MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B-HRs chromosome

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018677	TTATT	2	10	3203	3212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018677	TGTTT	2	10	3222	3231	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018677	TTTTG	2	10	3247	3256	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018677	TAAAA	2	10	3759	3768	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018677	TAAAG	2	10	3929	3938	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018677	ACAAA	2	10	4038	4047	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018677	AATTA	2	10	4364	4373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018677	TCTAT	2	10	15918	15927	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018677	TGTAT	2	10	15928	15937	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018677	ATTTT	2	10	17570	17579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018677	TTTCT	2	10	19686	19695	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018677	TGTTT	2	10	20645	20654	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018677	TTTTG	2	10	21093	21102	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018677	ATTAT	2	10	21327	21336	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018677	TTTTA	2	10	21452	21461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018677	TGTAA	2	10	21500	21509	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018677	CTTTT	2	10	21527	21536	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018677	TGTGT	2	10	21888	21897	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018677	TGGGG	3	15	22252	22266	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018677	ACTTA	2	10	22344	22353	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018677	ACTAA	2	10	22561	22570	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018677	TATAA	2	10	22608	22617	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018677	TTGTG	2	10	25418	25427	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018677	TATTT	2	10	26481	26490	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018677	TTCAT	2	10	26890	26899	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018677	TAATT	2	10	27193	27202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018677	TACTT	2	10	27223	27232	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018677	TAAAA	2	10	27554	27563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018677	TTGTT	2	10	29110	29119	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018677	TTGTT	2	10	29271	29280	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018677	GAATT	2	10	29725	29734	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018677	GTAAA	2	10	30475	30484	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018677	ATAAA	2	10	30793	30802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018677	ATAAC	2	10	33251	33260	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018677	CATAT	2	10	33748	33757	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018677	ACAAA	2	10	34367	34376	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018677	CATAA	2	10	34450	34459	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018677	ACCTC	2	10	42427	42436	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_018677	ACCTC	2	10	42467	42476	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_018677	CTAAC	2	10	42721	42730	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_018677	ATTTT	2	10	42822	42831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018677	AAAAC	2	10	50387	50396	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018677	TTGTT	2	10	53534	53543	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018677	TTAAT	2	10	53704	53713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018677	CTTTC	2	10	53715	53724	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_018677	TTTTC	2	10	53783	53792	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018677	TTTTC	2	10	53890	53899	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018677	ACATA	2	10	53966	53975	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018677	AAACT	2	10	54148	54157	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018677	AATAT	2	10	54158	54167	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018677	AACAT	3	15	54168	54182	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018677	ACAAA	2	10	54283	54292	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018677	AAAAT	2	10	54940	54949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018677	ATAAA	2	10	55183	55192	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018677	CAAAA	2	10	55317	55326	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018677	ACAAA	2	10	59830	59839	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018677	AAACA	2	10	60008	60017	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018677	ATTTG	2	10	60056	60065	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018677	TACAA	2	10	60478	60487	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018677	TTAAC	2	10	60557	60566	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018677	CAAAA	2	10	61263	61272	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018677	AAATG	2	10	61612	61621	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018677	TATAT	2	10	61999	62008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018677	AAAAT	2	10	63349	63358	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018677	TTTTA	2	10	63651	63660	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018677	TTTTA	2	10	65888	65897	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018677	AGTGG	2	10	66499	66508	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018677	TTAAA	2	10	66594	66603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018677	GTATG	2	10	66654	66663	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018677	GTATT	2	10	66983	66992	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018677	TTAAA	2	10	67609	67618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018677	AATAA	2	10	74145	74154	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018677	TAAAT	2	10	87725	87734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018677	ATAAA	3	15	105649	105663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018677	CGTCT	2	10	105975	105984	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_018677	ATGCT	2	10	106357	106366	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018677	AACAA	2	10	106519	106528	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018677	AAAAC	2	10	106946	106955	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018677	TTAGG	2	10	109338	109347	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018677	GTTTG	2	10	110530	110539	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018677	ATTTT	2	10	110579	110588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018677	TTTCT	2	10	116759	116768	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018677	ATTGT	2	10	117548	117557	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018677	AAAGT	2	10	118724	118733	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018677	TAAAG	2	10	118798	118807	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018677	TAAAA	2	10	119020	119029	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018677	ATTAG	2	10	121237	121246	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018677	CCATA	2	10	122270	122279	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_018677	TATAT	2	10	124002	124011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018677	GTTTT	2	10	125960	125969	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018677	CAAAA	2	10	126150	126159	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018677	TAACT	2	10	126590	126599	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018677	AAAGA	2	10	127345	127354	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018677	ATAGT	2	10	127644	127653	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018677	GAAAA	2	10	127654	127663	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018677	GAAGT	2	10	127678	127687	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018677	ATTTT	2	10	134818	134827	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018677	TGTTT	2	10	135112	135121	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018677	ATTGT	2	10	135742	135751	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018677	ACAGA	2	10	139055	139064	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018677	AGTTA	2	10	139404	139413	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018677	AAAAT	2	10	141165	141174	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018677	TCTAA	2	10	148097	148106	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018677	ATCTA	2	10	148133	148142	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018677	ATCTA	2	10	148170	148179	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018677	GTAGT	2	10	149544	149553	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018677	GTTAA	2	10	151700	151709	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018677	TGTTA	2	10	152246	152255	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018677	TGTTA	2	10	152392	152401	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018677	AGGTA	2	10	152425	152434	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018677	TTTAT	2	10	155266	155275	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018677	TTTTA	2	10	155349	155358	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018677	CTTTT	2	10	155573	155582	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018677	ATAAA	2	10	155652	155661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018677	AGTTA	2	10	156881	156890	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018677	AACTA	2	10	157024	157033	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018677	TTTGT	2	10	157787	157796	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018677	CTTTT	2	10	163527	163536	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018677	GCTTT	2	10	164253	164262	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018677	GAATA	2	10	165520	165529	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018677	TTTTA	2	10	166373	166382	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018677	CCAAT	2	10	166460	166469	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_018677	ATATT	2	10	168126	168135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018677	ATTTT	2	10	178866	178875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018677	AACTA	2	10	179162	179171	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018677	ATTAC	2	10	180902	180911	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018677	AAAAG	2	10	181916	181925	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018677	AAAAC	2	10	182325	182334	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018677	CTTAG	2	10	182501	182510	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018677	TTTTA	2	10	182851	182860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018677	ATTTT	2	10	182962	182971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018677	TGTTA	2	10	183167	183176	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018677	GATAT	2	10	183203	183212	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018677	TAAAA	2	10	183881	183890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018677	ATTTT	2	10	185628	185637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018677	AGTTA	2	10	185841	185850	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018677	TTAAT	2	10	185989	185998	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018677	TTGTT	2	10	186225	186234	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018677	TTTTG	2	10	186473	186482	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018677	TGTTT	2	10	186493	186502	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018677	ATTTG	2	10	186745	186754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018677	TTTGT	2	10	186821	186830	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018677	ATTTT	2	10	186847	186856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018677	TTTTG	2	10	187279	187288	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018677	TAAAG	2	10	187545	187554	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018677	ATTTT	2	10	187856	187865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018677	CTTTT	2	10	205972	205981	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_018677	TTTTA	2	10	206566	206575	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018677	TTGTT	2	10	206576	206585	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018677	TGTTT	2	10	206686	206695	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018677	TGTTT	2	10	206799	206808	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018677	TATGT	2	10	207137	207146	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_018677	ATGTG	2	10	241312	241321	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_018677	TTTTG	2	10	246447	246456	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_018677	GAAAT	2	10	251979	251988	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_018677	AGATT	2	10	252176	252185	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.