MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019699	ACTTT	2	10	9981	9990	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019699	GCAAC	2	10	12706	12715	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_019699	TTCAA	2	10	18609	18618	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019699	CTTGG	2	10	20065	20074	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019699	TCTCT	2	10	25739	25748	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_019699	TTGAC	2	10	26852	26861	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019699	AGATA	2	10	28095	28104	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019699	AGGGC	2	10	28414	28423	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019699	TTGCC	2	10	40376	40385	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_019699	TCTAG	2	10	46750	46759	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019699	GAAAT	2	10	52669	52678	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019699	GAAAT	2	10	55809	55818	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019699	CGCTA	2	10	71181	71190	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_019699	AATTC	2	10	93997	94006	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019699	CACTA	2	10	94748	94757	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_019699	AAGTG	2	10	102504	102513	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019699	AGTTT	2	10	105666	105675	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019699	GGTTA	2	10	105998	106007	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019699	GAAAT	2	10	117522	117531	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019699	ACACG	2	10	120877	120886	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_019699	CTAAG	2	10	123239	123248	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019699	TCCAC	2	10	132435	132444	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_019699	ATAGG	2	10	133053	133062	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019699	TTTGC	2	10	140794	140803	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019699	CCAGA	2	10	151625	151634	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_019699	GCTAC	2	10	156395	156404	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_019699	GCGCC	2	10	168874	168883	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_019699	CAACT	2	10	184308	184317	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_019699	AAATG	2	10	207670	207679	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019699	ATCTT	2	10	211114	211123	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_019699	GTAGA	2	10	236858	236867	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019699	TTCAC	2	10	241880	241889	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_019699	GGCAT	2	10	271388	271397	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_019699	GGAAA	2	10	278728	278737	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019699	TTGTA	2	10	288994	289003	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019699	ACATA	2	10	315044	315053	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_019699	CTCGA	2	10	315079	315088	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_019699	TACCC	2	10	322663	322672	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_019699	AATTT	2	10	323398	323407	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019699	ATAGC	2	10	324865	324874	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_019699	TTCAA	2	10	328058	328067	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019699	TCGGT	2	10	339172	339181	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_019699	CAAGT	2	10	361573	361582	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019699	ACTCA	2	10	364241	364250	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.