MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 12092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018719	AGGCA	2	10	1123977	1123986	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5002	NC_018719	AATAG	2	10	1124950	1124959	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_018719	CTT	2	6	1125365	1125370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_018719	GAT	2	6	1125378	1125383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_018719	TAGT	2	8	1125487	1125494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_018719	T	6	6	1125515	1125520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_018719	TCT	2	6	1126372	1126377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_018719	CT	3	6	1126376	1126381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_018719	AT	3	6	1126394	1126399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_018719	AGG	2	6	1128025	1128030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_018719	CGG	2	6	1128596	1128601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_018719	TCC	2	6	1128639	1128644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_018719	TAAT	2	8	1128692	1128699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_018719	ATC	2	6	1128712	1128717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_018719	CAG	2	6	1128740	1128745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_018719	GCT	2	6	1128751	1128756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_018719	T	6	6	1128808	1128813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_018719	AGG	2	6	1130426	1130431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_018719	ATT	2	6	1132656	1132661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_018719	CCA	2	6	1133972	1133977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_018719	TGTT	2	8	1135588	1135595	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_018719	TAATTT	2	12	1135958	1135969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_018719	ATGC	2	8	1135974	1135981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5024	NC_018719	TAA	3	9	1136014	1136022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_018719	TCT	2	6	1136109	1136114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_018719	TCC	2	6	1136117	1136122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_018719	ATGTGC	2	12	1138464	1138475	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5028	NC_018719	CATA	2	8	1138491	1138498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5029	NC_018719	AAATTA	2	12	1138502	1138513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_018719	AATT	3	12	1138538	1138549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_018719	CGC	2	6	1138553	1138558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_018719	GA	3	6	1140435	1140440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_018719	GGTG	2	8	1140448	1140455	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_018719	TCA	2	6	1140482	1140487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_018719	CTAGT	2	10	1140499	1140508	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5036	NC_018719	TTC	2	6	1141857	1141862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_018719	TCTT	2	8	1141934	1141941	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_018719	TG	3	6	1141948	1141953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_018719	TAG	2	6	1141983	1141988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_018719	TA	3	6	1141997	1142002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_018719	CT	3	6	1143743	1143748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_018719	T	6	6	1143757	1143762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_018719	GTA	2	6	1143794	1143799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_018719	GAT	2	6	1143866	1143871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_018719	GCT	2	6	1143876	1143881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_018719	CCT	2	6	1144537	1144542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_018719	TTG	2	6	1145161	1145166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_018719	CTG	2	6	1145168	1145173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_018719	GTG	2	6	1145333	1145338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_018719	AGCG	2	8	1145409	1145416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_018719	AGC	2	6	1145425	1145430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_018719	CATTG	2	10	1147467	1147476	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5053	NC_018719	GGT	2	6	1147753	1147758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_018719	TATC	2	8	1147764	1147771	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5055	NC_018719	CTGT	2	8	1147888	1147895	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_018719	TTG	2	6	1147925	1147930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_018719	CGA	2	6	1147980	1147985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_018719	ACCT	2	8	1148020	1148027	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_018719	GTG	2	6	1148039	1148044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_018719	GCG	2	6	1148046	1148051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_018719	TCT	2	6	1148061	1148066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_018719	GTC	2	6	1148101	1148106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_018719	GC	3	6	1148109	1148114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_018719	ATG	2	6	1148149	1148154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_018719	CTTG	2	8	1148176	1148183	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_018719	TA	3	6	1148542	1148547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_018719	TTTAT	2	10	1148579	1148588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_018719	AG	4	8	1150681	1150688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_018719	AGT	3	9	1150691	1150699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_018719	AAC	2	6	1150735	1150740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_018719	CAT	2	6	1150746	1150751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_018719	TTA	2	6	1150752	1150757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_018719	TTAT	2	8	1153232	1153239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_018719	GAA	2	6	1153481	1153486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_018719	TAA	3	9	1153590	1153598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_018719	AT	3	6	1153664	1153669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_018719	ACC	2	6	1153684	1153689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5078	NC_018719	A	6	6	1153690	1153695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_018719	TTGA	2	8	1153749	1153756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_018719	TAC	2	6	1153775	1153780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_018719	CTT	2	6	1154093	1154098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_018719	TAT	2	6	1154135	1154140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_018719	ACA	2	6	1154343	1154348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_018719	GCCG	2	8	1154365	1154372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5085	NC_018719	TA	3	6	1154467	1154472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_018719	GTT	2	6	1154486	1154491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_018719	GTG	2	6	1154712	1154717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_018719	AGA	2	6	1154727	1154732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_018719	A	6	6	1156268	1156273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_018719	TCTA	2	8	1156274	1156281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5091	NC_018719	TAA	2	6	1156339	1156344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_018719	A	8	8	1156371	1156378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_018719	CAA	2	6	1156382	1156387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_018719	GAA	2	6	1156415	1156420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_018719	GCCGC	2	10	1156424	1156433	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5096	NC_018719	ATG	2	6	1156456	1156461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_018719	ATT	2	6	1156506	1156511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_018719	TAA	2	6	1156539	1156544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_018719	ACA	2	6	1156565	1156570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_018719	ATGC	2	8	1156709	1156716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5101	NC_018719	TC	3	6	1156833	1156838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_018719	ATC	2	6	1156840	1156845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_018719	T	6	6	1156898	1156903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_018719	TAA	2	6	1156933	1156938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_018719	CAT	2	6	1158273	1158278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_018719	CAA	3	9	1158279	1158287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_018719	A	6	6	1158286	1158291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_018719	GCA	3	9	1158323	1158331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_018719	AGG	2	6	1158887	1158892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_018719	TTATA	2	10	1159629	1159638	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_018719	ATGA	2	8	1160642	1160649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_018719	ATA	3	9	1160745	1160753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_018719	TTCC	2	8	1161450	1161457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_018719	TTAC	2	8	1161518	1161525	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5115	NC_018719	ATT	2	6	1161531	1161536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_018719	TAA	2	6	1161540	1161545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_018719	AAG	2	6	1161564	1161569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_018719	AG	3	6	1163504	1163509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_018719	T	6	6	1163551	1163556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_018719	ATCT	2	8	1163976	1163983	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5121	NC_018719	ACAA	2	8	1164009	1164016	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_018719	TAT	3	9	1164054	1164062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_018719	CCCA	2	8	1164090	1164097	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5124	NC_018719	T	6	6	1164726	1164731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_018719	AG	4	8	1164977	1164984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_018719	AGA	2	6	1165031	1165036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_018719	TTA	2	6	1166222	1166227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_018719	CAA	2	6	1166281	1166286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_018719	ATC	2	6	1166318	1166323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_018719	CTA	2	6	1166351	1166356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_018719	GAA	2	6	1166403	1166408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_018719	ATGT	2	8	1168100	1168107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_018719	TAGA	2	8	1168161	1168168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_018719	GTA	2	6	1168178	1168183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5136	NC_018719	AT	3	6	1170240	1170245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_018719	ATT	2	6	1170410	1170415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5146	NC_018719	TGCA	2	8	1171386	1171393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5155	NC_018719	CTA	3	9	1173775	1173783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5259	NC_018719	TTTC	2	8	1185088	1185095	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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