MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019699	TC	3	6	3220	3225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019699	AG	3	6	5931	5936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019699	AC	3	6	6141	6146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019699	TC	3	6	9802	9807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019699	CT	3	6	9962	9967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019699	CT	3	6	12797	12802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019699	CA	3	6	18574	18579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019699	TC	3	6	19743	19748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019699	AT	3	6	20624	20629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019699	AT	3	6	25801	25806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019699	GC	3	6	28036	28041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019699	AT	3	6	29207	29212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019699	AT	3	6	34163	34168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019699	TA	4	8	41796	41803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019699	AG	3	6	52984	52989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019699	AG	3	6	55930	55935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019699	AG	3	6	60501	60506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019699	TA	3	6	79335	79340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019699	CT	3	6	84387	84392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019699	CT	4	8	85114	85121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019699	GA	3	6	88709	88714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019699	GT	3	6	89662	89667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019699	GA	3	6	90053	90058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019699	CT	3	6	90373	90378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019699	TA	3	6	91253	91258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019699	TG	3	6	93150	93155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019699	CA	4	8	93946	93953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019699	AC	3	6	96560	96565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019699	GA	3	6	102265	102270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019699	TC	3	6	102401	102406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019699	TC	3	6	107255	107260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019699	AT	3	6	117496	117501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019699	CA	3	6	118814	118819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019699	AC	3	6	119452	119457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019699	TA	3	6	123062	123067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019699	TG	3	6	128926	128931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019699	CT	3	6	131181	131186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019699	TC	3	6	131385	131390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019699	CT	3	6	135589	135594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019699	CT	3	6	135669	135674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019699	CT	3	6	140728	140733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019699	GA	3	6	140785	140790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019699	GA	3	6	143381	143386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019699	AT	4	8	151135	151142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019699	GA	3	6	152067	152072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019699	TG	3	6	154849	154854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019699	GA	3	6	155029	155034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019699	GA	3	6	155516	155521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019699	CG	3	6	157382	157387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019699	GA	4	8	158224	158231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019699	TC	3	6	160867	160872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019699	CA	3	6	166075	166080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019699	GC	3	6	168668	168673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019699	CG	4	8	168933	168940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019699	CG	3	6	169533	169538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019699	AT	3	6	169807	169812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019699	CG	3	6	170434	170439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019699	CA	3	6	173093	173098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019699	AT	3	6	173467	173472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019699	CA	3	6	173928	173933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019699	TG	3	6	181917	181922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019699	CA	3	6	182284	182289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019699	GA	3	6	182406	182411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019699	GA	3	6	183178	183183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019699	CT	3	6	183264	183269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019699	AC	3	6	184870	184875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019699	AT	3	6	191533	191538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019699	CG	3	6	201331	201336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_019699	TC	3	6	202868	202873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_019699	CA	3	6	210980	210985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019699	AG	3	6	211385	211390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019699	CT	3	6	219671	219676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019699	CA	3	6	228904	228909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019699	AT	3	6	232446	232451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019699	AT	3	6	233694	233699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019699	AT	4	8	236262	236269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019699	TA	3	6	236930	236935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019699	CT	3	6	237744	237749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019699	TC	3	6	240151	240156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019699	GC	3	6	241671	241676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019699	TC	3	6	243009	243014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019699	AT	3	6	257298	257303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019699	TA	3	6	261770	261775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019699	TC	3	6	265271	265276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019699	GA	3	6	273194	273199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019699	GA	3	6	274011	274016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019699	CG	3	6	274332	274337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019699	TA	3	6	274687	274692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019699	AT	3	6	274825	274830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019699	CA	3	6	276535	276540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019699	TC	3	6	276662	276667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019699	TC	3	6	276901	276906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019699	AT	3	6	286903	286908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019699	TA	3	6	302057	302062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019699	TC	3	6	305377	305382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019699	CT	3	6	305539	305544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019699	TC	3	6	314894	314899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019699	AG	4	8	315551	315558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019699	TC	3	6	322642	322647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019699	TA	3	6	324553	324558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019699	AT	3	6	331098	331103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019699	AG	3	6	335749	335754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019699	TA	3	6	336063	336068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019699	TG	3	6	337920	337925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019699	CT	3	6	347494	347499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019699	AG	3	6	351152	351157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019699	CG	3	6	361447	361452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019699	CA	3	6	361738	361743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019699	TC	3	6	364269	364274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019699	AC	3	6	366079	366084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019699	TC	3	6	368080	368085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019699	CT	3	6	368276	368281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019699	TC	3	6	369551	369556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019699	AC	3	6	369658	369663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019699	CA	3	6	370718	370723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.