MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 3595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019695	GCTC	2	8	2023	2030	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019695	TTCG	2	8	3843	3850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019695	ATCG	2	8	4003	4010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019695	TCTA	2	8	4086	4093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019695	GTTT	2	8	4341	4348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019695	GAAA	2	8	4719	4726	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019695	ACAA	2	8	4731	4738	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019695	TAGT	2	8	5810	5817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019695	CGGG	2	8	5858	5865	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019695	ATCG	2	8	6586	6593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019695	TTCT	2	8	7126	7133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019695	AGTA	2	8	8313	8320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019695	CAGA	2	8	8321	8328	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019695	CTGT	2	8	8343	8350	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019695	AGAA	2	8	9489	9496	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019695	TGGT	2	8	10808	10815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019695	CAAT	2	8	16599	16606	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019695	CGAG	2	8	17039	17046	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019695	ATAA	2	8	18331	18338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019695	TAAG	2	8	26845	26852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019695	TTGG	2	8	26884	26891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019695	TCTA	2	8	30189	30196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019695	GTTG	2	8	34445	34452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019695	ACCA	2	8	38020	38027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019695	ATCA	2	8	39291	39298	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019695	CGAT	2	8	58644	58651	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019695	CGAT	2	8	58770	58777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019695	AACA	2	8	58813	58820	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019695	TCAT	2	8	58846	58853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019695	TTTA	2	8	59963	59970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019695	TAAA	2	8	64075	64082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019695	TAAA	2	8	64153	64160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019695	GCTC	2	8	64477	64484	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019695	CGGG	2	8	66692	66699	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019695	CCAT	2	8	68556	68563	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019695	TTTA	2	8	68759	68766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019695	TTTA	2	8	68883	68890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019695	ATAA	2	8	69112	69119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019695	CGGG	2	8	72784	72791	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019695	TTTA	2	8	75641	75648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019695	ATGA	2	8	75729	75736	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019695	TTAG	2	8	75867	75874	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019695	ATTT	2	8	75932	75939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019695	CCCG	2	8	76041	76048	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_019695	ATCG	2	8	78375	78382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019695	TTTC	2	8	79672	79679	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019695	TGCT	2	8	82260	82267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019695	ACTG	2	8	88177	88184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019695	TACA	2	8	88246	88253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019695	AGAT	2	8	88259	88266	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019695	GCTT	2	8	92895	92902	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019695	GGCT	2	8	92990	92997	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019695	CAAT	2	8	93072	93079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019695	ACAA	2	8	97362	97369	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019695	ACAA	2	8	97376	97383	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019695	TTCT	2	8	99566	99573	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019695	ATTA	2	8	99895	99902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019695	TAAA	2	8	99922	99929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019695	AGTC	2	8	100174	100181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019695	CAAA	2	8	100218	100225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019695	AATT	2	8	101044	101051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019695	ATTT	2	8	104444	104451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019695	GCTA	2	8	104466	104473	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019695	TTAA	2	8	104575	104582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019695	TACT	2	8	111125	111132	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019695	TTTA	2	8	111231	111238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019695	GATC	2	8	114091	114098	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019695	GTTA	2	8	115424	115431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019695	TGCT	2	8	115633	115640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019695	AAAT	2	8	115940	115947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019695	ACCC	2	8	116121	116128	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_019695	CGAT	2	8	117226	117233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019695	ATAA	2	8	119382	119389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019695	GCTA	2	8	119510	119517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019695	TATG	2	8	120167	120174	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019695	TGCG	2	8	120200	120207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019695	CATT	2	8	120345	120352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019695	CAAC	2	8	120437	120444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019695	ACCT	2	8	122969	122976	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019695	ATCG	2	8	128970	128977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019695	ATTA	2	8	130785	130792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019695	GTTT	2	8	132530	132537	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019695	CAGT	2	8	132701	132708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019695	AAAC	2	8	132880	132887	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019695	ACTT	2	8	134178	134185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019695	TCAT	2	8	134273	134280	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019695	GTCT	2	8	135746	135753	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019695	ACGG	2	8	138018	138025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019695	AATT	2	8	139873	139880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019695	TTTA	2	8	140146	140153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019695	CGAT	2	8	140199	140206	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019695	GATC	2	8	140344	140351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019695	TACA	2	8	140392	140399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019695	AGCT	2	8	140612	140619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_019695	AACA	2	8	140668	140675	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019695	TTAA	2	8	140911	140918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019695	ATAA	2	8	142498	142505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019695	TAGT	2	8	152731	152738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019695	CAAG	2	8	154522	154529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019695	GCGA	2	8	160405	160412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019695	CGAT	2	8	163518	163525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019695	ATCG	2	8	164889	164896	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019695	TCAA	2	8	166965	166972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019695	AGCT	2	8	172841	172848	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019695	TGCT	2	8	173205	173212	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019695	GCTC	2	8	176061	176068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019695	TCGA	2	8	176121	176128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019695	TAGA	2	8	176522	176529	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019695	GTAC	2	8	176604	176611	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019695	ATCT	2	8	181445	181452	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_019695	TTAT	2	8	183238	183245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019695	TAAA	2	8	183246	183253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019695	AGTA	2	8	184236	184243	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019695	GATC	2	8	184436	184443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019695	CTTA	2	8	198453	198460	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019695	TGGT	2	8	202478	202485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019695	TGAA	2	8	203396	203403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019695	TACC	2	8	203629	203636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_019695	ATTG	2	8	203911	203918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019695	TAAA	2	8	204030	204037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019695	AGGA	2	8	204326	204333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019695	AGTA	2	8	205893	205900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019695	GGAT	2	8	208212	208219	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019695	CGCT	2	8	210952	210959	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019695	TTTG	2	8	213466	213473	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019695	TTGT	2	8	215012	215019	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019695	TGGT	2	8	219480	219487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019695	CAAA	2	8	222635	222642	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019695	CGAT	2	8	223422	223429	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019695	CAAA	2	8	229858	229865	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019695	ATCG	2	8	230804	230811	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019695	CGAG	2	8	230817	230824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019695	TTAG	2	8	230851	230858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019695	CGAT	2	8	233409	233416	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019695	GAGT	2	8	235110	235117	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019695	GAAA	2	8	236631	236638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019695	TTGA	2	8	236814	236821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019695	AAAC	2	8	252673	252680	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019695	ACGT	2	8	254235	254242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019695	TGAG	2	8	254512	254519	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019695	ATTT	2	8	258018	258025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019695	GATG	2	8	263476	263483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019695	GATC	2	8	263559	263566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_019695	TAGT	2	8	263585	263592	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019695	GGTT	2	8	265817	265824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019695	CTTG	2	8	266557	266564	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019695	GATT	2	8	268293	268300	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019695	GGAT	2	8	269418	269425	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019695	ATCG	2	8	269467	269474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_019695	TTAT	2	8	276849	276856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019695	AAAT	2	8	276872	276879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019695	AAAG	2	8	280288	280295	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_019695	GATC	2	8	301180	301187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_019695	CGAT	2	8	339473	339480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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