MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Endolissoclinum patella L2 chromosome

Total Repeats: 15695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019566	A	6	6	102389	102394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_019566	TAT	2	6	102400	102405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019566	CTA	2	6	102412	102417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_019566	AGA	2	6	102427	102432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_019566	A	6	6	102442	102447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019566	T	6	6	102448	102453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_019566	A	6	6	102459	102464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_019566	ATTA	2	8	102472	102479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_019566	ATT	2	6	102494	102499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_019566	T	6	6	102498	102503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019566	ATA	2	6	102517	102522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_019566	T	8	8	102548	102555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019566	AAAT	2	8	102556	102563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_019566	TTA	3	9	102567	102575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019566	ATT	2	6	102587	102592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_019566	T	8	8	102613	102620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_019566	GGT	2	6	102640	102645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_019566	T	7	7	102661	102667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_019566	T	6	6	102693	102698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_019566	TATTGT	2	12	102776	102787	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_019566	GTT	2	6	102853	102858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_019566	TC	3	6	102885	102890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_019566	TAA	2	6	102905	102910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_019566	TAC	2	6	102940	102945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_019566	ATTTT	2	10	102964	102973	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_019566	T	6	6	102970	102975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019566	TAA	2	6	103043	103048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019566	T	6	6	103063	103068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_019566	A	6	6	103123	103128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_019566	TAT	2	6	103135	103140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_019566	AAC	2	6	103156	103161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_019566	ATTT	2	8	103200	103207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019566	GTT	2	6	103212	103217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_019566	TAT	2	6	103246	103251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_019566	AT	3	6	103250	103255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_019566	TAT	2	6	103289	103294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_019566	A	7	7	103306	103312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_019566	ATA	2	6	103379	103384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_019566	ATT	2	6	103388	103393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_019566	GAA	2	6	103396	103401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_019566	ATA	2	6	103472	103477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_019566	A	7	7	103615	103621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019566	TC	3	6	103684	103689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_019566	GAT	2	6	103720	103725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_019566	CAT	2	6	103738	103743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_019566	TTC	2	6	103963	103968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_019566	T	6	6	105880	105885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_019566	A	6	6	105937	105942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_019566	ATTTTA	2	12	107144	107155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019566	AATT	2	8	107182	107189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_019566	AAT	2	6	107196	107201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019566	T	6	6	107201	107206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019566	AGT	2	6	107221	107226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_019566	T	8	8	107247	107254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_019566	A	8	8	107256	107263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_019566	ATA	2	6	107274	107279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_019566	TAC	2	6	107351	107356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_019566	TA	3	6	107370	107375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_019566	T	6	6	108162	108167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_019566	ATT	2	6	108183	108188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019566	TAA	2	6	108209	108214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_019566	TATT	2	8	109126	109133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_019566	TGT	2	6	109140	109145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_019566	AGAA	2	8	109171	109178	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_019566	TTTG	2	8	109271	109278	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_019566	TGAT	2	8	109315	109322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_019566	TAAAT	2	10	109327	109336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_019566	T	6	6	109347	109352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_019566	TAGAC	2	10	109357	109366	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1070	NC_019566	TCTAA	2	10	109416	109425	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1071	NC_019566	T	6	6	109481	109486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_019566	A	7	7	109532	109538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_019566	AGC	2	6	109661	109666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_019566	ATT	2	6	109780	109785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_019566	AAT	2	6	109828	109833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_019566	TCCT	2	8	109848	109855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_019566	ATA	2	6	109862	109867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_019566	T	7	7	109897	109903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_019566	T	7	7	109905	109911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_019566	TTAA	2	8	109924	109931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_019566	TTG	2	6	109939	109944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_019566	TAAA	2	8	109948	109955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_019566	TA	3	6	110001	110006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_019566	TTA	2	6	110014	110019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_019566	TTA	2	6	110023	110028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_019566	AATA	2	8	110041	110048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_019566	A	6	6	110071	110076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_019566	AGA	2	6	110150	110155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_019566	TAA	2	6	110156	110161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_019566	CTA	2	6	110205	110210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_019566	TAAG	2	8	112328	112335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_019566	ATT	2	6	112354	112359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_019566	TG	3	6	112369	112374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_019566	T	6	6	112404	112409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_019566	AATT	2	8	112610	112617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_019566	TAA	2	6	112636	112641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_019566	ATT	2	6	112644	112649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_019566	TTG	2	6	112925	112930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_019566	AAT	2	6	112940	112945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_019566	T	8	8	112959	112966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_019566	CTT	2	6	113011	113016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_019566	GCG	2	6	113162	113167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_019566	GTTT	2	8	113168	113175	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_019566	CGA	2	6	113204	113209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_019566	A	6	6	113263	113268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_019566	TCCT	2	8	113287	113294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_019566	ATGG	2	8	113346	113353	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_019566	TTG	2	6	113357	113362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_019566	TTA	2	6	113373	113378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_019566	TAA	2	6	113389	113394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_019566	GAAC	2	8	113431	113438	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_019566	GGC	2	6	113442	113447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_019566	AGT	2	6	113484	113489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_019566	TTG	2	6	113621	113626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019566	GAT	2	6	113674	113679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_019566	AGC	2	6	113722	113727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_019566	GT	3	6	113776	113781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_019566	CGATGA	2	12	113815	113826	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1119	NC_019566	AAG	2	6	113842	113847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_019566	CAG	2	6	113866	113871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_019566	GTT	2	6	113897	113902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_019566	GGC	2	6	114077	114082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_019566	GTC	2	6	114203	114208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_019566	CA	3	6	114393	114398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_019566	TGC	2	6	114401	114406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_019566	GTC	2	6	114413	114418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_019566	TCGTG	2	10	114422	114431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1128	NC_019566	AGG	2	6	114525	114530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_019566	AC	3	6	114577	114582	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_019566	GCA	2	6	114607	114612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_019566	AC	3	6	114745	114750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_019566	AGG	2	6	114804	114809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_019566	CCT	2	6	114886	114891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_019566	A	8	8	114896	114903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_019566	GCC	3	9	114920	114928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_019566	A	7	7	114962	114968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_019566	A	8	8	115028	115035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1491	NC_019566	AG	3	6	144499	144504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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