MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium acidurici 9a chromosome

Total Repeats: 2182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018664	AAGA	2	8	3128	3135	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018664	CCTT	2	8	11258	11265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018664	GTGA	2	8	11533	11540	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018664	AGAA	2	8	13129	13136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018664	CATT	2	8	14025	14032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018664	GGTG	2	8	14217	14224	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018664	ATTA	2	8	20368	20375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018664	AATA	2	8	20572	20579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018664	ATAA	2	8	21317	21324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018664	AAAT	2	8	21560	21567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018664	AAGG	2	8	21571	21578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018664	GATT	2	8	25520	25527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018664	TTTA	2	8	27728	27735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018664	TTAA	2	8	27771	27778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018664	AATT	2	8	28078	28085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018664	AAAC	2	8	28092	28099	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018664	AATT	2	8	29860	29867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018664	ATTT	2	8	31258	31265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018664	CATA	2	8	31355	31362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018664	TAGA	2	8	31404	31411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018664	GCTT	2	8	31428	31435	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018664	CAAA	2	8	31523	31530	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018664	ATTC	2	8	31743	31750	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018664	TAAA	2	8	31952	31959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018664	ATTT	2	8	32620	32627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018664	TAAC	2	8	32810	32817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018664	TGGT	2	8	33447	33454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018664	TAAT	2	8	36929	36936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018664	ATAA	2	8	37015	37022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018664	ATTT	2	8	38863	38870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018664	ATAA	2	8	39749	39756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018664	CCTT	2	8	40031	40038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018664	ATTG	2	8	40546	40553	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018664	TAGA	2	8	41234	41241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018664	ATTA	2	8	41345	41352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018664	TAAC	2	8	41378	41385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018664	AAAT	2	8	41424	41431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018664	AGAA	2	8	41478	41485	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018664	ATTT	2	8	42349	42356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018664	TTGC	2	8	45803	45810	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018664	ATTT	2	8	47762	47769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018664	ATAA	2	8	51642	51649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018664	AAGG	2	8	51880	51887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018664	GAAC	2	8	52623	52630	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018664	TCAT	2	8	52947	52954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018664	AAGA	2	8	52996	53003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018664	TAAA	2	8	53409	53416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018664	GTTT	2	8	53522	53529	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018664	CTAA	2	8	53555	53562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018664	TATG	2	8	53603	53610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018664	AGTA	2	8	63030	63037	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018664	TATG	2	8	63145	63152	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018664	ATTA	2	8	66982	66989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018664	TACT	2	8	67026	67033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018664	AACC	2	8	70490	70497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018664	AAAT	2	8	70803	70810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018664	TTAA	2	8	73744	73751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018664	AAAT	2	8	92456	92463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018664	ATAA	2	8	92533	92540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018664	TAAT	2	8	92551	92558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018664	CCCT	2	8	94870	94877	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_018664	TAAA	2	8	99462	99469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018664	GGAA	2	8	101453	101460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018664	AGGA	2	8	101708	101715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018664	ATGA	2	8	103262	103269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018664	ATTT	2	8	104418	104425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018664	AATA	2	8	106203	106210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018664	TGAC	2	8	106509	106516	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018664	ATAC	2	8	106533	106540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018664	CATA	2	8	109500	109507	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018664	AAAT	2	8	109722	109729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018664	AAAT	2	8	109865	109872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018664	AATA	2	8	109945	109952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018664	ATTT	2	8	116789	116796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018664	AATA	2	8	118619	118626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018664	ATTA	2	8	118726	118733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018664	TTAG	2	8	119122	119129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018664	ACAT	2	8	122329	122336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018664	TGAT	2	8	123087	123094	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018664	AAGA	2	8	124380	124387	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018664	CATA	2	8	125908	125915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018664	ATAA	2	8	128632	128639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018664	ATAA	2	8	128752	128759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018664	ATAA	2	8	129443	129450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018664	CAAT	2	8	131487	131494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018664	ATAG	2	8	135390	135397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018664	AAGG	2	8	135445	135452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018664	CAAA	2	8	138203	138210	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018664	TTTA	2	8	138254	138261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018664	TAAA	2	8	141903	141910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018664	ATTT	2	8	142045	142052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018664	AAAG	2	8	142060	142067	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018664	TAAA	2	8	143146	143153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018664	TTAA	2	8	148392	148399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018664	TTTA	2	8	156175	156182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018664	ATTA	2	8	157543	157550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018664	TAAT	2	8	158467	158474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018664	CTTT	2	8	160856	160863	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018664	AGGG	2	8	161066	161073	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018664	AAGG	2	8	175327	175334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018664	AAGG	2	8	176482	176489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018664	TAAT	2	8	179885	179892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018664	TTTG	2	8	180019	180026	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018664	TTTA	2	8	180160	180167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018664	AAAG	2	8	183899	183906	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018664	AGAA	2	8	183957	183964	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018664	ATTT	2	8	184790	184797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018664	TATT	2	8	186756	186763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018664	GGAA	2	8	187345	187352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018664	TGAA	2	8	195654	195661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018664	TAAT	2	8	197985	197992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018664	TGTA	2	8	199121	199128	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018664	AAAC	2	8	203793	203800	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018664	TAAA	2	8	206410	206417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018664	AAAG	2	8	208444	208451	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018664	ACTT	2	8	211324	211331	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018664	ATCT	2	8	211336	211343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018664	TAAA	2	8	215782	215789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018664	TAAA	2	8	216377	216384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018664	GATA	2	8	216417	216424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018664	AAAG	2	8	217545	217552	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018664	ATAA	2	8	220512	220519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018664	GATA	2	8	222093	222100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018664	TAAA	2	8	230534	230541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018664	TGTA	2	8	230991	230998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018664	AAAG	2	8	232815	232822	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018664	AAGG	2	8	237276	237283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018664	GTAT	2	8	237766	237773	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018664	TAAA	2	8	239010	239017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018664	GTTG	2	8	239697	239704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018664	ATTC	2	8	239969	239976	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018664	AATG	2	8	240127	240134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018664	TAAA	2	8	241215	241222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018664	GTTG	2	8	241361	241368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018664	AAAT	2	8	243312	243319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018664	TTTA	2	8	251258	251265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018664	GAGG	2	8	256018	256025	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018664	AAGT	2	8	257401	257408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018664	TTTA	2	8	257583	257590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018664	ATAA	2	8	258522	258529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018664	AAAT	2	8	259409	259416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018664	TAAA	2	8	259436	259443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018664	TAAA	2	8	260311	260318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018664	ATAA	2	8	260356	260363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018664	AGGA	2	8	260388	260395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018664	TTAG	2	8	264714	264721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018664	TAAA	2	8	269024	269031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018664	TAAT	2	8	274620	274627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018664	TAAT	2	8	278140	278147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018664	AGTA	2	8	279699	279706	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018664	TATT	2	8	281865	281872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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