MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci MN plasmid pcpMN

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018636	GGT	2	6	6	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018636	GGT	2	6	28	33	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018636	TA	3	6	1078	1083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018636	GAT	2	6	1090	1095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018636	T	6	6	1113	1118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018636	ATT	2	6	1127	1132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018636	AAT	2	6	2201	2206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018636	AGA	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018636	AGC	2	6	3803	3808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018636	CAA	2	6	3829	3834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018636	TTAT	2	8	3860	3867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018636	A	7	7	3953	3959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018636	AAG	2	6	3997	4002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018636	GAA	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018636	TC	3	6	4114	4119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018636	GAA	2	6	4183	4188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018636	A	6	6	4210	4215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018636	TCA	2	6	4226	4231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018636	TAG	2	6	4250	4255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018636	A	8	8	4380	4387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018636	AAATAG	2	12	4421	4432	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018636	AT	3	6	4470	4475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018636	A	7	7	4492	4498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018636	AAAC	2	8	4551	4558	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018636	A	6	6	4588	4593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018636	TATTT	2	10	4598	4607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018636	CAA	2	6	4634	4639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018636	CAA	2	6	4658	4663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018636	TTG	2	6	4675	4680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018636	A	8	8	4687	4694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018636	TTAAA	2	10	4695	4704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018636	TTAA	2	8	5540	5547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018636	AT	3	6	5548	5553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018636	T	8	8	5566	5573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018636	A	6	6	5587	5592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018636	GA	3	6	5611	5616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018636	GGT	2	6	5988	5993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018636	AAC	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018636	GTA	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018636	A	7	7	6050	6056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018636	GAT	2	6	6120	6125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018636	AGA	2	6	6165	6170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018636	CATA	2	8	6173	6180	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018636	AGA	2	6	6227	6232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018636	ATG	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018636	CCT	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_018636	AAG	2	6	6358	6363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018636	TG	3	6	6389	6394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018636	CAA	2	6	6451	6456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018636	GAAA	2	8	6503	6510	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018636	CAA	2	6	6513	6518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018636	CAG	2	6	6598	6603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018636	TTA	2	6	6608	6613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018636	ATC	2	6	6619	6624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018636	TAA	2	6	6627	6632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018636	AGC	2	6	6652	6657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018636	TGA	2	6	6706	6711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018636	CAG	2	6	7481	7486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.