MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B-HRs chromosome

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018677	CTGTTG	4	24	3792	3815	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018677	TGTAGT	2	12	20457	20468	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018677	TATGTT	2	12	21077	21088	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018677	ACATGA	2	12	21737	21748	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018677	AGGAAC	4	24	25450	25473	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018677	AGGAAT	2	12	25480	25491	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018677	TGTAAG	2	12	25584	25595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018677	ATTTAC	2	12	26931	26942	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018677	TGCTCT	2	12	28750	28761	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018677	TGCTCT	5	30	28768	28797	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018677	TGTTAT	2	12	28798	28809	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018677	TAAAAT	2	12	30780	30791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018677	AACTTT	2	12	33641	33652	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018677	AAAACA	2	12	34309	34320	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018677	GTTAAG	3	18	35630	35647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018677	AAAAAG	2	12	42979	42990	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018677	CAATAC	2	12	54494	54505	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018677	AACAAA	2	12	55421	55432	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018677	TCTACA	2	12	60662	60673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018677	AAATAG	2	12	61932	61943	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018677	AAATAA	2	12	79395	79406	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018677	ATTGGT	2	12	99038	99049	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018677	ACTAAT	3	18	106175	106192	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018677	ACAGGA	2	12	109910	109921	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018677	ATTAAA	2	12	110458	110469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018677	ATAGTA	3	18	112232	112249	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018677	TGTTAA	2	12	117144	117155	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018677	GTTAAT	2	12	117458	117469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018677	AAAACA	10	60	118004	118063	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018677	TAAAAA	3	18	118075	118092	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018677	CTAAAA	3	18	118093	118110	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018677	TAAAAA	2	12	118111	118122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018677	TAAAAC	3	18	118130	118147	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018677	TAATAC	4	24	118148	118171	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018677	AAAAAG	2	12	118744	118755	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018677	AAAAGT	2	12	119070	119081	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018677	CTGACA	2	12	119938	119949	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018677	TGAAAT	2	12	122865	122876	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018677	TAATTT	2	12	123034	123045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018677	ATGTAT	2	12	124375	124386	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018677	AAAAAC	2	12	127435	127446	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018677	TAGGAG	2	12	147673	147684	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018677	TTTTTG	2	12	147820	147831	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018677	AAACCC	2	12	147995	148006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018677	ATTACT	2	12	148709	148720	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018677	GTGGTT	5	30	152068	152097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018677	GTTAGT	3	18	152113	152130	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018677	TTAAAG	2	12	157116	157127	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018677	TACTGT	2	12	157517	157528	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018677	CTGTTG	3	18	157628	157645	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018677	TAGCAG	3	18	157920	157937	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018677	AAAGAA	2	12	166192	166203	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018677	ATTTGT	2	12	173235	173246	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018677	TATTAG	3	18	173484	173501	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018677	TTTAGT	2	12	182232	182243	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018677	CTGTTT	2	12	182556	182567	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018677	TTTGTT	2	12	182922	182933	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018677	ATTTTT	2	12	185716	185727	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018677	TTACTG	3	18	185728	185745	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018677	TGTTTA	2	12	186172	186183	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018677	CATTAG	2	12	222436	222447	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018677	TTTAAA	2	12	227159	227170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018677	TTATTT	2	12	237594	237605	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018677	TTTTAT	2	12	237722	237733	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018677	TTTTTA	2	12	240812	240823	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018677	GTTTTT	2	12	242362	242373	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018677	AAACTC	2	12	243122	243133	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018677	GCTAAT	2	12	244859	244870	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018677	TTTTAG	2	12	246351	246362	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018677	TTTTGT	2	12	246375	246386	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018677	AGTTGT	2	12	252161	252172	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018677	GATGTT	2	12	252688	252699	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018677	ATTTAA	2	12	257055	257066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018677	TAACCG	3	18	257471	257488	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018677	TTATAG	3	18	257489	257506	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018677	GAATTT	2	12	259802	259813	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018677	ATTTAT	2	12	268755	268766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018677	AACAAA	2	12	269673	269684	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018677	TTTTCT	2	12	269963	269974	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018677	TAATTA	2	12	270482	270493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018677	AAAAAG	2	12	270849	270860	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018677	TTATTT	2	12	272478	272489	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018677	TATCTT	2	12	272576	272587	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018677	GTTATT	2	12	272945	272956	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018677	GATTTT	2	12	273725	273736	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018677	ATCTTT	2	12	273737	273748	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018677	ATTGTT	3	18	273749	273766	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018677	TTTTTA	2	12	273844	273855	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018677	TAAATG	2	12	273987	273998	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018677	TTTTAT	2	12	277536	277547	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018677	GAATTA	2	12	282214	282225	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018677	TTTTTA	2	12	283216	283227	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018677	ATGTTA	2	12	283636	283647	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018677	AGGTTT	2	12	319825	319836	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018677	ACAGAA	2	12	320158	320169	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018677	GTAAAC	2	12	320182	320193	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018677	TTTTCC	2	12	323285	323296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018677	CTTTCC	6	36	323297	323332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018677	CTTCCC	2	12	323333	323344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018677	ATAACA	2	12	324487	324498	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018677	TACAAA	2	12	324593	324604	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018677	TTTTAA	2	12	325392	325403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018677	TACTTT	2	12	325709	325720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018677	ACCTAT	2	12	330931	330942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018677	TGAATT	2	12	334600	334611	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018677	TCTTGT	2	12	338306	338317	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018677	GTAAGA	2	12	347067	347078	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018677	AGTGTT	2	12	349428	349439	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018677	TAGCAG	2	12	351027	351038	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_018677	TAGGAG	3	18	351039	351056	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018677	TAGGTG	2	12	351057	351068	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.