MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni PT14 chromosome

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018709	TAAAA	2	10	6618	6627	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018709	GTATT	2	10	15676	15685	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018709	AAAAT	2	10	18044	18053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018709	AAAAT	2	10	21867	21876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018709	GTTAA	2	10	21894	21903	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018709	TATAT	2	10	36987	36996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018709	CTTTT	2	10	37281	37290	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018709	CTTTT	2	10	37451	37460	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018709	GGTAA	2	10	37763	37772	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018709	TCGTG	2	10	38559	38568	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018709	TCTTT	2	10	39580	39589	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018709	TAACT	2	10	39594	39603	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018709	CCGTA	2	10	41439	41448	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018709	AAGAA	2	10	42883	42892	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018709	AGCTT	2	10	52540	52549	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018709	AATAA	2	10	67103	67112	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018709	TTTAT	2	10	70699	70708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018709	TCTCT	2	10	76908	76917	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_018709	TAGGA	2	10	83643	83652	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018709	AAAAT	2	10	83669	83678	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018709	ATTTT	2	10	83679	83688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018709	TTAAT	2	10	84404	84413	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018709	TATTT	2	10	84472	84481	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018709	TATAA	2	10	84489	84498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018709	TAAAA	2	10	89238	89247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018709	AAGAT	2	10	94686	94695	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018709	TAAAA	2	10	140730	140739	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018709	TTAAT	2	10	146339	146348	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018709	TATTT	2	10	151848	151857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018709	TTATT	2	10	166055	166064	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018709	TATTT	2	10	179071	179080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018709	TAAAA	2	10	189261	189270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018709	AAAAT	2	10	193429	193438	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018709	AAGTG	2	10	196309	196318	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018709	AGGAT	2	10	197491	197500	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018709	TAAAA	2	10	198849	198858	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018709	TAGAT	2	10	208531	208540	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018709	AAAAT	2	10	223983	223992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018709	AAATT	2	10	225820	225829	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018709	CTTTT	2	10	225865	225874	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018709	TAAAT	2	10	228734	228743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018709	CATAA	2	10	234314	234323	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018709	ATATT	2	10	245174	245183	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018709	ATTAA	2	10	248451	248460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018709	TTAAT	2	10	250367	250376	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018709	AAGTA	2	10	267708	267717	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018709	ATAAA	2	10	268729	268738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018709	AATTT	2	10	276682	276691	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018709	TTAAA	3	15	301630	301644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018709	GAGTA	2	10	308277	308286	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018709	TTTTA	2	10	320552	320561	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018709	ATTAA	2	10	336624	336633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018709	ATTAA	2	10	339117	339126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018709	CTTTT	2	10	393650	393659	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018709	CTTTT	2	10	393820	393829	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018709	GGTAA	2	10	394132	394141	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018709	TCGTG	2	10	394928	394937	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018709	TCTTT	2	10	395956	395965	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018709	TAACT	2	10	395970	395979	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018709	CCGTA	2	10	397815	397824	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_018709	AAGAA	2	10	399259	399268	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018709	AAGAA	2	10	399277	399286	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018709	CTTAT	2	10	404925	404934	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018709	ATTTT	2	10	409452	409461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018709	TCAAA	2	10	412095	412104	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018709	AAGGT	2	10	413112	413121	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018709	CAAAT	2	10	413604	413613	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018709	TTGGT	2	10	413809	413818	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018709	ATAGA	2	10	413823	413832	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018709	GATGG	2	10	414090	414099	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018709	TAAAT	2	10	430759	430768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018709	TTGCT	2	10	434120	434129	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018709	TTTAT	2	10	451382	451391	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018709	ATTTT	2	10	451730	451739	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018709	GAGTT	2	10	451980	451989	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018709	TTTAT	2	10	456864	456873	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018709	GATTT	2	10	457387	457396	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018709	TTTTA	2	10	464931	464940	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018709	TTTTA	2	10	485414	485423	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018709	TGCTT	2	10	485972	485981	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018709	TTTAA	2	10	486297	486306	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018709	AAAAT	2	10	509858	509867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018709	GTTTT	2	10	512954	512963	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018709	AAATA	2	10	513263	513272	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018709	CATTC	2	10	513980	513989	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_018709	TTTTA	2	10	522270	522279	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018709	AAAAT	2	10	522304	522313	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018709	AATAT	2	10	527060	527069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018709	TTTGA	2	10	539924	539933	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018709	ATTTG	2	10	541084	541093	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018709	TAAAA	2	10	554946	554955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018709	GATAA	2	10	578098	578107	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018709	TTTAA	2	10	587488	587497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018709	ACAAT	2	10	591231	591240	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018709	GAAAA	2	10	598535	598544	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018709	TTTGC	2	10	602056	602065	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018709	TGATT	2	10	616710	616719	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018709	AATTA	2	10	618096	618105	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018709	TTTAA	2	10	627080	627089	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018709	ATTTT	2	10	629002	629011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018709	TACTT	2	10	629627	629636	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018709	AGAAA	2	10	629715	629724	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018709	TGGCT	2	10	630275	630284	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018709	TACAA	2	10	632896	632905	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018709	ATTTA	2	10	641457	641466	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018709	GTTTT	2	10	648087	648096	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018709	TTAGA	2	10	648116	648125	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018709	GTTTT	2	10	649794	649803	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018709	TAAAA	3	15	657605	657619	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018709	ATAAA	2	10	658428	658437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018709	ATTTA	2	10	660014	660023	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018709	TTTAA	2	10	667343	667352	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018709	TAAAA	2	10	690415	690424	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018709	AAAAT	2	10	690485	690494	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018709	TTTTA	2	10	690573	690582	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018709	CTTTT	2	10	697784	697793	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018709	CTTTT	2	10	697954	697963	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018709	GGTAA	2	10	698266	698275	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018709	TCGTG	2	10	699062	699071	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018709	TCTTT	2	10	700090	700099	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018709	TAACT	2	10	700104	700113	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018709	CCGTA	2	10	701948	701957	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_018709	AAGAA	2	10	703392	703401	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018709	TTTAT	2	10	703949	703958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018709	TAAAT	2	10	704217	704226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018709	AATTA	2	10	704241	704250	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018709	TTTTA	2	10	704345	704354	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018709	GCAAA	2	10	705036	705045	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018709	ATTTT	2	10	706745	706754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018709	ATTAA	2	10	706989	706998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018709	AATAA	2	10	712855	712864	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018709	ATTTA	2	10	715629	715638	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018709	TTTTC	2	10	745987	745996	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018709	ATTTT	2	10	807677	807686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018709	TTTTA	2	10	811668	811677	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018709	AGGTT	2	10	816362	816371	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018709	AAAAT	2	10	824428	824437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018709	AAAAT	2	10	855314	855323	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018709	ATTTT	2	10	860978	860987	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018709	AAAAT	2	10	892941	892950	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018709	TTAAT	2	10	904919	904928	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018709	ATAAA	2	10	907510	907519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018709	TTGGA	2	10	920461	920470	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018709	AAAAT	2	10	920797	920806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018709	AATTA	2	10	929477	929486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018709	TAAAA	2	10	958120	958129	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018709	TTTAT	2	10	963945	963954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018709	TTAAT	2	10	969044	969053	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.