MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605

Total Repeats: 25468

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019697	TCA	2	6	155877	155882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_019697	CAC	2	6	155895	155900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_019697	CAT	2	6	155943	155948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_019697	CGT	2	6	156157	156162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_019697	CGCCAC	2	12	156183	156194	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_019697	A	6	6	156381	156386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_019697	ATT	2	6	156394	156399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_019697	ATCG	2	8	156499	156506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
509	NC_019697	AT	3	6	156629	156634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_019697	CGAT	2	8	156661	156668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
511	NC_019697	CTA	2	6	156678	156683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_019697	GCG	2	6	156708	156713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_019697	TGTCT	2	10	157632	157641	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
514	NC_019697	CGG	2	6	157656	157661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_019697	GC	3	6	157674	157679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_019697	ACGC	2	8	157693	157700	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
517	NC_019697	CGAG	2	8	157821	157828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
518	NC_019697	TAGT	2	8	157845	157852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_019697	AGT	2	6	157865	157870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_019697	AG	3	6	158548	158553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_019697	AGC	2	6	158576	158581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_019697	AGA	2	6	158637	158642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_019697	CAGC	2	8	158652	158659	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
524	NC_019697	C	6	6	158756	158761	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
525	NC_019697	AGT	2	6	159766	159771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_019697	GGT	2	6	159840	159845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_019697	AAGAA	2	10	159853	159862	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
528	NC_019697	CTG	2	6	159959	159964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_019697	ACC	2	6	159971	159976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_019697	CA	4	8	159987	159994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_019697	TTG	2	6	160037	160042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_019697	GAG	2	6	160043	160048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_019697	TAA	2	6	160119	160124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_019697	TA	3	6	160232	160237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_019697	ATA	2	6	160618	160623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_019697	CAT	2	6	160651	160656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_019697	CGAT	2	8	161798	161805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
538	NC_019697	TGC	2	6	161940	161945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_019697	T	8	8	162014	162021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_019697	ATC	2	6	162512	162517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_019697	GAT	2	6	162550	162555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_019697	AAAT	2	8	162576	162583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_019697	CGA	2	6	162604	162609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_019697	ATC	2	6	162638	162643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_019697	CCA	2	6	162670	162675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_019697	GCATA	2	10	162688	162697	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
547	NC_019697	AAT	2	6	162705	162710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_019697	AG	4	8	162728	162735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_019697	TGG	2	6	162747	162752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_019697	GAC	2	6	162772	162777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_019697	ACT	3	9	162871	162879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_019697	AGGA	2	8	162895	162902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_019697	TAA	2	6	162933	162938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_019697	CGAG	2	8	164568	164575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
555	NC_019697	TAA	2	6	165990	165995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_019697	TAT	3	9	166025	166033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_019697	ATTC	2	8	166043	166050	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
558	NC_019697	ATG	2	6	166747	166752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_019697	ACTA	2	8	166774	166781	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
560	NC_019697	A	6	6	166794	166799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_019697	AGT	2	6	166804	166809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_019697	CTT	2	6	166845	166850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_019697	GAT	2	6	166859	166864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_019697	ATTT	2	8	166882	166889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_019697	CGAT	2	8	166967	166974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
566	NC_019697	GAGAG	2	10	168471	168480	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
567	NC_019697	AAGT	2	8	168490	168497	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_019697	GCT	2	6	168518	168523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_019697	TAA	2	6	168673	168678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_019697	A	6	6	168956	168961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_019697	CGA	2	6	169011	169016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_019697	GA	3	6	169019	169024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_019697	GAT	2	6	169052	169057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_019697	ATGT	2	8	169085	169092	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
575	NC_019697	TAAC	2	8	169135	169142	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
576	NC_019697	CGA	2	6	170550	170555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_019697	CGAT	2	8	171510	171517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
578	NC_019697	CGG	2	6	171619	171624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_019697	TCA	2	6	171630	171635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_019697	TAG	2	6	172419	172424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_019697	TTA	2	6	172425	172430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_019697	GAA	2	6	172507	172512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_019697	G	6	6	172513	172518	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
584	NC_019697	GA	3	6	172522	172527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_019697	GAG	2	6	172529	172534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_019697	AG	3	6	172533	172538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_019697	GC	3	6	172613	172618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_019697	GATC	2	8	172659	172666	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
589	NC_019697	TAGG	2	8	175760	175767	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_019697	TAGG	2	8	175778	175785	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_019697	CCA	2	6	175797	175802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_019697	CAACC	2	10	176724	176733	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
593	NC_019697	ATTT	2	8	177144	177151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_019697	CGCA	2	8	177184	177191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
595	NC_019697	ACTGC	2	10	177210	177219	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
596	NC_019697	CTC	2	6	177267	177272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_019697	ACA	2	6	177273	177278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_019697	TCC	2	6	178737	178742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_019697	ATA	2	6	179544	179549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_019697	TGGA	2	8	179555	179562	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_019697	A	6	6	179628	179633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_019697	TAG	2	6	179675	179680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_019697	TCGA	2	8	179755	179762	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
604	NC_019697	ATCTCG	2	12	179770	179781	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_019697	CTGT	2	8	180379	180386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_019697	T	6	6	180402	180407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_019697	ATA	2	6	180451	180456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_019697	CGAT	2	8	180486	180493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
609	NC_019697	GAC	2	6	180507	180512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_019697	CGAT	2	8	180513	180520	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
611	NC_019697	AT	3	6	180535	180540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_019697	AGC	2	6	180600	180605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_019697	GCA	3	9	180615	180623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_019697	GTTG	2	8	181145	181152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_019697	AGA	2	6	181278	181283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_019697	CGA	2	6	181923	181928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_019697	GAA	2	6	181981	181986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_019697	GTT	2	6	181996	182001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_019697	GCT	2	6	182007	182012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_019697	GCG	2	6	182047	182052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_019697	G	6	6	183512	183517	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
622	NC_019697	GAG	2	6	183528	183533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_019697	CCA	2	6	183617	183622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_019697	ACA	2	6	183677	183682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_019697	CAA	2	6	183691	183696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_019697	GCG	2	6	183723	183728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_019697	GCGT	2	8	183755	183762	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
628	NC_019697	TGTCT	2	10	183844	183853	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
629	NC_019697	G	6	6	184036	184041	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
630	NC_019697	CG	3	6	184059	184064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
631	NC_019697	CTC	2	6	184065	184070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_019697	GA	3	6	184161	184166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_019697	AGT	2	6	185488	185493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_019697	ATT	2	6	186944	186949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_019697	T	6	6	186948	186953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_019697	AAC	2	6	186970	186975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_019697	G	7	7	189696	189702	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_019697	TAA	2	6	189796	189801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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