MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 12092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018719	AGC	2	6	876894	876899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_018719	TTG	2	6	876911	876916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_018719	CCA	2	6	876946	876951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_018719	TGA	2	6	878855	878860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_018719	TCAT	2	8	878875	878882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_018719	TTTTGT	2	12	879410	879421	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_018719	T	6	6	879423	879428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_018719	ACAA	2	8	879979	879986	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4009	NC_018719	ACAG	2	8	880000	880007	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_018719	TGA	2	6	880020	880025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_018719	AGC	2	6	881680	881685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_018719	AT	4	8	881713	881720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_018719	TA	4	8	881742	881749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_018719	ATA	2	6	881762	881767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_018719	TA	3	6	882969	882974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_018719	GATA	2	8	883021	883028	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_018719	ATA	2	6	883042	883047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_018719	AAT	2	6	883103	883108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_018719	T	6	6	883108	883113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_018719	CAA	2	6	883132	883137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_018719	TTG	2	6	883152	883157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_018719	AATT	2	8	883191	883198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_018719	ACG	2	6	883709	883714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_018719	CCCA	2	8	883742	883749	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4025	NC_018719	GCT	2	6	883768	883773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_018719	TA	3	6	883805	883810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_018719	CTT	3	9	883837	883845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_018719	TGT	2	6	884076	884081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_018719	A	6	6	884127	884132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_018719	TAG	2	6	884165	884170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_018719	TGCA	2	8	884185	884192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4032	NC_018719	AGT	2	6	884276	884281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_018719	ATA	2	6	884303	884308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_018719	CCT	2	6	885553	885558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_018719	CAAT	2	8	885560	885567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_018719	AGGG	2	8	885582	885589	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_018719	GCA	2	6	885632	885637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_018719	GGA	2	6	885691	885696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_018719	CCTA	2	8	885701	885708	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_018719	GGCT	2	8	886088	886095	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4041	NC_018719	CGTA	2	8	886107	886114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_018719	TAATG	2	10	886160	886169	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_018719	ATG	2	6	886241	886246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_018719	TTG	2	6	886259	886264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_018719	AAAG	2	8	886303	886310	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_018719	AATC	2	8	886337	886344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4047	NC_018719	GTA	2	6	886363	886368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_018719	AGC	2	6	886467	886472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_018719	ACC	2	6	886503	886508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4050	NC_018719	T	6	6	886511	886516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_018719	GCCG	2	8	886520	886527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_018719	A	7	7	887001	887007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_018719	GATA	2	8	887021	887028	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_018719	A	6	6	887868	887873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_018719	AGA	2	6	887884	887889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_018719	A	6	6	887892	887897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_018719	AAG	2	6	887914	887919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_018719	ATG	2	6	887930	887935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_018719	GA	3	6	887971	887976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_018719	TGA	2	6	888025	888030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_018719	TCA	2	6	888038	888043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_018719	ATA	2	6	888278	888283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_018719	GC	3	6	888299	888304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_018719	GAT	2	6	888341	888346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_018719	TGC	2	6	888361	888366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_018719	ATT	2	6	888367	888372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_018719	ATC	2	6	889490	889495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_018719	ATA	2	6	889640	889645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_018719	AAT	2	6	889677	889682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_018719	GTGCTA	2	12	889699	889710	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4071	NC_018719	TAT	2	6	889738	889743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_018719	CGC	2	6	889893	889898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_018719	AGC	2	6	889910	889915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_018719	CAC	2	6	889920	889925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_018719	TGC	2	6	889958	889963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_018719	T	6	6	891038	891043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_018719	GAA	2	6	891749	891754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_018719	CTGGA	2	10	891837	891846	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4079	NC_018719	TAAAC	2	10	891847	891856	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4080	NC_018719	AAAT	2	8	891866	891873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_018719	A	6	6	892312	892317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_018719	GAT	2	6	896761	896766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_018719	GC	3	6	907115	907120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_018719	TGC	2	6	907159	907164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_018719	AC	3	6	907173	907178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_018719	A	6	6	907179	907184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_018719	TGC	2	6	907185	907190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_018719	GC	3	6	907227	907232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_018719	AAT	3	9	907247	907255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_018719	CCGG	2	8	908213	908220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4091	NC_018719	T	6	6	909086	909091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_018719	CGATG	2	10	909262	909271	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4093	NC_018719	AGG	2	6	909283	909288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4095	NC_018719	CCA	2	6	909416	909421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_018719	AAC	2	6	909423	909428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_018719	A	6	6	910463	910468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_018719	TGA	2	6	911390	911395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_018719	TTTC	2	8	911429	911436	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4100	NC_018719	GAA	2	6	911491	911496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_018719	CTT	2	6	911535	911540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_018719	TAAA	2	8	911609	911616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_018719	TA	3	6	911657	911662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_018719	TTC	2	6	912076	912081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_018719	AGCC	2	8	912123	912130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_018719	TTA	2	6	912131	912136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_018719	AGA	2	6	912170	912175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_018719	AGTT	2	8	912199	912206	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_018719	TTGCAT	2	12	912208	912219	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4110	NC_018719	TTAA	2	8	912255	912262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_018719	GCA	2	6	914758	914763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_018719	ATG	2	6	916648	916653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_018719	ATG	2	6	916688	916693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_018719	TAA	2	6	916700	916705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_018719	CGA	2	6	916767	916772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_018719	ACA	2	6	916780	916785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_018719	TCAT	2	8	916894	916901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4118	NC_018719	ATG	2	6	917048	917053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_018719	CTT	2	6	917054	917059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_018719	ATA	2	6	917169	917174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_018719	T	6	6	917215	917220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_018719	A	6	6	917243	917248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_018719	TGCC	2	8	917288	917295	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_018719	TTA	2	6	917301	917306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_018719	A	6	6	917311	917316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_018719	TAT	2	6	917347	917352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_018719	TTC	2	6	917353	917358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_018719	TGA	2	6	917420	917425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_018719	AAT	2	6	917453	917458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_018719	AGC	2	6	917477	917482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_018719	ATA	2	6	917483	917488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_018719	GAA	2	6	917497	917502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_018719	GCAA	2	8	917812	917819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4134	NC_018719	TTCA	2	8	917910	917917	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4135	NC_018719	ATGC	2	8	917964	917971	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4136	NC_018719	TAC	2	6	917980	917985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4139	NC_018719	CAT	2	6	918060	918065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4142	NC_018719	TTGA	2	8	919311	919318	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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