MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 21208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019695	GATC	2	8	1611829	1611836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_019695	AGC	2	6	1611993	1611998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_019695	TGC	2	6	1612016	1612021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_019695	TC	3	6	1612029	1612034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_019695	GTA	2	6	1613001	1613006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_019695	CT	3	6	1613544	1613549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_019695	ACTTT	2	10	1613557	1613566	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5008	NC_019695	ATT	2	6	1613570	1613575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_019695	AT	3	6	1613595	1613600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_019695	AGCA	2	8	1613767	1613774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5011	NC_019695	GTAA	2	8	1617204	1617211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_019695	A	6	6	1617210	1617215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_019695	AAT	2	6	1617218	1617223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_019695	A	6	6	1617235	1617240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_019695	AG	3	6	1617249	1617254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_019695	A	6	6	1620091	1620096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_019695	AT	3	6	1620927	1620932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_019695	AGT	2	6	1620978	1620983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_019695	CAA	2	6	1621049	1621054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_019695	A	6	6	1621053	1621058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_019695	TGC	3	9	1621095	1621103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_019695	GAT	2	6	1621107	1621112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_019695	CAAAA	2	10	1622614	1622623	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5024	NC_019695	C	6	6	1622625	1622630	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5025	NC_019695	CAAAA	2	10	1622664	1622673	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5026	NC_019695	G	6	6	1622688	1622693	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_019695	CAA	2	6	1622706	1622711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_019695	C	6	6	1622715	1622720	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5029	NC_019695	G	6	6	1622728	1622733	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_019695	G	6	6	1622736	1622741	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_019695	ACA	2	6	1624696	1624701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_019695	GGCG	2	8	1624718	1624725	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_019695	TTTC	2	8	1624770	1624777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_019695	TCT	2	6	1624788	1624793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_019695	AG	3	6	1624955	1624960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_019695	AAAG	2	8	1624975	1624982	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_019695	AGC	2	6	1625708	1625713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_019695	CGAT	2	8	1627123	1627130	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5039	NC_019695	CATC	2	8	1627153	1627160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_019695	ACA	2	6	1628617	1628622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_019695	AGCCT	2	10	1628637	1628646	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5042	NC_019695	TCG	2	6	1628687	1628692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_019695	T	6	6	1628719	1628724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_019695	TCT	2	6	1628734	1628739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_019695	GAAAA	2	10	1628940	1628949	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_019695	CTA	2	6	1629121	1629126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_019695	TAA	2	6	1629180	1629185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_019695	ACC	2	6	1629219	1629224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_019695	CAC	2	6	1629987	1629992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_019695	TGC	2	6	1630030	1630035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_019695	TTTTG	2	10	1630076	1630085	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_019695	TGG	2	6	1630110	1630115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_019695	CCA	2	6	1630149	1630154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_019695	TCAC	2	8	1630156	1630163	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5055	NC_019695	CT	3	6	1630382	1630387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_019695	A	6	6	1630430	1630435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_019695	GCA	2	6	1630483	1630488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_019695	ATC	2	6	1630537	1630542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_019695	CAT	2	6	1630602	1630607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_019695	TGC	2	6	1630636	1630641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_019695	A	7	7	1630667	1630673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_019695	TACGA	2	10	1630678	1630687	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5063	NC_019695	CA	3	6	1630712	1630717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_019695	CAG	2	6	1630742	1630747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_019695	AG	3	6	1630746	1630751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_019695	CTG	2	6	1630828	1630833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_019695	CT	3	6	1630911	1630916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_019695	GAG	2	6	1630943	1630948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_019695	AG	4	8	1630969	1630976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_019695	TTC	2	6	1630988	1630993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_019695	CAC	2	6	1631016	1631021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5072	NC_019695	CT	3	6	1631028	1631033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_019695	CTC	2	6	1631042	1631047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5074	NC_019695	CTC	2	6	1631049	1631054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_019695	AGCT	2	8	1632107	1632114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5076	NC_019695	TTG	2	6	1632155	1632160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_019695	CAATT	2	10	1634581	1634590	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5078	NC_019695	CTT	2	6	1634645	1634650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_019695	GA	3	6	1635086	1635091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_019695	CAC	2	6	1636101	1636106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_019695	A	6	6	1636107	1636112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_019695	CT	3	6	1636147	1636152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5083	NC_019695	AG	3	6	1636820	1636825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_019695	AG	4	8	1636850	1636857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_019695	ACC	2	6	1636915	1636920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_019695	CAC	2	6	1636921	1636926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_019695	T	6	6	1637675	1637680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_019695	AAGA	2	8	1637749	1637756	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_019695	CCT	2	6	1639203	1639208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_019695	CCTG	2	8	1639704	1639711	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_019695	ATAG	2	8	1640714	1640721	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_019695	GTT	2	6	1640837	1640842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_019695	TGC	2	6	1640852	1640857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_019695	CTA	2	6	1640864	1640869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_019695	CTTA	2	8	1640873	1640880	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5096	NC_019695	AG	3	6	1641463	1641468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_019695	AGC	2	6	1641485	1641490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_019695	GTC	2	6	1641562	1641567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_019695	TTC	2	6	1641580	1641585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_019695	CCT	2	6	1641599	1641604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_019695	TTTC	2	8	1641643	1641650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5102	NC_019695	TCT	2	6	1641661	1641666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_019695	T	6	6	1641745	1641750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_019695	TTC	2	6	1641796	1641801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_019695	TTA	2	6	1641819	1641824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_019695	TAA	2	6	1641849	1641854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_019695	ACAA	2	8	1641871	1641878	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5108	NC_019695	CT	4	8	1643316	1643323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_019695	C	6	6	1643327	1643332	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5110	NC_019695	CA	3	6	1643343	1643348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5111	NC_019695	TTTA	2	8	1644680	1644687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_019695	AAT	2	6	1644704	1644709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_019695	CAC	2	6	1644805	1644810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5114	NC_019695	ATT	2	6	1645038	1645043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_019695	CGC	2	6	1645056	1645061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_019695	TAT	2	6	1645076	1645081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_019695	AGC	2	6	1647123	1647128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_019695	AG	3	6	1647130	1647135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_019695	GTAT	2	8	1647168	1647175	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_019695	GAA	2	6	1647184	1647189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_019695	ATC	2	6	1647191	1647196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_019695	A	6	6	1647592	1647597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_019695	ATC	2	6	1647604	1647609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_019695	CTTC	2	8	1647620	1647627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5125	NC_019695	A	6	6	1648516	1648521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_019695	CTT	2	6	1648548	1648553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_019695	CTTAAC	2	12	1648561	1648572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_019695	TAA	2	6	1648666	1648671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_019695	GAA	2	6	1649558	1649563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_019695	TC	3	6	1649570	1649575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5131	NC_019695	CCCG	2	8	1649583	1649590	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5132	NC_019695	AG	3	6	1649627	1649632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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