MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 5216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018656	TAG	2	6	1627824	1627829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_018656	GAT	2	6	1629965	1629970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_018656	AT	3	6	1632962	1632967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_018656	AAT	2	6	1632976	1632981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_018656	ATT	3	9	1633675	1633683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_018656	AAT	2	6	1633728	1633733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_018656	TA	3	6	1633737	1633742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_018656	TACAT	2	10	1633751	1633760	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5009	NC_018656	C	6	6	1634276	1634281	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5010	NC_018656	A	6	6	1636460	1636465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_018656	TCATAT	2	12	1636714	1636725	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5012	NC_018656	AAAATA	2	12	1638155	1638166	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_018656	ACT	2	6	1638195	1638200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_018656	ACA	2	6	1638256	1638261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_018656	CA	3	6	1638260	1638265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_018656	TAA	2	6	1638269	1638274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_018656	AAAT	2	8	1638289	1638296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_018656	A	6	6	1638506	1638511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_018656	TAA	2	6	1638599	1638604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_018656	TATAG	2	10	1638619	1638628	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_018656	ATT	2	6	1639797	1639802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_018656	TGCAC	2	10	1639822	1639831	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5023	NC_018656	TAT	2	6	1639847	1639852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_018656	AAATT	2	10	1639859	1639868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_018656	A	6	6	1640237	1640242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_018656	ACA	2	6	1640265	1640270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_018656	TAT	2	6	1642628	1642633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_018656	T	6	6	1644802	1644807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_018656	TGA	2	6	1645625	1645630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_018656	A	6	6	1645651	1645656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_018656	TGA	2	6	1645657	1645662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_018656	TAA	2	6	1645709	1645714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_018656	AG	3	6	1645802	1645807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_018656	TC	3	6	1645812	1645817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_018656	ATCT	2	8	1646315	1646322	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_018656	ATAC	2	8	1647065	1647072	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_018656	A	7	7	1647670	1647676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_018656	GTA	2	6	1647759	1647764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_018656	AC	3	6	1647823	1647828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_018656	T	7	7	1647849	1647855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_018656	GTC	2	6	1647896	1647901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_018656	TGA	2	6	1647902	1647907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_018656	TC	3	6	1647910	1647915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_018656	AAT	2	6	1647953	1647958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_018656	ATC	2	6	1647993	1647998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_018656	AAT	2	6	1648066	1648071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_018656	ATA	2	6	1648109	1648114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_018656	TA	3	6	1648147	1648152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_018656	TCA	2	6	1648160	1648165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_018656	TCA	2	6	1648200	1648205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_018656	A	6	6	1648205	1648210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_018656	T	7	7	1648244	1648250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_018656	T	7	7	1648271	1648277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_018656	T	8	8	1648291	1648298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_018656	ATC	2	6	1648303	1648308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_018656	T	7	7	1648321	1648327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_018656	TTG	2	6	1648392	1648397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_018656	ACA	2	6	1648417	1648422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_018656	AATA	2	8	1650775	1650782	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_018656	A	8	8	1650786	1650793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_018656	ATT	2	6	1650798	1650803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_018656	AAT	2	6	1652159	1652164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_018656	ATTC	2	8	1653115	1653122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_018656	T	7	7	1654860	1654866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_018656	AAT	2	6	1654901	1654906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_018656	CTAA	2	8	1654924	1654931	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_018656	T	8	8	1654938	1654945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_018656	TAG	2	6	1654989	1654994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_018656	AGAA	2	8	1655008	1655015	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_018656	GAA	2	6	1655051	1655056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_018656	AT	3	6	1655094	1655099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_018656	TA	3	6	1656200	1656205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_018656	T	8	8	1656228	1656235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_018656	TTTCA	2	10	1657128	1657137	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5075	NC_018656	TTTCTT	2	12	1657139	1657150	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5076	NC_018656	AAAC	2	8	1657202	1657209	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5077	NC_018656	ATC	2	6	1657233	1657238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5079	NC_018656	CAT	2	6	1657295	1657300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_018656	ATCT	2	8	1657311	1657318	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_018656	TAT	2	6	1657319	1657324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_018656	ATA	2	6	1657329	1657334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_018656	AT	3	6	1657345	1657350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_018656	T	7	7	1657356	1657362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_018656	T	6	6	1657374	1657379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_018656	TCT	2	6	1657426	1657431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_018656	T	6	6	1657435	1657440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_018656	T	6	6	1657845	1657850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_018656	CAT	2	6	1657851	1657856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_018656	TAT	2	6	1657921	1657926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_018656	TCT	2	6	1657933	1657938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_018656	AGC	2	6	1657947	1657952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_018656	ACTTG	2	10	1658062	1658071	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5094	NC_018656	AC	3	6	1658084	1658089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_018656	TTC	2	6	1658095	1658100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5097	NC_018656	TCA	2	6	1658131	1658136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_018656	ATT	2	6	1658152	1658157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_018656	CCCA	2	8	1658169	1658176	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5100	NC_018656	AAC	2	6	1658208	1658213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_018656	GAAA	2	8	1658257	1658264	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_018656	CAAT	2	8	1658284	1658291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5103	NC_018656	CTT	2	6	1658292	1658297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_018656	AAT	2	6	1658318	1658323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_018656	TTCTTT	2	12	1658384	1658395	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5106	NC_018656	T	6	6	1658393	1658398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_018656	CATCT	2	10	1658399	1658408	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5108	NC_018656	CTT	2	6	1658419	1658424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_018656	CAT	2	6	1658443	1658448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_018656	ATT	2	6	1658489	1658494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_018656	TTCTTT	2	12	1658519	1658530	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5112	NC_018656	T	6	6	1658528	1658533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_018656	T	7	7	1658536	1658542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_018656	CA	3	6	1658608	1658613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_018656	TGG	2	6	1658621	1658626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_018656	CAA	2	6	1658674	1658679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_018656	TA	3	6	1658713	1658718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_018656	ACAA	2	8	1658742	1658749	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5119	NC_018656	CAT	2	6	1658797	1658802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_018656	TGT	2	6	1658827	1658832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_018656	CTAA	2	8	1658871	1658878	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_018656	T	6	6	1658886	1658891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_018656	GTA	2	6	1658899	1658904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5126	NC_018656	T	7	7	1659002	1659008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_018656	TTC	2	6	1659056	1659061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_018656	AT	3	6	1659066	1659071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_018656	TCA	2	6	1659094	1659099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_018656	AAT	2	6	1659106	1659111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_018656	ATA	2	6	1659153	1659158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_018656	AAT	2	6	1660364	1660369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5134	NC_018656	ATG	2	6	1664074	1664079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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