MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanobium gracile PCC 6307 chromosome

Total Repeats: 7908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019675	CGG	2	6	2048374	2048379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_019675	CAT	2	6	2049121	2049126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_019675	AG	3	6	2049129	2049134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_019675	AGC	2	6	2049152	2049157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_019675	GAC	2	6	2049163	2049168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_019675	CCG	2	6	2049880	2049885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_019675	CCACC	2	10	2049907	2049916	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5008	NC_019675	GCCCT	2	10	2053966	2053975	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5009	NC_019675	CGCC	2	8	2054001	2054008	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5010	NC_019675	CCCG	2	8	2054024	2054031	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5011	NC_019675	C	6	6	2055443	2055448	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5012	NC_019675	ATG	2	6	2055463	2055468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_019675	GA	4	8	2055536	2055543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_019675	GCA	2	6	2055579	2055584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_019675	AGC	2	6	2055606	2055611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_019675	CTT	2	6	2055640	2055645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_019675	GAT	2	6	2055662	2055667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_019675	ACT	2	6	2055677	2055682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_019675	ATGC	2	8	2056941	2056948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5020	NC_019675	TGAC	2	8	2056981	2056988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5021	NC_019675	TTA	2	6	2057006	2057011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_019675	TCT	2	6	2057120	2057125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_019675	CTG	2	6	2057161	2057166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_019675	AGA	2	6	2057250	2057255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_019675	TGGT	2	8	2057272	2057279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_019675	GCAG	2	8	2058040	2058047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_019675	GCT	2	6	2058122	2058127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_019675	ACCG	2	8	2058150	2058157	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5029	NC_019675	GGC	2	6	2058164	2058169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_019675	GTA	2	6	2058180	2058185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_019675	GCT	2	6	2058218	2058223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_019675	GAA	2	6	2058282	2058287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_019675	CCA	2	6	2058293	2058298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_019675	CAG	2	6	2058310	2058315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_019675	TGC	2	6	2058332	2058337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_019675	CAG	2	6	2058411	2058416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_019675	GGC	2	6	2058474	2058479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_019675	CAC	2	6	2058507	2058512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_019675	GATC	2	8	2058527	2058534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_019675	CAG	2	6	2058592	2058597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_019675	CTG	2	6	2058624	2058629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_019675	CAG	2	6	2058630	2058635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_019675	GCT	2	6	2058660	2058665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_019675	CTG	2	6	2058670	2058675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_019675	ACG	2	6	2058717	2058722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_019675	GC	3	6	2058766	2058771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_019675	TGG	2	6	2058778	2058783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_019675	CGCT	2	8	2058861	2058868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_019675	TGCCGC	2	12	2058883	2058894	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_019675	TGG	2	6	2059316	2059321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_019675	ATG	2	6	2059408	2059413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_019675	GAA	2	6	2059416	2059421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_019675	GCAT	2	8	2059426	2059433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5054	NC_019675	AGTG	2	8	2059446	2059453	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_019675	AGC	2	6	2059486	2059491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_019675	GAAAG	2	10	2059559	2059568	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_019675	GCAT	2	8	2059583	2059590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5058	NC_019675	TAA	2	6	2059609	2059614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_019675	ACC	2	6	2059833	2059838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_019675	ATG	2	6	2059851	2059856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_019675	TGG	2	6	2059859	2059864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_019675	GGA	2	6	2059884	2059889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_019675	TAC	2	6	2060033	2060038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_019675	ATT	2	6	2060040	2060045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_019675	GAA	2	6	2060081	2060086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_019675	CT	3	6	2060090	2060095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_019675	CTG	2	6	2060125	2060130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_019675	CGC	2	6	2060252	2060257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_019675	AAG	2	6	2060322	2060327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_019675	CAAG	2	8	2060353	2060360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5071	NC_019675	GATG	2	8	2060434	2060441	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_019675	GCT	2	6	2060483	2060488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_019675	ATTAC	2	10	2060554	2060563	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5074	NC_019675	CAGCT	2	10	2060602	2060611	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5075	NC_019675	CAT	2	6	2060643	2060648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_019675	ACA	2	6	2060652	2060657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_019675	TCT	2	6	2060740	2060745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_019675	TCA	2	6	2060778	2060783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_019675	ACC	2	6	2060811	2060816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_019675	AGA	2	6	2060840	2060845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_019675	TCA	3	9	2060914	2060922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_019675	GCT	2	6	2062209	2062214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_019675	AAT	2	6	2062372	2062377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_019675	GCC	2	6	2062414	2062419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_019675	AGC	2	6	2062476	2062481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_019675	AAG	2	6	2062514	2062519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_019675	CCA	2	6	2062647	2062652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5088	NC_019675	TGC	2	6	2062653	2062658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_019675	GCA	2	6	2062672	2062677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_019675	GTA	2	6	2062678	2062683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_019675	CTCA	2	8	2062684	2062691	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_019675	GGA	2	6	2062705	2062710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_019675	CCA	2	6	2062728	2062733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_019675	GAT	2	6	2062756	2062761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_019675	GACGA	2	10	2062778	2062787	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5096	NC_019675	CTG	2	6	2062808	2062813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_019675	ATC	2	6	2062898	2062903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_019675	CCA	2	6	2062932	2062937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_019675	AAG	2	6	2062943	2062948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_019675	AAG	2	6	2062979	2062984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_019675	GCC	2	6	2063066	2063071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_019675	CAG	2	6	2063091	2063096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_019675	GCT	2	6	2063101	2063106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_019675	GTC	2	6	2063123	2063128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_019675	AAGGG	2	10	2063175	2063184	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_019675	AC	3	6	2063235	2063240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_019675	GGA	2	6	2063254	2063259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_019675	AGA	2	6	2063340	2063345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_019675	GTG	2	6	2063455	2063460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_019675	GTC	2	6	2063478	2063483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_019675	TTG	2	6	2063598	2063603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_019675	GC	3	6	2063670	2063675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5113	NC_019675	CTA	2	6	2063703	2063708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_019675	CAAGTA	2	12	2063747	2063758	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5115	NC_019675	GC	3	6	2065610	2065615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_019675	GCG	2	6	2065638	2065643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_019675	CCGGC	2	10	2065657	2065666	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5118	NC_019675	CGGC	3	12	2065663	2065674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_019675	AACC	2	8	2067215	2067222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_019675	C	6	6	2067221	2067226	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5121	NC_019675	TTG	2	6	2067279	2067284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_019675	CG	3	6	2068037	2068042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_019675	TTG	2	6	2068087	2068092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_019675	GGC	2	6	2068103	2068108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_019675	TGC	2	6	2072880	2072885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_019675	TGGCGG	2	12	2072936	2072947	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5127	NC_019675	AGGC	2	8	2077442	2077449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5128	NC_019675	CCG	2	6	2077536	2077541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_019675	GCC	2	6	2077558	2077563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5252	NC_019675	CAGA	2	8	2108124	2108131	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5254	NC_019675	CGG	2	6	2108148	2108153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5256	NC_019675	G	7	7	2109142	2109148	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5461	NC_019675	GCCT	2	8	2236725	2236732	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5488	NC_019675	CTTT	2	8	2248940	2248947	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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