MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 plasmid pCAL6303.02

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019728	ATG	2	6	52	57	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019728	AAC	2	6	1003	1008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019728	TAA	2	6	5776	5781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019728	TTA	2	6	5784	5789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019728	TAA	2	6	10785	10790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019728	AAG	2	6	10997	11002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019728	GCA	2	6	11016	11021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019728	GCC	2	6	17541	17546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_019728	GAA	2	6	17635	17640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019728	AGA	2	6	17667	17672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019728	GAT	2	6	17817	17822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019728	ATT	2	6	19983	19988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019728	TGG	2	6	20162	20167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019728	AAT	2	6	20200	20205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019728	AAC	2	6	20573	20578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019728	GGA	2	6	20594	20599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019728	CTC	2	6	20605	20610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_019728	CTT	2	6	20886	20891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019728	TCA	2	6	20905	20910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019728	CAA	2	6	21153	21158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019728	CGC	2	6	21201	21206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_019728	GAA	2	6	21282	21287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019728	CGT	2	6	21346	21351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019728	TTC	2	6	21398	21403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019728	CAT	2	6	21462	21467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019728	AAG	2	6	21470	21475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019728	CAT	2	6	21518	21523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019728	TGA	2	6	21570	21575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019728	TTA	2	6	21589	21594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019728	CTT	2	6	21615	21620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019728	TTC	2	6	21717	21722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019728	CAG	2	6	21902	21907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019728	GAA	2	6	21931	21936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019728	CAA	2	6	22072	22077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019728	AGA	2	6	22086	22091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019728	AAG	2	6	22247	22252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019728	TAA	2	6	22301	22306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019728	TAA	2	6	24657	24662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019728	TAA	2	6	24675	24680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019728	TAA	2	6	25597	25602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019728	AAG	2	6	25679	25684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019728	AAT	2	6	27109	27114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019728	TTG	2	6	27158	27163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019728	GTT	3	9	27555	27563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019728	GTT	3	9	27570	27578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019728	GTT	2	6	27595	27600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019728	GCG	2	6	27620	27625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019728	TAA	2	6	27788	27793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019728	TAA	2	6	27809	27814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019728	AAT	2	6	27837	27842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019728	TAT	2	6	27913	27918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019728	CGT	2	6	27976	27981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019728	GTC	2	6	28069	28074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019728	ATT	2	6	29198	29203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019728	TTC	2	6	31041	31046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019728	AAT	2	6	31624	31629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019728	TAA	2	6	31725	31730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019728	AAC	2	6	32159	32164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019728	AAT	2	6	32678	32683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019728	TAA	2	6	32837	32842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019728	TAA	2	6	32915	32920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019728	CTA	2	6	32945	32950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019728	CAG	2	6	32957	32962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019728	TGA	2	6	32975	32980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019728	TAT	2	6	33094	33099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019728	TAT	2	6	33102	33107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019728	CAT	2	6	33206	33211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019728	TGA	2	6	35518	35523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019728	TGT	2	6	35647	35652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019728	ATC	2	6	36346	36351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019728	TGT	2	6	36401	36406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019728	AAT	2	6	36434	36439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019728	TAT	2	6	37720	37725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019728	GAC	2	6	37752	37757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019728	GTA	2	6	37819	37824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019728	CTT	2	6	38042	38047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019728	TTG	2	6	38118	38123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019728	TCT	3	9	38246	38254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019728	TTG	2	6	38264	38269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019728	GCC	2	6	38296	38301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_019728	ACC	2	6	38623	38628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_019728	ATT	2	6	38629	38634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019728	CAG	2	6	38674	38679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019728	ATG	2	6	38815	38820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019728	GAG	2	6	38832	38837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019728	GCA	2	6	38864	38869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019728	GAT	2	6	38925	38930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019728	CAG	2	6	38937	38942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019728	GAA	2	6	39448	39453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019728	CGA	2	6	39531	39536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019728	CGA	3	9	39544	39552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019728	GTT	2	6	39626	39631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019728	TGG	2	6	39641	39646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019728	CAA	2	6	39666	39671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019728	TGT	2	6	45236	45241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019728	AAC	2	6	45364	45369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019728	TTG	2	6	45636	45641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019728	TCA	2	6	45747	45752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019728	TAC	2	6	45762	45767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019728	AAT	2	6	45871	45876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019728	AAT	2	6	46561	46566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019728	AAT	2	6	46586	46591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019728	GAA	2	6	46751	46756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019728	ATT	2	6	46768	46773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019728	GAA	2	6	46853	46858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019728	AGT	2	6	47931	47936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019728	ACA	2	6	49103	49108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019728	TTG	2	6	49133	49138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019728	AAC	2	6	49145	49150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019728	ACA	2	6	49165	49170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019728	AAT	2	6	49211	49216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019728	TGA	2	6	49354	49359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019728	TAT	2	6	51036	51041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019728	TAA	2	6	51489	51494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019728	AAT	2	6	51592	51597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019728	ACT	2	6	51768	51773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019728	AAT	2	6	51852	51857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019728	ATT	2	6	51871	51876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019728	GAA	2	6	51928	51933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019728	TTC	2	6	52818	52823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019728	CAC	2	6	52855	52860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_019728	CAA	2	6	52881	52886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019728	GAG	2	6	52913	52918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019728	ACG	2	6	52921	52926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019728	TTA	2	6	53025	53030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019728	CAC	2	6	53185	53190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_019728	ATT	2	6	53326	53331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019728	ATT	2	6	53366	53371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019728	ATA	2	6	55475	55480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019728	GTC	2	6	55549	55554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019728	CAA	3	9	55686	55694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019728	TCC	2	6	55699	55704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_019728	CTG	2	6	55778	55783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019728	TGT	2	6	55799	55804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019728	TAA	2	6	56314	56319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019728	TAT	2	6	56331	56336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019728	ATT	2	6	56344	56349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019728	TAT	2	6	56351	56356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019728	ACT	2	6	56401	56406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.