MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1 chromosome

Total Repeats: 659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018655	AATT	2	8	7921	7928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018655	TACT	2	8	7973	7980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018655	TGTT	2	8	24639	24646	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018655	CTAA	2	8	31359	31366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018655	TAAA	2	8	31398	31405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018655	CATT	2	8	36328	36335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018655	TTAC	2	8	44029	44036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018655	AGAA	2	8	44269	44276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018655	AAAT	2	8	44644	44651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018655	AGTT	2	8	47570	47577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018655	CCTA	2	8	61629	61636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018655	AAAT	2	8	64929	64936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018655	ATCT	2	8	65001	65008	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018655	TGAA	2	8	65678	65685	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018655	TTGC	2	8	65730	65737	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018655	GCCT	2	8	67131	67138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018655	AATC	2	8	69168	69175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018655	TAAT	2	8	70829	70836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018655	ATGA	2	8	74961	74968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018655	ATTC	2	8	74970	74977	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018655	AGAA	2	8	78645	78652	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018655	ATTA	2	8	82409	82416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018655	TTTA	2	8	83463	83470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018655	TAAA	2	8	87111	87118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018655	ATTA	2	8	105711	105718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018655	TTTC	2	8	105865	105872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018655	CATT	2	8	106245	106252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018655	TACT	2	8	106341	106348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018655	ATTT	2	8	107650	107657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018655	AAAT	2	8	108769	108776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018655	TCTT	2	8	108817	108824	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018655	AATT	2	8	109137	109144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018655	CTTT	2	8	109368	109375	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018655	TAAT	2	8	109565	109572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018655	TGTC	2	8	113548	113555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018655	CTTC	2	8	117380	117387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018655	CAAA	2	8	118419	118426	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018655	AGAA	2	8	122452	122459	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018655	TATT	2	8	123804	123811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018655	GTTC	2	8	124568	124575	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018655	ACAA	2	8	126163	126170	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018655	ATAA	2	8	136043	136050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018655	TTCT	2	8	136217	136224	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018655	TCTA	2	8	139352	139359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018655	AATG	2	8	143684	143691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018655	TCAA	2	8	143713	143720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018655	ATTA	2	8	143734	143741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018655	AAAC	2	8	149848	149855	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018655	AATT	2	8	155651	155658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018655	TTGT	2	8	156116	156123	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018655	TCCC	2	8	156237	156244	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_018655	ATTA	2	8	157230	157237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018655	TTTG	2	8	167021	167028	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018655	TTTC	2	8	173728	173735	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018655	TTTC	2	8	174230	174237	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018655	TTAG	2	8	175369	175376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018655	GATC	2	8	180301	180308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018655	ATCT	2	8	183155	183162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018655	TTTC	2	8	184372	184379	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018655	AAAG	2	8	184398	184405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018655	ACTT	2	8	184474	184481	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018655	AAAG	2	8	184507	184514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018655	ATTG	2	8	185066	185073	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018655	TGCT	2	8	187107	187114	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018655	TGTA	2	8	187681	187688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018655	CATC	2	8	188029	188036	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018655	TTTC	2	8	188075	188082	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018655	TAAA	2	8	188485	188492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018655	TTCT	2	8	188740	188747	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018655	TAAA	2	8	189530	189537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018655	TGAT	2	8	189551	189558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018655	TAAA	2	8	191159	191166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018655	ACTA	2	8	192278	192285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018655	CAAT	2	8	192341	192348	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018655	CAAG	2	8	193065	193072	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_018655	ATAA	2	8	202449	202456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018655	TTAA	2	8	220608	220615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018655	GATT	2	8	220645	220652	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018655	ATTT	2	8	222280	222287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018655	GAAT	2	8	222301	222308	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018655	AATA	2	8	225070	225077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018655	TCAA	2	8	228160	228167	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018655	ATAA	2	8	230375	230382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018655	TTGA	2	8	240758	240765	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018655	ATTT	2	8	241439	241446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018655	AATT	2	8	241763	241770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018655	TCTT	2	8	241875	241882	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018655	ACGA	2	8	247616	247623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018655	CATG	2	8	247649	247656	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018655	TTTG	2	8	249444	249451	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018655	TTTG	2	8	249484	249491	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018655	TTGA	2	8	253855	253862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018655	ATTG	2	8	253926	253933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018655	ATTC	2	8	273136	273143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018655	ATCA	2	8	283189	283196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018655	TCTT	2	8	284877	284884	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018655	GAAA	2	8	286953	286960	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018655	ATTT	2	8	289343	289350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018655	CTTG	2	8	291028	291035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018655	TGTT	2	8	291086	291093	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018655	AATT	2	8	291141	291148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018655	TGTT	2	8	293939	293946	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018655	CTAG	2	8	294115	294122	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018655	TGTT	2	8	294177	294184	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018655	AAAG	2	8	294525	294532	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018655	AAAT	2	8	294766	294773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018655	AGGA	2	8	294793	294800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018655	TTTA	2	8	295849	295856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018655	TGCC	2	8	303030	303037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018655	GAAT	2	8	304534	304541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018655	ATTA	2	8	305520	305527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018655	AAAG	2	8	310496	310503	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018655	TTCA	2	8	310728	310735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018655	TGAT	2	8	311469	311476	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018655	TGAT	2	8	312361	312368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018655	CCAA	2	8	313543	313550	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018655	CAAA	2	8	316186	316193	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018655	TGTA	2	8	318637	318644	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018655	ACTA	2	8	318859	318866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018655	TGTA	2	8	318946	318953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018655	TAAT	2	8	319041	319048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018655	CATT	2	8	322121	322128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018655	TCAA	2	8	322471	322478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018655	TAAT	2	8	323795	323802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018655	CCAA	2	8	324962	324969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018655	CTAT	2	8	325193	325200	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018655	GATT	2	8	333597	333604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018655	GTTG	2	8	333714	333721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018655	AATA	2	8	338975	338982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018655	ATTA	2	8	339071	339078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018655	ATCC	2	8	339170	339177	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018655	ATGA	2	8	343472	343479	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018655	TCAA	2	8	344097	344104	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018655	GAAA	2	8	344114	344121	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018655	CTAT	2	8	344741	344748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018655	TGTT	2	8	344775	344782	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018655	TCCC	2	8	353042	353049	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_018655	CTGT	2	8	356686	356693	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018655	CTTT	2	8	357325	357332	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018655	CTAG	2	8	369773	369780	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018655	AAAC	2	8	373647	373654	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018655	TAAA	2	8	377333	377340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018655	CATG	2	8	397168	397175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018655	ACAA	3	12	397350	397361	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_018655	TCAT	2	8	397395	397402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018655	AAGA	2	8	403008	403015	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018655	ACAA	2	8	403190	403197	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018655	TTAA	2	8	403215	403222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018655	ATTT	2	8	403231	403238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_018655	TCTT	2	8	403663	403670	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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