MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni PT14 chromosome

Total Repeats: 3210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018709	ATTA	2	8	1532760	1532767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_018709	TA	3	6	1532786	1532791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_018709	A	6	6	1532809	1532814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_018709	TA	3	6	1533095	1533100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_018709	TA	3	6	1534181	1534186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_018709	TAAAA	2	10	1534964	1534973	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_018709	A	8	8	1534978	1534985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_018709	AT	3	6	1535019	1535024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_018709	TAA	2	6	1535064	1535069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_018709	ATTT	2	8	1535077	1535084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_018709	ATT	2	6	1535089	1535094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_018709	ATT	2	6	1535110	1535115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_018709	TATTT	2	10	1535116	1535125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_018709	TTA	2	6	1540703	1540708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_018709	T	6	6	1540741	1540746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_018709	TCT	2	6	1540752	1540757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_018709	AT	3	6	1540768	1540773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_018709	TAAA	2	8	1540796	1540803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_018709	AAGG	2	8	1540815	1540822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_018709	A	6	6	1543107	1543112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_018709	T	6	6	1543121	1543126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_018709	AAATT	2	10	1543141	1543150	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_018709	CCCG	2	8	1544069	1544076	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3024	NC_018709	GGT	2	6	1544077	1544082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_018709	TTC	2	6	1544124	1544129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_018709	CAC	2	6	1544156	1544161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_018709	ACTTT	2	10	1544262	1544271	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3028	NC_018709	GCG	2	6	1544298	1544303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_018709	CCA	2	6	1544359	1544364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_018709	TAT	2	6	1544389	1544394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_018709	TAC	2	6	1544413	1544418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_018709	ATA	2	6	1544428	1544433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_018709	A	7	7	1544463	1544469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_018709	TTTTA	2	10	1548746	1548755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_018709	ATT	2	6	1548774	1548779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_018709	T	6	6	1548778	1548783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_018709	A	8	8	1548784	1548791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_018709	A	7	7	1548833	1548839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_018709	TAT	2	6	1548861	1548866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_018709	AT	3	6	1548878	1548883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_018709	A	6	6	1548900	1548905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_018709	T	7	7	1549401	1549407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_018709	TTGG	2	8	1549409	1549416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_018709	TAA	2	6	1550233	1550238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_018709	AAAT	2	8	1550239	1550246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_018709	ATTA	2	8	1550286	1550293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_018709	ATTT	2	8	1550297	1550304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_018709	T	6	6	1550302	1550307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_018709	T	6	6	1552913	1552918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_018709	A	6	6	1552955	1552960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_018709	T	7	7	1559133	1559139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_018709	TA	3	6	1559159	1559164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_018709	ATATA	2	10	1569332	1569341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_018709	AG	3	6	1569374	1569379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_018709	GGGA	2	8	1569400	1569407	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_018709	AAAT	2	8	1569452	1569459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_018709	TTA	2	6	1569481	1569486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_018709	TAACT	2	10	1569575	1569584	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3059	NC_018709	TAC	2	6	1569598	1569603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_018709	ATT	2	6	1569607	1569612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_018709	A	6	6	1569613	1569618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_018709	A	6	6	1569642	1569647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_018709	TAT	2	6	1569648	1569653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_018709	ATAA	2	8	1574003	1574010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_018709	A	6	6	1574029	1574034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_018709	ATT	2	6	1574048	1574053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_018709	A	7	7	1574055	1574061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_018709	TCC	2	6	1574293	1574298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_018709	TTTA	2	8	1574320	1574327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_018709	GAT	2	6	1574333	1574338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_018709	T	6	6	1574356	1574361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_018709	T	6	6	1574418	1574423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_018709	TGAT	2	8	1574481	1574488	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_018709	ATTT	2	8	1574518	1574525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_018709	AGA	2	6	1574733	1574738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_018709	A	6	6	1574782	1574787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_018709	AT	3	6	1574801	1574806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_018709	T	6	6	1574864	1574869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_018709	TTA	2	6	1574875	1574880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_018709	A	6	6	1574897	1574902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_018709	A	6	6	1574912	1574917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_018709	AGA	3	9	1574949	1574957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_018709	AAC	2	6	1574974	1574979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_018709	AT	3	6	1575003	1575008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_018709	TTA	2	6	1575017	1575022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_018709	TAA	2	6	1575040	1575045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3088	NC_018709	TAT	2	6	1575051	1575056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_018709	T	6	6	1575072	1575077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_018709	TAT	2	6	1575099	1575104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_018709	ATT	2	6	1575112	1575117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_018709	ATA	2	6	1575125	1575130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_018709	ATT	2	6	1575134	1575139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_018709	ATTTTT	2	12	1577824	1577835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_018709	A	6	6	1583728	1583733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_018709	TA	3	6	1583734	1583739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_018709	ATA	3	9	1583737	1583745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_018709	ATC	2	6	1583762	1583767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_018709	GCA	2	6	1583844	1583849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_018709	A	6	6	1583874	1583879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_018709	AT	3	6	1583915	1583920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_018709	TACT	2	8	1583925	1583932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3103	NC_018709	T	6	6	1583936	1583941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_018709	TGG	2	6	1583957	1583962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_018709	TTGAA	2	10	1584436	1584445	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_018709	ATT	2	6	1584460	1584465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_018709	TAAAT	2	10	1584502	1584511	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_018709	GTG	2	6	1584600	1584605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_018709	TGC	2	6	1584635	1584640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_018709	CAC	2	6	1584674	1584679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_018709	TGG	2	6	1584778	1584783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_018709	GTGA	2	8	1584865	1584872	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_018709	A	6	6	1584956	1584961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_018709	AATA	2	8	1585040	1585047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_018709	AAT	2	6	1585069	1585074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_018709	T	8	8	1586809	1586816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_018709	TCG	2	6	1586826	1586831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_018709	TTAG	2	8	1589152	1589159	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_018709	AAAAT	2	10	1589169	1589178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_018709	ATTT	2	8	1589188	1589195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_018709	AC	3	6	1591147	1591152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_018709	A	6	6	1591169	1591174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_018709	TAAA	2	8	1591194	1591201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_018709	TAA	2	6	1591228	1591233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_018709	TAA	3	9	1591239	1591247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_018709	ATT	2	6	1591258	1591263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_018709	TTA	2	6	1591284	1591289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_018709	TAT	2	6	1591298	1591303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_018709	ATATAA	2	12	1591324	1591335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_018709	ATA	2	6	1594793	1594798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_018709	ATT	2	6	1594857	1594862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_018709	GGAT	2	8	1594864	1594871	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_018709	TATT	2	8	1594882	1594889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_018709	TAT	2	6	1594897	1594902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.