MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 27662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019682	TTAAG	2	10	788295	788304	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_019682	TTG	2	6	789004	789009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_019682	AATT	2	8	789078	789085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_019682	AGAT	2	8	789096	789103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_019682	AAG	2	6	789105	789110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_019682	TGTGG	2	10	789174	789183	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_019682	CAAT	2	8	789253	789260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3008	NC_019682	TGTT	2	8	793279	793286	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_019682	CAA	2	6	793530	793535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_019682	ATT	2	6	793552	793557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_019682	ATT	2	6	793581	793586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_019682	CAGTT	2	10	793592	793601	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3013	NC_019682	TAGGT	2	10	793613	793622	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_019682	TAT	2	6	793657	793662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_019682	ATT	2	6	793681	793686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_019682	ATT	2	6	793695	793700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_019682	T	6	6	793812	793817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_019682	A	6	6	794256	794261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_019682	CAG	2	6	794271	794276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_019682	GATT	2	8	794283	794290	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_019682	AT	3	6	794309	794314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_019682	A	7	7	794326	794332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_019682	A	6	6	794340	794345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_019682	CA	3	6	794347	794352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_019682	AGT	2	6	794369	794374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_019682	CTAAA	2	10	794448	794457	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3027	NC_019682	A	6	6	794455	794460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_019682	CTAAA	2	10	795308	795317	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3029	NC_019682	A	6	6	795315	795320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_019682	T	7	7	797786	797792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_019682	CTG	2	6	797799	797804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_019682	GTC	2	6	797831	797836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_019682	GT	3	6	797887	797892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_019682	ACTCT	2	10	798985	798994	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3035	NC_019682	AAC	2	6	799046	799051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_019682	CGA	2	6	799078	799083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_019682	ATG	2	6	799091	799096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_019682	TCA	2	6	799130	799135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_019682	TC	3	6	800018	800023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_019682	AGA	2	6	800029	800034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_019682	CTTA	2	8	800058	800065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_019682	TCC	2	6	802686	802691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_019682	A	6	6	803851	803856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_019682	TGT	2	6	803873	803878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_019682	ATA	2	6	803973	803978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_019682	TAA	2	6	804007	804012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_019682	AGC	2	6	804058	804063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_019682	T	6	6	804080	804085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_019682	TAA	2	6	804109	804114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_019682	TA	3	6	804216	804221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_019682	TAA	2	6	804230	804235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_019682	GTC	2	6	804411	804416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_019682	TGG	2	6	807923	807928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_019682	AAT	2	6	807945	807950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_019682	TGTCCC	2	12	807954	807965	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_019682	GAA	2	6	809135	809140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_019682	CCA	2	6	809263	809268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_019682	AGAA	2	8	809380	809387	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_019682	ATC	2	6	809401	809406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_019682	T	7	7	809444	809450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_019682	GTT	2	6	809464	809469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_019682	AAAC	2	8	809520	809527	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_019682	ACT	2	6	809750	809755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_019682	TTAA	2	8	809768	809775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_019682	A	6	6	810080	810085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_019682	CTGA	2	8	810121	810128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3067	NC_019682	CAA	2	6	810182	810187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_019682	TGA	2	6	810550	810555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_019682	TGC	2	6	810571	810576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_019682	TA	5	10	810597	810606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_019682	TAA	2	6	810629	810634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_019682	TTA	2	6	810637	810642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_019682	AC	3	6	810653	810658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3074	NC_019682	TCA	2	6	810681	810686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_019682	TAG	2	6	810716	810721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3077	NC_019682	A	6	6	810828	810833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_019682	T	6	6	810836	810841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_019682	GA	3	6	810949	810954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_019682	CATA	2	8	810959	810966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3081	NC_019682	GTAA	2	8	810970	810977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_019682	TG	3	6	810999	811004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_019682	GTCG	2	8	811115	811122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3084	NC_019682	ATT	2	6	811131	811136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_019682	CGG	2	6	811146	811151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_019682	CTT	2	6	811264	811269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3088	NC_019682	CAC	2	6	811334	811339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_019682	ACT	2	6	811348	811353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_019682	TTA	2	6	812753	812758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_019682	A	6	6	812769	812774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_019682	AGT	2	6	812782	812787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_019682	TTA	2	6	812793	812798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3095	NC_019682	C	6	6	812864	812869	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3099	NC_019682	G	6	6	813109	813114	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_019682	ACT	2	6	813115	813120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_019682	GA	3	6	813145	813150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_019682	C	6	6	813168	813173	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3103	NC_019682	G	6	6	813181	813186	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_019682	G	6	6	813193	813198	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_019682	TAT	3	9	813199	813207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_019682	CAAAA	2	10	815059	815068	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3107	NC_019682	AC	3	6	815113	815118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3108	NC_019682	ACG	2	6	815156	815161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_019682	T	6	6	815180	815185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_019682	GA	3	6	815262	815267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_019682	ATT	2	6	815372	815377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_019682	CAG	2	6	815442	815447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_019682	ATC	2	6	815475	815480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_019682	TTA	2	6	815557	815562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_019682	AT	3	6	815643	815648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_019682	CTTG	2	8	815712	815719	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3117	NC_019682	C	6	6	815736	815741	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3118	NC_019682	CAC	2	6	815790	815795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_019682	TGC	2	6	815870	815875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_019682	AT	3	6	815881	815886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_019682	TGC	2	6	815928	815933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_019682	CAT	2	6	815937	815942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3127	NC_019682	ACG	2	6	816452	816457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_019682	ACT	2	6	816524	816529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_019682	CAGC	2	8	816605	816612	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3130	NC_019682	CAG	2	6	816620	816625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_019682	CCG	2	6	816671	816676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_019682	GCA	2	6	816739	816744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_019682	CAC	2	6	816815	816820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3134	NC_019682	TGT	2	6	817051	817056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_019682	TTC	2	6	817113	817118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3137	NC_019682	CT	3	6	817207	817212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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