MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 5216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018656	TCT	2	6	356131	356136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_018656	TCT	2	6	356143	356148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_018656	A	6	6	356153	356158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_018656	TTC	2	6	356160	356165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_018656	GAA	2	6	356173	356178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_018656	T	6	6	356475	356480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_018656	TGT	2	6	356514	356519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_018656	TGA	2	6	356535	356540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_018656	AAT	2	6	357129	357134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_018656	T	7	7	357956	357962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_018656	TAT	2	6	358420	358425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_018656	TAC	2	6	358433	358438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_018656	TAA	2	6	358443	358448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_018656	ATA	2	6	358462	358467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_018656	TAAT	2	8	358473	358480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_018656	AAT	2	6	358498	358503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_018656	TAA	2	6	358507	358512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_018656	TAT	2	6	358513	358518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_018656	AAC	2	6	358565	358570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_018656	TTTG	2	8	358856	358863	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_018656	A	6	6	358893	358898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_018656	ATATGG	2	12	358915	358926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_018656	GTA	2	6	358947	358952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_018656	TTG	2	6	358984	358989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_018656	A	6	6	359021	359026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_018656	TGA	2	6	359058	359063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_018656	A	7	7	359070	359076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_018656	AGC	2	6	359091	359096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_018656	A	6	6	359104	359109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_018656	TCA	2	6	359110	359115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_018656	TC	3	6	359161	359166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_018656	AACA	2	8	359212	359219	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_018656	AAT	2	6	360399	360404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_018656	AAT	2	6	360409	360414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_018656	AGAATT	2	12	360416	360427	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1037	NC_018656	CGT	2	6	362628	362633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1040	NC_018656	ATTCA	2	10	362733	362742	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1041	NC_018656	AAT	2	6	363029	363034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018656	A	7	7	363455	363461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_018656	TCT	3	9	363480	363488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_018656	CTAATT	2	12	363513	363524	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1045	NC_018656	T	6	6	363544	363549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_018656	GTC	2	6	363603	363608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1048	NC_018656	AAG	2	6	367729	367734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_018656	ATT	2	6	367757	367762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018656	TTAAAA	2	12	368794	368805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1052	NC_018656	CAA	2	6	369728	369733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_018656	ATT	2	6	370544	370549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_018656	TTCTTT	2	12	370557	370568	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1055	NC_018656	T	6	6	370566	370571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_018656	T	7	7	370607	370613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_018656	AAT	2	6	376367	376372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_018656	CAT	2	6	377094	377099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1062	NC_018656	T	6	6	382147	382152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_018656	ATC	2	6	382165	382170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_018656	CTTT	2	8	382191	382198	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_018656	TTC	2	6	383563	383568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_018656	TAAA	2	8	384817	384824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_018656	ACAG	2	8	384836	384843	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_018656	TGG	2	6	388006	388011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_018656	TGCAAT	2	12	388016	388027	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1071	NC_018656	TGG	2	6	388091	388096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_018656	ACA	2	6	388101	388106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_018656	TAGA	2	8	388210	388217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1075	NC_018656	GATTTA	2	12	388296	388307	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1077	NC_018656	TGA	2	6	388334	388339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_018656	TGA	2	6	388442	388447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_018656	TCT	2	6	388452	388457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_018656	CT	3	6	388456	388461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_018656	TAT	2	6	388516	388521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_018656	ATGT	2	8	388554	388561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_018656	ATG	2	6	388575	388580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1086	NC_018656	ATT	2	6	388614	388619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_018656	TAAAA	2	10	390113	390122	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_018656	A	6	6	390119	390124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_018656	GTG	2	6	392241	392246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_018656	CAA	2	6	392318	392323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1097	NC_018656	TTTCA	2	10	394639	394648	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_018656	TAT	3	9	395164	395172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_018656	AT	3	6	395226	395231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_018656	A	6	6	395341	395346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_018656	ATC	2	6	395429	395434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_018656	T	6	6	396557	396562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_018656	ATT	2	6	396564	396569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_018656	CTT	2	6	396570	396575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_018656	ACT	2	6	396668	396673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1108	NC_018656	ATT	2	6	396800	396805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_018656	T	7	7	398744	398750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_018656	TAT	2	6	399256	399261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_018656	T	7	7	399287	399293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_018656	TCTT	2	8	402183	402190	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_018656	ATC	2	6	402196	402201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_018656	ATTACT	2	12	402212	402223	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1115	NC_018656	AAC	2	6	402268	402273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_018656	CTT	2	6	403901	403906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_018656	T	6	6	403905	403910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_018656	T	6	6	403921	403926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_018656	TGA	2	6	403995	404000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1121	NC_018656	AAT	2	6	405912	405917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_018656	TA	3	6	407543	407548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_018656	T	6	6	409247	409252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_018656	CAT	2	6	409257	409262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_018656	TGA	2	6	409293	409298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_018656	TCT	2	6	409299	409304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_018656	TA	3	6	409308	409313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_018656	TTCA	2	8	409354	409361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_018656	GAT	2	6	409999	410004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_018656	AAT	2	6	411000	411005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_018656	T	6	6	411031	411036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_018656	AATTTA	2	12	412726	412737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_018656	TA	3	6	412736	412741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_018656	TGG	2	6	412756	412761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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