MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Endolissoclinum patella L2 chromosome

Total Repeats: 15695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019566	A	9	9	398645	398653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_019566	ATT	2	6	398745	398750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_019566	TA	3	6	398771	398776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_019566	ATT	2	6	398801	398806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_019566	GTT	2	6	398886	398891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_019566	TGT	2	6	399028	399033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_019566	TCGC	2	8	399048	399055	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4508	NC_019566	A	6	6	399778	399783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_019566	TTAAT	2	10	399797	399806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_019566	GGT	2	6	399831	399836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_019566	CT	3	6	399847	399852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4512	NC_019566	TAT	2	6	399881	399886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_019566	ATTA	2	8	400000	400007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_019566	TATGG	2	10	400015	400024	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_019566	TTG	2	6	400060	400065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_019566	T	8	8	400066	400073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_019566	ATTTG	2	10	400103	400112	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_019566	TAA	2	6	400117	400122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_019566	TAA	2	6	400136	400141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_019566	TAC	2	6	400170	400175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_019566	TA	3	6	400367	400372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_019566	TGT	2	6	400379	400384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_019566	GTA	2	6	400388	400393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_019566	ATA	2	6	400419	400424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_019566	GTT	2	6	400439	400444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_019566	T	6	6	400443	400448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_019566	AAC	2	6	400453	400458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_019566	AAT	2	6	400473	400478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_019566	A	6	6	400490	400495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_019566	TCTT	2	8	400537	400544	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4531	NC_019566	TTA	2	6	400570	400575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_019566	TTA	2	6	400615	400620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_019566	TTTA	2	8	400644	400651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_019566	TTAA	2	8	400691	400698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_019566	ATC	2	6	400890	400895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_019566	TAG	2	6	400923	400928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_019566	AATT	2	8	400936	400943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_019566	AAT	2	6	400957	400962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_019566	TAG	2	6	401003	401008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_019566	GCAT	2	8	401010	401017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4541	NC_019566	TA	3	6	401024	401029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_019566	TTA	2	6	401036	401041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_019566	TAA	2	6	401049	401054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_019566	CTA	2	6	401055	401060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_019566	TAAC	2	8	401079	401086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4546	NC_019566	TTGA	2	8	401101	401108	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_019566	CTAT	2	8	401127	401134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4548	NC_019566	TAA	2	6	401157	401162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_019566	TTA	2	6	401169	401174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_019566	TAA	3	9	401185	401193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_019566	TAA	2	6	401195	401200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_019566	T	8	8	401205	401212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_019566	AACAA	2	10	401218	401227	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4554	NC_019566	TA	3	6	401253	401258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_019566	AT	3	6	401261	401266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_019566	TTTA	2	8	401313	401320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_019566	TAA	2	6	401378	401383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_019566	GCT	2	6	401385	401390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_019566	TA	3	6	401436	401441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_019566	AAT	2	6	401466	401471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_019566	AT	4	8	401478	401485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_019566	TA	3	6	401494	401499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_019566	TTC	2	6	401512	401517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_019566	CTT	2	6	401538	401543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_019566	AAG	2	6	401552	401557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_019566	T	7	7	401629	401635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_019566	TTTTA	2	10	401656	401665	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4569	NC_019566	TAA	2	6	401728	401733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_019566	TTA	2	6	401744	401749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_019566	TGTT	2	8	401876	401883	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_019566	TA	3	6	401884	401889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_019566	CTT	2	6	401938	401943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_019566	TAGTT	2	10	401979	401988	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_019566	TTA	2	6	401997	402002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_019566	ATTTCA	2	12	402011	402022	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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4579	NC_019566	TAA	2	6	403378	403383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_019566	CTT	2	6	403391	403396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_019566	CTT	2	6	403432	403437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_019566	TTA	2	6	403441	403446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_019566	TA	3	6	403468	403473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_019566	TA	3	6	403516	403521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_019566	TTCT	2	8	403527	403534	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4588	NC_019566	AATT	2	8	403724	403731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_019566	TA	3	6	403785	403790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_019566	AGA	2	6	403810	403815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_019566	ATT	2	6	403845	403850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_019566	T	6	6	403849	403854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_019566	ATT	2	6	403886	403891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_019566	ATT	3	9	403937	403945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4597	NC_019566	TAA	2	6	403987	403992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_019566	ACT	2	6	404004	404009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_019566	ATT	2	6	404013	404018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4601	NC_019566	A	7	7	404054	404060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_019566	TTA	2	6	404083	404088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_019566	AAAT	2	8	404089	404096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_019566	TAG	3	9	404132	404140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_019566	A	8	8	404181	404188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_019566	ATAG	2	8	404208	404215	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_019566	TTA	2	6	404245	404250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_019566	ATT	2	6	404257	404262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_019566	ATA	2	6	404290	404295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_019566	ATT	2	6	404311	404316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_019566	AATT	2	8	404333	404340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_019566	TAAT	2	8	404345	404352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_019566	ATA	2	6	404353	404358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_019566	T	6	6	404407	404412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_019566	ATTC	2	8	404413	404420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4616	NC_019566	AAT	2	6	404474	404479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_019566	T	6	6	404519	404524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_019566	ATT	2	6	404539	404544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_019566	TTATA	2	10	404545	404554	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_019566	A	6	6	404574	404579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_019566	TAA	2	6	404616	404621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_019566	ATA	2	6	404635	404640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_019566	ATT	2	6	404665	404670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_019566	CAG	2	6	404671	404676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_019566	ATT	2	6	404702	404707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_019566	ATAA	2	8	404880	404887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_019566	TAA	2	6	404895	404900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_019566	ATT	2	6	404955	404960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_019566	GTT	2	6	404979	404984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_019566	ATT	2	6	405025	405030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_019566	GCT	4	12	405034	405045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_019566	ATA	2	6	405048	405053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_019566	AAT	2	6	405059	405064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_019566	TTTA	2	8	405697	405704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4635	NC_019566	T	8	8	405785	405792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4636	NC_019566	T	8	8	405838	405845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4637	NC_019566	T	6	6	406005	406010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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