MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium acidurici 9a chromosome

Total Repeats: 16797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018664	TAA	2	6	306194	306199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_018664	TAT	2	6	306223	306228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_018664	AT	3	6	306239	306244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_018664	TA	3	6	306245	306250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_018664	TATACT	2	12	306957	306968	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1506	NC_018664	ATTC	2	8	306971	306978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_018664	AAAG	2	8	306982	306989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_018664	ATA	2	6	307012	307017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_018664	AAT	2	6	307070	307075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_018664	TA	3	6	307096	307101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_018664	AGG	2	6	307171	307176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_018664	AAT	2	6	307235	307240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_018664	CTAA	2	8	307263	307270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_018664	TA	3	6	307271	307276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_018664	AGG	2	6	307278	307283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_018664	T	6	6	312479	312484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_018664	TA	3	6	313146	313151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_018664	GAT	2	6	313183	313188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_018664	ATA	2	6	313197	313202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_018664	TAAAT	2	10	313231	313240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_018664	AT	3	6	313246	313251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_018664	TTA	2	6	313305	313310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_018664	CT	3	6	313339	313344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_018664	AAT	2	6	313345	313350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_018664	TAA	2	6	313357	313362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_018664	ATA	2	6	313373	313378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_018664	AATATA	2	12	313381	313392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_018664	AGG	2	6	313393	313398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_018664	AAAT	2	8	313690	313697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_018664	AAGA	2	8	313754	313761	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_018664	TATAAA	2	12	313834	313845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_018664	A	6	6	315504	315509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_018664	T	7	7	315596	315602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_018664	ATA	2	6	315609	315614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_018664	TGT	2	6	315629	315634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_018664	TGT	2	6	315637	315642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_018664	TTA	2	6	315665	315670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_018664	A	7	7	315681	315687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_018664	T	7	7	315693	315699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_018664	A	8	8	315701	315708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_018664	TAA	2	6	315737	315742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_018664	ATA	2	6	315752	315757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_018664	AATA	2	8	315791	315798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_018664	AGG	2	6	315813	315818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_018664	TGG	2	6	316842	316847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_018664	TTA	2	6	316855	316860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_018664	CCA	2	6	316872	316877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_018664	T	6	6	316878	316883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_018664	AGTAT	2	10	316921	316930	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_018664	TA	3	6	316931	316936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_018664	TAA	2	6	316942	316947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_018664	TAAAA	2	10	318531	318540	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_018664	TTTTA	2	10	318565	318574	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_018664	A	6	6	318586	318591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_018664	AT	4	8	318624	318631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_018664	ATA	2	6	318639	318644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_018664	A	6	6	318644	318649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_018664	A	6	6	318658	318663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_018664	A	6	6	318716	318721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_018664	ATA	2	6	318748	318753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_018664	AGG	2	6	318768	318773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_018664	GAA	2	6	320833	320838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_018664	TATT	2	8	320847	320854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_018664	A	7	7	320939	320945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_018664	TAT	2	6	320949	320954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_018664	AT	4	8	320965	320972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_018664	A	7	7	321008	321014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_018664	CTT	2	6	321027	321032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_018664	T	7	7	321046	321052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_018664	AT	3	6	321053	321058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_018664	AGG	2	6	321069	321074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_018664	AAT	3	9	322039	322047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_018664	AAT	2	6	322063	322068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_018664	TCTG	2	8	322071	322078	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_018664	TAA	2	6	322084	322089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_018664	GAT	2	6	322093	322098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_018664	AAC	2	6	322111	322116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_018664	A	6	6	323847	323852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_018664	T	7	7	323881	323887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_018664	TACA	2	8	323910	323917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1581	NC_018664	GAG	2	6	323948	323953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_018664	GAG	2	6	323956	323961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_018664	CTTTA	2	10	325333	325342	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1584	NC_018664	AT	3	6	325354	325359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_018664	TGAC	2	8	325370	325377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1586	NC_018664	TCAG	2	8	325381	325388	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1587	NC_018664	A	6	6	325402	325407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_018664	AGG	2	6	325411	325416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_018664	AT	3	6	325418	325423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_018664	TTATTT	2	12	331518	331529	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_018664	TA	3	6	331535	331540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_018664	TCC	2	6	332189	332194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_018664	AATT	2	8	332197	332204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_018664	A	6	6	332474	332479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_018664	TAT	2	6	332505	332510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_018664	AAC	2	6	332530	332535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_018664	AT	3	6	332548	332553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_018664	AAT	2	6	332607	332612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_018664	TAGT	2	8	332616	332623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_018664	TAAATA	2	12	332624	332635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_018664	T	6	6	332653	332658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_018664	TA	4	8	332681	332688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_018664	AT	3	6	332694	332699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_018664	TTA	3	9	336034	336042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_018664	GAAG	2	8	336048	336055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_018664	TAT	2	6	336079	336084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_018664	T	6	6	336084	336089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_018664	TTC	2	6	336138	336143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_018664	A	6	6	336166	336171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_018664	ATA	2	6	336173	336178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_018664	AT	3	6	339851	339856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_018664	AGA	2	6	339871	339876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_018664	ATT	2	6	341319	341324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_018664	TCA	2	6	341360	341365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_018664	AT	3	6	341367	341372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_018664	A	6	6	341373	341378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_018664	A	6	6	341393	341398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_018664	AGT	2	6	341433	341438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_018664	A	7	7	341464	341470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_018664	T	6	6	341546	341551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_018664	TATGA	2	10	341558	341567	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_018664	A	6	6	341586	341591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_018664	A	7	7	341595	341601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_018664	GAA	2	6	343497	343502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_018664	TAAA	2	8	345500	345507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_018664	TAAA	2	8	345518	345525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_018664	A	6	6	345523	345528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_018664	TA	3	6	345536	345541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_018664	TAG	2	6	347264	347269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_018664	TCTTTA	2	12	347283	347294	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1631	NC_018664	TTC	2	6	347297	347302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_018664	T	6	6	347305	347310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_018664	CATA	2	8	347375	347382	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1634	NC_018664	CAT	2	6	347386	347391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_018664	AAT	2	6	347462	347467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_018664	TAAT	2	8	347498	347505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_018664	CTT	2	6	347602	347607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1638	NC_018664	ATT	2	6	347641	347646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1640	NC_018664	ATA	2	6	347668	347673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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