MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 4425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019682	TAAT	2	8	1737	1744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019682	AACT	2	8	3284	3291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019682	CTCA	2	8	5683	5690	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019682	ACAT	2	8	7386	7393	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019682	TTAA	2	8	7739	7746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019682	TAGA	2	8	12215	12222	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019682	GACT	2	8	15464	15471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019682	TTTA	2	8	16234	16241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019682	GCAA	2	8	19717	19724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019682	ATTT	2	8	19895	19902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019682	CAAT	2	8	20029	20036	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019682	TGTT	2	8	20197	20204	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019682	GTCT	2	8	22693	22700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019682	AGAT	2	8	23115	23122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019682	ATTA	2	8	24080	24087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019682	ATTA	2	8	28421	28428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019682	TTTA	2	8	33565	33572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019682	AATC	2	8	37916	37923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019682	GCGT	2	8	38585	38592	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019682	CTGG	2	8	38694	38701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019682	TCAA	2	8	39886	39893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019682	TAAT	2	8	40906	40913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019682	GAAA	2	8	43858	43865	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019682	AAGC	2	8	57478	57485	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019682	GAGC	2	8	58490	58497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019682	ATTT	2	8	59170	59177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019682	CCTT	2	8	59196	59203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019682	GTTG	2	8	60912	60919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019682	TTCT	2	8	61113	61120	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019682	GATT	2	8	62625	62632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019682	ATAA	2	8	67818	67825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019682	ATTC	2	8	70317	70324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019682	ATTT	2	8	70868	70875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019682	TGTT	2	8	70945	70952	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019682	CTAG	2	8	72125	72132	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019682	TCAT	2	8	73504	73511	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019682	GTTT	2	8	73533	73540	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019682	TGAT	2	8	73542	73549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019682	ATAA	2	8	73791	73798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019682	AAGA	2	8	74047	74054	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019682	GTTT	2	8	74116	74123	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019682	CTAA	2	8	74298	74305	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019682	AGTG	2	8	74658	74665	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019682	ACCA	3	12	80409	80420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019682	TTGC	2	8	83197	83204	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019682	CAAT	2	8	84497	84504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019682	ATCT	2	8	88438	88445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019682	GAAT	2	8	88525	88532	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019682	TCAG	2	8	89075	89082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019682	GTAA	2	8	89711	89718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019682	AAGA	2	8	89846	89853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019682	TAAT	2	8	91225	91232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019682	TAAT	2	8	92260	92267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019682	ACTT	2	8	92421	92428	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019682	TTTG	2	8	93417	93424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019682	AAGC	2	8	94756	94763	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019682	TAGA	2	8	97915	97922	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019682	AATG	2	8	98070	98077	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019682	TTAA	2	8	98197	98204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019682	ATCA	2	8	98459	98466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019682	ACTT	2	8	101612	101619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019682	GTAT	2	8	101704	101711	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019682	ACTT	2	8	102469	102476	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019682	CAGA	3	12	104655	104666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019682	CACT	2	8	104714	104721	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019682	TGTT	2	8	106074	106081	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019682	AAAT	2	8	106288	106295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019682	ATTG	2	8	106327	106334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019682	GAAA	2	8	106740	106747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019682	GTTG	2	8	106795	106802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019682	TATT	2	8	106831	106838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019682	ACTG	2	8	112738	112745	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019682	GGGA	2	8	114707	114714	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019682	AAAC	2	8	115290	115297	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019682	CAAT	2	8	115950	115957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_019682	AGCC	2	8	120637	120644	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019682	AAAT	2	8	120691	120698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019682	AAAT	2	8	123222	123229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019682	ACTA	2	8	124368	124375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019682	ATCT	2	8	127158	127165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019682	TAAA	2	8	127204	127211	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019682	TTTG	2	8	127916	127923	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019682	ATCA	2	8	127988	127995	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019682	ATTA	2	8	129140	129147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019682	TTTC	2	8	129794	129801	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019682	TAAG	2	8	140758	140765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019682	ATTA	2	8	141017	141024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019682	GTTA	2	8	143060	143067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019682	ACAA	2	8	145061	145068	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019682	AGTA	2	8	145370	145377	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019682	ATTC	2	8	146588	146595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019682	AGCT	2	8	148667	148674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019682	AGCT	2	8	149303	149310	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019682	ATTA	2	8	155466	155473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019682	TTTG	2	8	156068	156075	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019682	CAAT	2	8	156128	156135	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019682	TAAA	2	8	156328	156335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019682	AAAT	2	8	157208	157215	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019682	TATT	2	8	157244	157251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019682	ATTG	2	8	159026	159033	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019682	ACTT	2	8	160977	160984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019682	TTGT	2	8	161624	161631	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019682	ATCA	2	8	162405	162412	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019682	TTAT	2	8	162635	162642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019682	TACT	2	8	162733	162740	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019682	TACT	2	8	162920	162927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019682	TAAA	2	8	163305	163312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019682	AAAT	2	8	163361	163368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019682	ATAA	2	8	163385	163392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019682	AAAT	2	8	163589	163596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019682	AGAA	2	8	165084	165091	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019682	ACCT	2	8	165325	165332	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019682	CAAA	2	8	167239	167246	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019682	GTTT	2	8	169166	169173	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019682	GTAA	2	8	172903	172910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019682	TGCT	2	8	173038	173045	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019682	AATT	2	8	173074	173081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019682	ACCT	2	8	175319	175326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_019682	TTCT	2	8	175340	175347	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019682	ATTA	2	8	177385	177392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019682	TAAT	2	8	177525	177532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019682	TCGG	2	8	177628	177635	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019682	AGCG	2	8	177646	177653	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019682	CCCA	2	8	177754	177761	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_019682	GTTC	2	8	177788	177795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019682	ATGA	3	12	179747	179758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019682	TAAG	2	8	180067	180074	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019682	AATC	2	8	180219	180226	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019682	TATC	2	8	184269	184276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019682	AATT	2	8	185329	185336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019682	TGAC	2	8	189398	189405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019682	AAGC	2	8	196189	196196	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_019682	TAGC	2	8	196245	196252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019682	TTAA	2	8	197324	197331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019682	TGCT	2	8	197951	197958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019682	ATAA	2	8	201189	201196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019682	TTAT	2	8	203234	203241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019682	AATA	2	8	207801	207808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019682	TTTC	2	8	210048	210055	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019682	ATTA	2	8	216178	216185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019682	TTGA	2	8	218688	218695	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019682	CAAA	2	8	218995	219002	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019682	TAAT	2	8	221307	221314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019682	TAAC	2	8	222038	222045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_019682	GCTT	2	8	223781	223788	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019682	TGCT	2	8	224143	224150	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019682	GCCA	2	8	224179	224186	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_019682	TCGC	2	8	224360	224367	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_019682	TAAT	2	8	227997	228004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019682	GGCT	2	8	230424	230431	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_019682	GATA	2	8	231417	231424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019682	AAAT	2	8	231512	231519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019682	TGAT	2	8	233704	233711	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019682	TAAT	2	8	234009	234016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019682	TGAT	2	8	234716	234723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_019682	AAAT	2	8	257912	257919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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