MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1 chromosome

Total Repeats: 5339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018655	TTA	2	6	1480592	1480597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_018655	CTA	2	6	1480610	1480615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_018655	GT	4	8	1480633	1480640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_018655	ACG	2	6	1480651	1480656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_018655	CAGT	2	8	1480672	1480679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_018655	T	7	7	1480679	1480685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_018655	TGAA	2	8	1481676	1481683	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_018655	TAA	2	6	1481691	1481696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_018655	T	6	6	1481699	1481704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_018655	AATTA	2	10	1481705	1481714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_018655	ATT	2	6	1481718	1481723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_018655	AGT	2	6	1483026	1483031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_018655	ATT	2	6	1483044	1483049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_018655	ATTT	2	8	1484872	1484879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_018655	T	8	8	1486648	1486655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_018655	A	6	6	1486656	1486661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_018655	TTTA	2	8	1486675	1486682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_018655	TTA	2	6	1486720	1486725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_018655	AGT	2	6	1487577	1487582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_018655	TTC	2	6	1487614	1487619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_018655	TTA	2	6	1489120	1489125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_018655	GAT	2	6	1489182	1489187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_018655	TTAA	2	8	1494425	1494432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_018655	TAA	2	6	1494441	1494446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_018655	TAA	2	6	1494460	1494465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_018655	TAAT	2	8	1494489	1494496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_018655	AT	3	6	1496993	1496998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_018655	AT	3	6	1497960	1497965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_018655	TGT	3	9	1498473	1498481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_018655	ATC	2	6	1498886	1498891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_018655	CAA	2	6	1498948	1498953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_018655	T	6	6	1498955	1498960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_018655	TCT	2	6	1498965	1498970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_018655	A	8	8	1505567	1505574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_018655	T	6	6	1505607	1505612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5038	NC_018655	T	7	7	1505727	1505733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_018655	TGATA	2	10	1505756	1505765	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_018655	ATA	2	6	1506616	1506621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_018655	AGA	2	6	1506625	1506630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_018655	TTTA	2	8	1508230	1508237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_018655	A	6	6	1508262	1508267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_018655	ATT	2	6	1508272	1508277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5051	NC_018655	ATTA	3	12	1514766	1514777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5056	NC_018655	A	7	7	1517628	1517634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_018655	TAA	2	6	1517652	1517657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_018655	TAC	2	6	1517667	1517672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5060	NC_018655	AATAT	2	10	1517714	1517723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_018655	AT	3	6	1521346	1521351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_018655	TAA	2	6	1521373	1521378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_018655	GAT	2	6	1521433	1521438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5065	NC_018655	TAATT	2	10	1523873	1523882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_018655	A	7	7	1527696	1527702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5079	NC_018655	A	6	6	1534500	1534505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_018655	TAAAAA	2	12	1534534	1534545	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_018655	A	7	7	1534541	1534547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_018655	AAAG	2	8	1534615	1534622	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5092	NC_018655	A	7	7	1535219	1535225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_018655	ACCA	2	8	1535254	1535261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5097	NC_018655	CAGT	2	8	1537361	1537368	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5098	NC_018655	TTTA	2	8	1537380	1537387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_018655	T	6	6	1539497	1539502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_018655	GA	4	8	1540038	1540045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_018655	CCG	2	6	1540062	1540067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5104	NC_018655	AAAG	2	8	1540149	1540156	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_018655	AGA	2	6	1540168	1540173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_018655	T	8	8	1540912	1540919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5110	NC_018655	AGATT	2	10	1541638	1541647	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_018655	T	6	6	1541661	1541666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_018655	A	6	6	1541685	1541690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5122	NC_018655	ATA	2	6	1542522	1542527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_018655	A	7	7	1542537	1542543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_018655	TA	3	6	1542807	1542812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_018655	T	6	6	1542860	1542865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_018655	A	6	6	1542873	1542878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_018655	ATA	2	6	1542998	1543003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_018655	TACA	2	8	1544557	1544564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_018655	A	7	7	1544574	1544580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_018655	CAT	2	6	1544679	1544684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_018655	GA	3	6	1544725	1544730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_018655	AAT	2	6	1545242	1545247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5134	NC_018655	T	6	6	1545324	1545329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5263	NC_018655	TAA	2	6	1610589	1610594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5266	NC_018655	A	8	8	1611590	1611597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5322	NC_018655	A	7	7	1629072	1629078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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