MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 27662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019682	AGT	2	6	233924	233929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_019682	TAG	2	6	233953	233958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019682	CTT	2	6	233974	233979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_019682	TAAT	2	8	234009	234016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_019682	TGT	2	6	234076	234081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019682	GAT	2	6	234109	234114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_019682	TTG	2	6	234656	234661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_019682	TGAT	2	8	234716	234723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_019682	T	6	6	234723	234728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_019682	T	6	6	234751	234756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019682	CAT	2	6	234780	234785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_019682	GAT	2	6	234832	234837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019682	AT	4	8	235438	235445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_019682	GATT	2	8	235446	235453	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019682	T	6	6	235452	235457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_019682	GAT	2	6	235496	235501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_019682	CTTC	2	8	235518	235525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_019682	AG	3	6	235663	235668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_019682	TA	3	6	237885	237890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_019682	TGT	2	6	237903	237908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_019682	CGT	2	6	237996	238001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_019682	AC	3	6	238150	238155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_019682	ATTC	2	8	238264	238271	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_019682	CAA	2	6	245126	245131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_019682	TGC	2	6	245171	245176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_019682	GTT	2	6	245193	245198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019682	TCT	2	6	247897	247902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_019682	TAAA	2	8	247914	247921	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_019682	T	7	7	247932	247938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_019682	A	6	6	247946	247951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_019682	GTA	2	6	247963	247968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_019682	CCA	2	6	247982	247987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_019682	CTG	2	6	247998	248003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_019682	ACCC	2	8	248010	248017	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1035	NC_019682	TCTATT	2	12	248024	248035	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1036	NC_019682	TAAA	2	8	248044	248051	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_019682	AATAGA	2	12	248052	248063	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_019682	TC	3	6	248237	248242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_019682	ATC	2	6	248295	248300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_019682	TAG	3	9	248812	248820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_019682	AT	3	6	248830	248835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_019682	TA	3	6	248877	248882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019682	CA	3	6	248902	248907	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_019682	ATT	2	6	248934	248939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_019682	A	6	6	248941	248946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019682	GTA	2	6	248958	248963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_019682	CCA	2	6	248977	248982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_019682	TGG	2	6	248995	249000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_019682	CTA	2	6	249013	249018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_019682	GACT	2	8	249019	249026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_019682	CAACC	2	10	249027	249036	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1052	NC_019682	T	7	7	249042	249048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019682	AAG	2	6	250759	250764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_019682	A	6	6	250857	250862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_019682	CAA	2	6	250869	250874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_019682	A	8	8	250889	250896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_019682	AAT	2	6	250926	250931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019682	TAA	2	6	250984	250989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_019682	TC	4	8	250992	250999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_019682	TCT	2	6	252575	252580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_019682	G	6	6	254514	254519	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_019682	CTTGA	2	10	254539	254548	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1063	NC_019682	A	6	6	256792	256797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_019682	ATT	2	6	256834	256839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_019682	ATC	2	6	256843	256848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_019682	TCAA	2	8	256893	256900	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_019682	ACC	2	6	256905	256910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_019682	GTGCC	2	10	256989	256998	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1069	NC_019682	GTGCC	2	10	257043	257052	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1070	NC_019682	GAT	2	6	257077	257082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1072	NC_019682	CGG	2	6	257184	257189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_019682	CTG	2	6	257223	257228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_019682	TTCAT	2	10	257239	257248	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1075	NC_019682	TAC	2	6	257264	257269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_019682	TTA	2	6	257285	257290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_019682	ATT	2	6	257922	257927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_019682	CAC	2	6	257942	257947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_019682	ATTT	2	8	258472	258479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_019682	ATT	2	6	258523	258528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_019682	T	7	7	258527	258533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_019682	CAT	2	6	258613	258618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_019682	TAG	2	6	259195	259200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_019682	ACT	2	6	261724	261729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1092	NC_019682	GAAG	2	8	261777	261784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_019682	ATC	2	6	261815	261820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1100	NC_019682	ATT	2	6	262040	262045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_019682	TGA	2	6	262057	262062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_019682	GA	3	6	263222	263227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_019682	TGA	2	6	263233	263238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1106	NC_019682	AAC	2	6	265955	265960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_019682	CAAC	2	8	265964	265971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_019682	AGT	2	6	266403	266408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1110	NC_019682	TC	3	6	266442	266447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_019682	AAAG	2	8	266449	266456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_019682	GTT	2	6	266478	266483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_019682	CATGT	2	10	266499	266508	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1114	NC_019682	GCTT	2	8	266513	266520	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_019682	TTC	2	6	266581	266586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_019682	TACGC	2	10	266589	266598	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1117	NC_019682	CAT	2	6	266661	266666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_019682	GTT	2	6	269201	269206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_019682	GGC	2	6	269246	269251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_019682	AC	3	6	269253	269258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_019682	A	6	6	271547	271552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_019682	CCT	2	6	271601	271606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_019682	CT	3	6	271605	271610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_019682	TAGG	2	8	271619	271626	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_019682	T	6	6	271631	271636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_019682	TG	3	6	271653	271658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_019682	TAA	2	6	271702	271707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_019682	AGA	2	6	271794	271799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_019682	T	6	6	271810	271815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_019682	AATAA	2	10	271826	271835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_019682	TTAA	2	8	271864	271871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_019682	AGC	2	6	272475	272480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_019682	GAG	2	6	272510	272515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_019682	TCA	2	6	272688	272693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_019682	TAG	2	6	272701	272706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_019682	ATT	2	6	272775	272780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_019682	ATTT	2	8	272845	272852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1165	NC_019682	T	6	6	284991	284996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1262	NC_019682	TAC	2	6	313514	313519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1266	NC_019682	A	7	7	316410	316416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1271	NC_019682	CAA	2	6	316557	316562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1272	NC_019682	CAACC	2	10	316591	316600	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1273	NC_019682	T	8	8	316615	316622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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