MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 1676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018719	CCTG	2	8	4739	4746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018719	AAAC	2	8	6876	6883	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018719	GTTC	2	8	8522	8529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018719	AGCT	2	8	8869	8876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018719	CAAC	2	8	12927	12934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018719	GAGC	2	8	13014	13021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018719	ATTA	2	8	13403	13410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018719	GTAT	2	8	15560	15567	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018719	CTAG	2	8	17417	17424	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018719	GTTA	2	8	17474	17481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018719	CTTT	2	8	19715	19722	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018719	CAAG	2	8	22656	22663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018719	GCAA	2	8	23817	23824	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018719	AAAG	2	8	26447	26454	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018719	GAAG	2	8	30118	30125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018719	GTAT	2	8	33120	33127	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018719	TTTG	2	8	33459	33466	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018719	CTTG	2	8	33539	33546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018719	CAAC	2	8	33735	33742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018719	ACAT	2	8	36962	36969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018719	AAAT	2	8	37202	37209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018719	AAGA	2	8	37215	37222	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018719	AGCA	2	8	37278	37285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018719	ATGT	2	8	42329	42336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018719	TTCT	2	8	43124	43131	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018719	ACCC	2	8	43178	43185	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_018719	AGTT	2	8	43249	43256	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018719	GTAT	2	8	44059	44066	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018719	AACC	2	8	44563	44570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018719	CTGT	2	8	44633	44640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018719	TGGC	2	8	45905	45912	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018719	AAGG	2	8	45947	45954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018719	AAAG	2	8	47210	47217	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018719	GGCA	2	8	47244	47251	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018719	GGAT	2	8	47264	47271	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018719	AAAG	2	8	47305	47312	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018719	AGGT	2	8	47386	47393	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018719	ATCT	2	8	48018	48025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018719	CTAT	2	8	49575	49582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018719	ACAG	2	8	50792	50799	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018719	CTTT	2	8	55839	55846	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018719	GCTA	2	8	58254	58261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018719	CGAT	2	8	58991	58998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018719	AGGA	2	8	60785	60792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018719	GGCA	2	8	63677	63684	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018719	CAAT	2	8	65137	65144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018719	TGTA	2	8	67449	67456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018719	GCTA	2	8	70490	70497	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018719	ACGC	2	8	70577	70584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018719	TCAT	2	8	72042	72049	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018719	TGGA	2	8	73386	73393	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018719	GCAA	2	8	73656	73663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018719	CTAA	2	8	79273	79280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018719	TTTG	2	8	84325	84332	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018719	AAGG	2	8	84470	84477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018719	TCAG	2	8	84645	84652	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018719	ATGC	2	8	85469	85476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018719	CATC	2	8	87193	87200	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018719	AGGT	2	8	87299	87306	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018719	AAGT	2	8	87307	87314	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018719	AGGT	2	8	87315	87322	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018719	AGAC	2	8	87323	87330	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018719	ATTA	2	8	90575	90582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018719	TTCT	2	8	91850	91857	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018719	GAGG	2	8	92163	92170	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018719	CCCT	2	8	94165	94172	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_018719	AAGG	2	8	95060	95067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018719	CACG	2	8	95131	95138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018719	GTCA	2	8	96849	96856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018719	TGCC	2	8	101036	101043	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018719	ATAC	2	8	104832	104839	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018719	AATA	2	8	118655	118662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018719	GCTA	2	8	128541	128548	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018719	AATC	2	8	131676	131683	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018719	AGCA	2	8	132872	132879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_018719	TTTC	2	8	135102	135109	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018719	TTCT	2	8	137755	137762	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018719	AAAT	2	8	138163	138170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018719	TCTA	2	8	139293	139300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018719	ATAG	2	8	139338	139345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018719	GCTG	2	8	139347	139354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018719	GCTC	2	8	139943	139950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018719	AATC	2	8	140110	140117	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018719	ATCA	2	8	140351	140358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018719	TGTT	2	8	143400	143407	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018719	TTAA	2	8	158074	158081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018719	TAAC	2	8	163636	163643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018719	AACG	2	8	169238	169245	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018719	CCGA	2	8	169285	169292	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018719	AGAT	2	8	169832	169839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018719	GCTT	2	8	170518	170525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018719	CATA	2	8	171947	171954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018719	AAGC	2	8	171965	171972	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018719	CTGC	2	8	173233	173240	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018719	AAGC	2	8	173752	173759	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018719	CATT	2	8	173878	173885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018719	AGGC	2	8	176914	176921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018719	ACTT	2	8	177921	177928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018719	TCCA	2	8	183045	183052	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018719	AATT	2	8	183341	183348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018719	GCAG	2	8	183809	183816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018719	TCTT	2	8	185661	185668	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018719	TGCC	2	8	186483	186490	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018719	GTCT	2	8	186499	186506	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018719	ATCA	2	8	187408	187415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018719	TAAT	2	8	187988	187995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018719	CCTG	2	8	188062	188069	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018719	ACTG	2	8	188795	188802	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018719	TAAT	2	8	189407	189414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018719	GAAC	2	8	189730	189737	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018719	TAGT	2	8	192147	192154	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018719	TGCT	2	8	195296	195303	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018719	AATG	2	8	197224	197231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018719	TACA	2	8	199197	199204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018719	CAAT	2	8	199216	199223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018719	TGGC	2	8	199627	199634	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018719	AAGG	2	8	202804	202811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018719	AATC	2	8	208373	208380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018719	AGAA	2	8	221639	221646	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018719	AGAA	2	8	223893	223900	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018719	GTCT	2	8	225729	225736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018719	TATC	2	8	233930	233937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018719	GATA	2	8	233987	233994	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018719	TAAT	2	8	235582	235589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018719	GAAA	2	8	235607	235614	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018719	TACT	2	8	237401	237408	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018719	GGCT	2	8	243474	243481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018719	CAGA	2	8	244583	244590	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018719	CAAG	2	8	250926	250933	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018719	AACA	2	8	252422	252429	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018719	TACT	2	8	256464	256471	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018719	GGCT	2	8	262537	262544	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_018719	CAAG	2	8	268655	268662	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018719	AGCT	2	8	281137	281144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018719	AAAC	2	8	281232	281239	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018719	ACTG	2	8	281363	281370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018719	TGAG	2	8	282148	282155	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018719	GACA	2	8	282584	282591	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018719	ATGT	2	8	283743	283750	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018719	CTAT	2	8	288354	288361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018719	GAAA	2	8	288381	288388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018719	TCAA	2	8	295555	295562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018719	TAGA	2	8	299489	299496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018719	AGAA	2	8	303873	303880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018719	AACG	2	8	303931	303938	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018719	AGCA	2	8	304113	304120	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_018719	CTGG	2	8	304541	304548	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018719	GTGG	2	8	304579	304586	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018719	GGTA	2	8	304779	304786	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018719	GTTG	3	12	305777	305788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018719	TTGT	2	8	306242	306249	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018719	TGCG	2	8	306437	306444	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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