2	8	45639	45646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019733	TAGT	2	8	45762	45769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019733	TTGA	2	8	45801	45808	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019733	GAAC	2	8	45963	45970	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019733	CAGT	2	8	45972	45979	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019733	AAGT	2	8	46033	46040	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019733	GATA	2	8	46103	46110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019733	AATT	2	8	46549	46556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019733	CTTT	2	8	46639	46646	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019733	TTTG	2	8	46786	46793	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019733	TCAT	2	8	47133	47140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019733	TGGC	2	8	47239	47246	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019733	AAAG	2	8	47383	47390	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019733	TTTG	2	8	47544	47551	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019733	ATTG	2	8	47590	47597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019733	TCAT	2	8	47751	47758	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019733	TAAC	2	8	47770	47777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019733	GTTT	2	8	52092	52099	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019733	TAAT	2	8	52276	52283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.