MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01

Total Repeats: 1541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019699	TGA	2	6	202929	202934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_019699	AAT	2	6	202995	203000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019699	ATT	2	6	203015	203020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019699	T	6	6	204989	204994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_019699	TGCAAT	2	12	205015	205026	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1006	NC_019699	CTA	2	6	205067	205072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_019699	TTA	2	6	205109	205114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_019699	GCGA	2	8	207356	207363	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_019699	TTC	2	6	207372	207377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_019699	T	6	6	207380	207385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019699	AGT	2	6	207403	207408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_019699	TGGC	2	8	207443	207450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_019699	TTG	2	6	207475	207480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_019699	ATT	2	6	207486	207491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019699	TAA	2	6	207544	207549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_019699	TCT	2	6	207593	207598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_019699	AGT	2	6	207646	207651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_019699	AAATG	2	10	207670	207679	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_019699	TACT	2	8	207687	207694	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_019699	ATT	2	6	207702	207707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_019699	CTC	2	6	207710	207715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_019699	TAT	2	6	208922	208927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_019699	ACG	2	6	208939	208944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_019699	CCG	2	6	208959	208964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_019699	GCTT	2	8	208998	209005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_019699	TGC	2	6	210292	210297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_019699	AGCA	2	8	210412	210419	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_019699	TTGA	2	8	210769	210776	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_019699	TGC	2	6	210862	210867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_019699	TGA	2	6	210943	210948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_019699	AGG	2	6	210953	210958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_019699	CAA	2	6	210965	210970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_019699	CA	3	6	210980	210985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_019699	ATAA	2	8	211044	211051	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_019699	TGG	2	6	211084	211089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_019699	ATCTT	2	10	211114	211123	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1037	NC_019699	T	6	6	211122	211127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_019699	CAG	2	6	211300	211305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_019699	CTG	2	6	211329	211334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_019699	ATTA	2	8	211353	211360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_019699	AG	3	6	211385	211390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_019699	GCT	2	6	215041	215046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_019699	AAG	2	6	215055	215060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_019699	CGC	2	6	216162	216167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_019699	AAT	2	6	216196	216201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019699	AGC	2	6	216249	216254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_019699	GATT	2	8	216300	216307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_019699	CAA	2	6	216310	216315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_019699	TGA	2	6	216384	216389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019699	TGA	2	6	216505	216510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_019699	CGG	2	6	216548	216553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_019699	CTC	2	6	217068	217073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_019699	GAA	2	6	217080	217085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_019699	CTT	2	6	217140	217145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_019699	ACG	2	6	217786	217791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_019699	CGG	2	6	217795	217800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_019699	CCG	2	6	217807	217812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_019699	TTG	2	6	219153	219158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_019699	TAA	2	6	219381	219386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_019699	AGG	2	6	219499	219504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019699	TAG	2	6	219512	219517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_019699	TCA	2	6	219567	219572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_019699	CT	3	6	219671	219676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_019699	CTG	2	6	219733	219738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_019699	ATA	2	6	220016	220021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_019699	ATAG	2	8	220722	220729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_019699	TGC	2	6	220730	220735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_019699	TTC	2	6	220761	220766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_019699	GCA	2	6	220777	220782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_019699	A	7	7	220782	220788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_019699	TAA	2	6	220836	220841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_019699	TTAC	2	8	220860	220867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_019699	TCGA	2	8	223476	223483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_019699	GAGT	2	8	223508	223515	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_019699	GTC	2	6	223528	223533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_019699	TGA	2	6	224102	224107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_019699	TTC	2	6	224109	224114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_019699	TAT	2	6	224172	224177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_019699	CTG	2	6	224185	224190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_019699	T	6	6	224201	224206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_019699	AAGA	2	8	224210	224217	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_019699	TTG	2	6	225091	225096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_019699	TTA	2	6	225579	225584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_019699	GATC	2	8	225637	225644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_019699	GCA	2	6	225650	225655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_019699	TAT	2	6	226999	227004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_019699	CGG	2	6	227014	227019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_019699	T	6	6	227047	227052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_019699	ATC	2	6	227053	227058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_019699	CGC	2	6	228334	228339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_019699	CATA	2	8	228341	228348	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_019699	GAC	2	6	228382	228387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_019699	CA	3	6	228904	228909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_019699	TAGA	2	8	228951	228958	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_019699	ATG	2	6	229960	229965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_019699	CCAT	2	8	229981	229988	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_019699	TAA	2	6	229994	229999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_019699	TGT	2	6	230002	230007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_019699	ACT	2	6	230013	230018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_019699	TATT	2	8	230517	230524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_019699	CTG	2	6	230525	230530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_019699	ATTA	2	8	230574	230581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_019699	ATCG	2	8	230595	230602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_019699	CTG	2	6	230618	230623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_019699	ATG	2	6	230624	230629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_019699	CAC	2	6	230639	230644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_019699	GCA	2	6	230727	230732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_019699	GCT	2	6	230758	230763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_019699	TTA	2	6	231583	231588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_019699	A	7	7	231661	231667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_019699	CTTT	2	8	231668	231675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_019699	TTG	2	6	231848	231853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_019699	TAAT	2	8	231978	231985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_019699	ATT	2	6	231993	231998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019699	AGC	2	6	232244	232249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_019699	GGGA	2	8	232349	232356	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_019699	ATT	2	6	232388	232393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_019699	AT	3	6	232446	232451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_019699	GCA	2	6	232852	232857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_019699	TTG	2	6	232881	232886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_019699	AGA	2	6	232933	232938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_019699	CTC	2	6	233494	233499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_019699	CAT	2	6	233678	233683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_019699	TGC	2	6	233688	233693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_019699	AT	3	6	233694	233699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_019699	CAC	2	6	233711	233716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_019699	TTCA	2	8	233771	233778	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_019699	TTC	2	6	233834	233839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_019699	ACA	2	6	235160	235165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_019699	GTT	2	6	235341	235346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_019699	GCT	2	6	235363	235368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_019699	TGA	2	6	235407	235412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_019699	CTA	2	6	235472	235477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_019699	AAAT	2	8	235527	235534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_019699	TGC	2	6	235569	235574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_019699	AGC	2	6	235680	235685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_019699	ACC	2	6	235779	235784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1138	NC_019699	CGC	2	6	235809	235814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1139	NC_019699	TTG	2	6	235827	235832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_019699	GTA	2	6	235980	235985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1142	NC_019699	TGGT	2	8	236073	236080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_019699	CAG	2	6	236153	236158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1145	NC_019699	GTT	2	6	236289	236294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1165	NC_019699	GTC	2	6	239608	239613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1167	NC_019699	TTC	2	6	239660	239665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1179	NC_019699	TTCAC	2	10	241880	241889	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1252	NC_019699	ACC	2	6	274365	274370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1253	NC_019699	TCGA	2	8	274404	274411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1254	NC_019699	CTA	2	6	274554	274559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1255	NC_019699	CTC	2	6	274604	274609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1256	NC_019699	AAT	2	6	274653	274658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1259	NC_019699	T	6	6	274870	274875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1266	NC_019699	TGC	2	6	276381	276386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1268	NC_019699	CCA	2	6	276577	276582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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