MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B-HRs chromosome

Total Repeats: 4260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018677	T	6	6	2995	3000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018677	TGT	2	6	3004	3009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018677	TATT	2	8	3023	3030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018677	TCT	2	6	3062	3067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018677	GTT	2	6	3073	3078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018677	T	8	8	3104	3111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018677	T	6	6	3115	3120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018677	T	9	9	3122	3130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018677	T	7	7	3150	3156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018677	TTA	3	9	3161	3169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018677	GTT	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018677	T	7	7	3191	3197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018677	TTATT	2	10	3203	3212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018677	TGTTT	2	10	3222	3231	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018677	TTTTG	2	10	3247	3256	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018677	TGTA	2	8	3267	3274	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018677	TGT	2	6	3282	3287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018677	AGTA	2	8	3294	3301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018677	AGT	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018677	ATA	2	6	3335	3340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018677	ATG	2	6	3342	3347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018677	T	6	6	3367	3372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018677	TGT	2	6	3400	3405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018677	ATT	2	6	3412	3417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018677	TAAT	2	8	3422	3429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018677	A	8	8	3430	3437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018677	AT	4	8	3447	3454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018677	GTT	2	6	3488	3493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018677	GTTT	2	8	3503	3510	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018677	GGTT	2	8	3524	3531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018677	TATT	2	8	3543	3550	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018677	TTA	2	6	3552	3557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018677	TTTA	2	8	3590	3597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018677	GTT	2	6	3625	3630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018677	TAT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018677	TTA	2	6	3679	3684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018677	TAAAA	2	10	3759	3768	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018677	GTT	2	6	3776	3781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018677	CTGTTG	4	24	3792	3815	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018677	A	7	7	3835	3841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018677	TAT	2	6	3866	3871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018677	TTA	3	9	3872	3880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018677	T	6	6	3897	3902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018677	GTT	2	6	3911	3916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018677	TAAAG	2	10	3929	3938	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018677	GTA	2	6	3948	3953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018677	A	6	6	3953	3958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018677	TAT	2	6	3976	3981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018677	T	7	7	3988	3994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018677	TAA	3	9	4001	4009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018677	AAC	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018677	CAA	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018677	ACAAA	2	10	4038	4047	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018677	TAA	2	6	4074	4079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018677	ACA	2	6	4080	4085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018677	AAC	2	6	4116	4121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018677	TAA	2	6	4137	4142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018677	ACA	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018677	TAC	2	6	4175	4180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018677	AACA	2	8	4200	4207	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018677	TA	3	6	4214	4219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018677	AAC	2	6	4240	4245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018677	A	7	7	4265	4271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018677	ACAA	2	8	4306	4313	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018677	A	9	9	4315	4323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018677	A	8	8	4350	4357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018677	AATTA	2	10	4364	4373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018677	TCTAT	2	10	15918	15927	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018677	TGTAT	2	10	15928	15937	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018677	TTGT	2	8	17530	17537	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018677	TAT	2	6	17557	17562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018677	ATTTT	2	10	17570	17579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018677	T	9	9	17576	17584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018677	ACA	2	6	17591	17596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018677	T	9	9	17633	17641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018677	T	6	6	17647	17652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018677	ATA	2	6	17655	17660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018677	T	9	9	18722	18730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018677	ATTG	2	8	18733	18740	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018677	T	6	6	18741	18746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018677	TTAG	2	8	18748	18755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018677	TGTA	2	8	18768	18775	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018677	GAT	2	6	18777	18782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018677	TTG	2	6	18785	18790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018677	T	6	6	18837	18842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018677	TGT	2	6	18910	18915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018677	TGT	2	6	18938	18943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018677	TGT	2	6	18987	18992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018677	TG	3	6	19036	19041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018677	A	8	8	19093	19100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018677	TTTA	2	8	19613	19620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018677	TA	3	6	19639	19644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018677	ACC	2	6	19674	19679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_018677	TTTCT	2	10	19686	19695	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018677	TAC	2	6	19767	19772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018677	T	7	7	19794	19800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018677	TAA	2	6	19821	19826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018677	AAAC	2	8	19840	19847	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018677	CAA	2	6	19890	19895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018677	TC	3	6	19903	19908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018677	TTTA	2	8	19911	19918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018677	CAA	2	6	19947	19952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018677	TATT	2	8	19965	19972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018677	AAC	2	6	19973	19978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018677	T	8	8	20025	20032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018677	TTG	2	6	20035	20040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018677	T	7	7	20063	20069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018677	ATT	2	6	20088	20093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018677	TAT	2	6	20106	20111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018677	CT	3	6	20134	20139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018677	CTT	2	6	20164	20169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018677	T	8	8	20171	20178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018677	TTA	2	6	20188	20193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018677	TGT	2	6	20257	20262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018677	T	10	10	20277	20286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018677	TAT	2	6	20291	20296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018677	TTA	2	6	20332	20337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018677	TTTA	2	8	20406	20413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018677	AT	3	6	20416	20421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018677	TAT	2	6	20437	20442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018677	TGTAGT	2	12	20457	20468	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018677	T	10	10	20541	20550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018677	T	8	8	20582	20589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018677	TTA	2	6	20594	20599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018677	TCT	2	6	20603	20608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018677	TGT	2	6	20618	20623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018677	TGTTT	2	10	20645	20654	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018677	A	7	7	20666	20672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018677	TTA	2	6	20703	20708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018677	TGC	2	6	20736	20741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018677	ATT	2	6	20814	20819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018677	GTTA	2	8	20860	20867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018677	TGT	2	6	20877	20882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018677	GTT	3	9	20933	20941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018677	T	8	8	20949	20956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018677	T	6	6	20965	20970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018677	T	7	7	20980	20986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018677	GTT	2	6	20987	20992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018677	T	6	6	21002	21007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018677	TGTT	2	8	21012	21019	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018677	TATGTT	2	12	21077	21088	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018677	TTTTG	2	10	21093	21102	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018677	TTTA	2	8	21110	21117	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018677	TGT	3	9	21123	21131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018677	T	7	7	21171	21177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018677	TAT	3	9	21193	21201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018677	T	6	6	21201	21206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018677	TGT	2	6	21230	21235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018677	TGT	2	6	21237	21242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018677	TAT	2	6	21281	21286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018677	TGT	2	6	21318	21323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018677	ATTAT	2	10	21327	21336	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018677	TGT	2	6	21364	21369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018677	TAA	2	6	21375	21380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018677	TTGA	2	8	21418	21425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018677	TTTTA	2	10	21452	21461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018677	TGTA	2	8	21466	21473	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018677	TAT	2	6	21478	21483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018677	TGTAA	2	10	21500	21509	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018677	CTTTT	2	10	21527	21536	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
161	NC_018677	ACA	3	9	21537	21545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_018677	TATT	3	12	21576	21587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018677	T	6	6	21597	21602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018677	GTT	2	6	21603	21608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_018677	GTT	2	6	21677	21682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_018677	T	7	7	21708	21714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_018677	TGT	2	6	21724	21729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_018677	ATA	2	6	21832	21837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_018677	GT	3	6	21858	21863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_018677	TGTGT	2	10	21888	21897	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_018677	TGT	2	6	21939	21944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_018677	TG	5	10	22195	22204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_018677	TGGGG	3	15	22252	22266	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_018677	ATA	2	6	40505	40510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_018677	TAA	2	6	40511	40516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_018677	A	7	7	40619	40625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_018677	TAA	2	6	40631	40636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_018677	AG	3	6	40653	40658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_018677	TAA	3	9	42323	42331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_018677	ACCTC	2	10	42467	42476	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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481	NC_018677	AAAAAG	2	12	42979	42990	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_018677	A	9	9	43032	43040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_018677	ATAA	3	12	43042	43053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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