MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 27662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019682	CCA	2	6	116885	116890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_019682	T	6	6	116930	116935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_019682	AG	3	6	118729	118734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_019682	TTA	2	6	119632	119637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_019682	TA	3	6	119824	119829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_019682	ACGAC	2	10	119880	119889	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
507	NC_019682	ATG	2	6	119894	119899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_019682	AGT	2	6	120016	120021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_019682	GT	4	8	120020	120027	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
510	NC_019682	AAG	2	6	120059	120064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_019682	GTA	2	6	120098	120103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_019682	TGG	2	6	120113	120118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_019682	TAC	2	6	120138	120143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_019682	T	6	6	120619	120624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_019682	AGCC	2	8	120637	120644	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
516	NC_019682	GT	3	6	120670	120675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_019682	AAAT	2	8	120691	120698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_019682	CG	3	6	122279	122284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_019682	C	6	6	122291	122296	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
520	NC_019682	T	6	6	122314	122319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_019682	ACC	2	6	122358	122363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_019682	AAT	2	6	122365	122370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_019682	GGA	2	6	122375	122380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_019682	TGA	2	6	122440	122445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_019682	TCATA	2	10	122495	122504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
526	NC_019682	AAAT	2	8	123222	123229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_019682	AAG	2	6	123571	123576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_019682	AG	3	6	123619	123624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_019682	CA	3	6	123628	123633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_019682	ATA	2	6	124334	124339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_019682	ACTA	2	8	124368	124375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
532	NC_019682	A	6	6	124375	124380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_019682	AGA	2	6	124396	124401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_019682	ATC	2	6	124425	124430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_019682	TTA	2	6	126036	126041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_019682	ATT	2	6	126090	126095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_019682	T	6	6	127149	127154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_019682	ATCT	2	8	127158	127165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
539	NC_019682	T	6	6	127180	127185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_019682	TAAA	2	8	127204	127211	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_019682	CAT	2	6	127256	127261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_019682	AAT	2	6	127394	127399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_019682	TCA	2	6	127463	127468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_019682	AGC	2	6	127494	127499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_019682	A	6	6	127531	127536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_019682	TGA	2	6	127545	127550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_019682	A	6	6	127735	127740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_019682	TGCGC	2	10	127850	127859	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
549	NC_019682	CAC	2	6	127866	127871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_019682	TTTG	2	8	127916	127923	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
551	NC_019682	GCTAGG	2	12	127944	127955	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
552	NC_019682	ATCA	2	8	127988	127995	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
553	NC_019682	TGGTG	2	10	128016	128025	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
554	NC_019682	ATTA	2	8	129140	129147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_019682	ACT	2	6	129197	129202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_019682	A	6	6	129732	129737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_019682	TTTC	2	8	129794	129801	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
558	NC_019682	GTGAGT	2	12	129837	129848	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_019682	TAA	2	6	129891	129896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_019682	GTA	2	6	130772	130777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_019682	TAC	2	6	130815	130820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_019682	T	6	6	132010	132015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_019682	T	6	6	132058	132063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_019682	AG	3	6	132066	132071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_019682	T	7	7	134741	134747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_019682	ATTCC	2	10	134777	134786	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
567	NC_019682	ATT	2	6	134790	134795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_019682	ATT	2	6	135982	135987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_019682	TGATT	2	10	136223	136232	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
570	NC_019682	A	7	7	136236	136242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_019682	TA	3	6	136302	136307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_019682	T	6	6	136816	136821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_019682	CT	3	6	137952	137957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_019682	TGA	2	6	139326	139331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_019682	GTGCC	2	10	139369	139378	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
576	NC_019682	AAC	2	6	139420	139425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_019682	ACC	2	6	140514	140519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_019682	GGT	2	6	140557	140562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_019682	GAT	2	6	140629	140634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_019682	CA	3	6	140749	140754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_019682	TAAG	2	8	140758	140765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_019682	GAA	2	6	140791	140796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_019682	CCT	2	6	140823	140828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_019682	ATT	2	6	140853	140858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_019682	A	7	7	140999	141005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_019682	ATTA	2	8	141017	141024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_019682	TAG	2	6	141179	141184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_019682	TTGCTT	2	12	141190	141201	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
589	NC_019682	ATT	2	6	141220	141225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_019682	GTTA	2	8	143060	143067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_019682	A	6	6	143073	143078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_019682	TA	3	6	143095	143100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_019682	CTA	2	6	143217	143222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_019682	CAA	2	6	143252	143257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_019682	A	6	6	143256	143261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_019682	T	7	7	143271	143277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_019682	CCT	2	6	143285	143290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_019682	CT	3	6	143289	143294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_019682	GTA	2	6	144472	144477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_019682	AGT	2	6	144515	144520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_019682	AAG	2	6	144620	144625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_019682	C	6	6	144627	144632	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
603	NC_019682	G	6	6	144663	144668	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
604	NC_019682	AGATTA	2	12	144742	144753	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_019682	TTA	2	6	144760	144765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_019682	TCCCA	2	10	144789	144798	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
607	NC_019682	GCT	2	6	144911	144916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_019682	T	6	6	144927	144932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_019682	TAC	2	6	144985	144990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_019682	ATT	2	6	145055	145060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_019682	ACAA	2	8	145061	145068	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
612	NC_019682	AAT	2	6	145092	145097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_019682	TA	3	6	145101	145106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_019682	TA	4	8	145118	145125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_019682	TAC	2	6	145133	145138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_019682	CTG	2	6	145186	145191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_019682	T	7	7	145226	145232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_019682	CAT	2	6	145234	145239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_019682	TAG	2	6	145242	145247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_019682	ATA	2	6	145296	145301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_019682	TAC	2	6	145330	145335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_019682	AGTA	2	8	145370	145377	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
623	NC_019682	TTG	2	6	146464	146469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_019682	AC	3	6	146474	146479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_019682	TAA	2	6	146541	146546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_019682	ATTC	2	8	146588	146595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
627	NC_019682	GTGCC	2	10	146640	146649	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
628	NC_019682	A	7	7	146722	146728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_019682	A	6	6	146762	146767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_019682	A	6	6	147911	147916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_019682	T	6	6	148028	148033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_019682	TCA	2	6	148068	148073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_019682	GTGCC	2	10	148084	148093	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
634	NC_019682	CGA	2	6	148102	148107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_019682	AGT	2	6	148145	148150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_019682	T	7	7	148647	148653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_019682	AGCT	2	8	148667	148674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
638	NC_019682	T	7	7	148690	148696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_019682	ACC	2	6	149084	149089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
640	NC_019682	AG	3	6	149209	149214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
641	NC_019682	ACC	2	6	149260	149265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_019682	AGCT	2	8	149303	149310	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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662	NC_019682	TC	3	6	155301	155306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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922	NC_019682	T	6	6	211572	211577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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